MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 2605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	406591805
2	NC_018625	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	406591805
3	NC_018625	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	406591806
4	NC_018625	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	406591806
5	NC_018625	TGTT	2	8	2837	2844	0 %	75 %	25 %	0 %	406591807
6	NC_018625	GAAG	2	8	2948	2955	50 %	0 %	50 %	0 %	406591807
7	NC_018625	AGTA	2	8	2978	2985	50 %	25 %	25 %	0 %	406591807
8	NC_018625	TTTG	2	8	3296	3303	0 %	75 %	25 %	0 %	406591808
9	NC_018625	TCCT	2	8	3322	3329	0 %	50 %	0 %	50 %	406591808
10	NC_018625	GAAA	2	8	5252	5259	75 %	0 %	25 %	0 %	406591809
11	NC_018625	CGAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	406591810
12	NC_018625	TAAT	2	8	6729	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	406591811
13	NC_018625	AGAA	2	8	6961	6968	75 %	0 %	25 %	0 %	406591812
14	NC_018625	TCCC	2	8	7278	7285	0 %	25 %	0 %	75 %	406591812
15	NC_018625	GTAG	2	8	7312	7319	25 %	25 %	50 %	0 %	406591812
16	NC_018625	AATA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	406591813
17	NC_018625	ATGA	2	8	8480	8487	50 %	25 %	25 %	0 %	406591813
18	NC_018625	ATTT	2	8	9399	9406	25 %	75 %	0 %	0 %	406591814
19	NC_018625	AAAG	2	8	10223	10230	75 %	0 %	25 %	0 %	406591814
20	NC_018625	AAGT	2	8	10522	10529	50 %	25 %	25 %	0 %	406591814
21	NC_018625	AGGG	2	8	10761	10768	25 %	0 %	75 %	0 %	406591814
22	NC_018625	TAAG	2	8	10771	10778	50 %	25 %	25 %	0 %	406591814
23	NC_018625	AAAG	2	8	11064	11071	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
24	NC_018625	AGTA	2	8	11722	11729	50 %	25 %	25 %	0 %	406591815
25	NC_018625	TCTT	2	8	12003	12010	0 %	75 %	0 %	25 %	406591815
26	NC_018625	TAAT	2	8	12144	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	406591815
27	NC_018625	CAAA	2	8	12455	12462	75 %	0 %	0 %	25 %	406591815
28	NC_018625	AGAT	2	8	12565	12572	50 %	25 %	25 %	0 %	406591815
29	NC_018625	AAGA	2	8	12576	12583	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
30	NC_018625	ACTT	2	8	12698	12705	25 %	50 %	0 %	25 %	406591815
31	NC_018625	CACT	2	8	12795	12802	25 %	25 %	0 %	50 %	406591815
32	NC_018625	GCAA	2	8	13323	13330	50 %	0 %	25 %	25 %	406591815
33	NC_018625	GAAA	2	8	13743	13750	75 %	0 %	25 %	0 %	406591815
34	NC_018625	AGAT	2	8	14312	14319	50 %	25 %	25 %	0 %	406591816
35	NC_018625	TTGT	2	8	14362	14369	0 %	75 %	25 %	0 %	406591816
36	NC_018625	TTGG	2	8	14817	14824	0 %	50 %	50 %	0 %	406591816
37	NC_018625	GGAT	2	8	14946	14953	25 %	25 %	50 %	0 %	406591816
38	NC_018625	CCCA	2	8	15417	15424	25 %	0 %	0 %	75 %	406591816
39	NC_018625	AGAA	2	8	17161	17168	75 %	0 %	25 %	0 %	406591818
40	NC_018625	TCTT	2	8	17431	17438	0 %	75 %	0 %	25 %	406591818
41	NC_018625	GTCA	2	8	17834	17841	25 %	25 %	25 %	25 %	406591819
42	NC_018625	AAGC	2	8	18225	18232	50 %	0 %	25 %	25 %	406591819
43	NC_018625	ATTA	2	8	18365	18372	50 %	50 %	0 %	0 %	406591819
44	NC_018625	ATTA	2	8	18987	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	406591821
45	NC_018625	GTTT	2	8	19260	19267	0 %	75 %	25 %	0 %	406591821
46	NC_018625	TTTG	2	8	19500	19507	0 %	75 %	25 %	0 %	406591821
47	NC_018625	TGCC	2	8	19532	19539	0 %	25 %	25 %	50 %	406591821
48	NC_018625	GCGT	2	8	19664	19671	0 %	25 %	50 %	25 %	406591821
49	NC_018625	TGGT	2	8	20445	20452	0 %	50 %	50 %	0 %	406591822
50	NC_018625	TAAA	2	8	21085	21092	75 %	25 %	0 %	0 %	406591822
51	NC_018625	TATG	2	8	21584	21591	25 %	50 %	25 %	0 %	406591822
52	NC_018625	CAAT	2	8	22279	22286	50 %	25 %	0 %	25 %	406591823
53	NC_018625	AGAA	2	8	22696	22703	75 %	0 %	25 %	0 %	406591823
54	NC_018625	TGAT	2	8	22903	22910	25 %	50 %	25 %	0 %	406591823
55	NC_018625	AGCT	2	8	24164	24171	25 %	25 %	25 %	25 %	406591824
56	NC_018625	AAAT	2	8	24501	24508	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
57	NC_018625	AATT	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	406591824
58	NC_018625	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
59	NC_018625	TAGT	2	8	24982	24989	25 %	50 %	25 %	0 %	406591824
60	NC_018625	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	406591824
61	NC_018625	ATTC	2	8	25880	25887	25 %	50 %	0 %	25 %	406591824
62	NC_018625	TTTC	2	8	26012	26019	0 %	75 %	0 %	25 %	406591824
63	NC_018625	ATAG	2	8	26107	26114	50 %	25 %	25 %	0 %	406591824
64	NC_018625	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
65	NC_018625	ACTT	2	8	27128	27135	25 %	50 %	0 %	25 %	406591825
66	NC_018625	ATCA	2	8	27658	27665	50 %	25 %	0 %	25 %	406591825
67	NC_018625	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	406591825
68	NC_018625	GAAA	2	8	28152	28159	75 %	0 %	25 %	0 %	406591825
69	NC_018625	AAAT	2	8	28806	28813	75 %	25 %	0 %	0 %	406591825
70	NC_018625	AGGG	2	8	29429	29436	25 %	0 %	75 %	0 %	406591826
71	NC_018625	GAAT	2	8	29623	29630	50 %	25 %	25 %	0 %	406591827
72	NC_018625	ACCA	2	8	30238	30245	50 %	0 %	0 %	50 %	406591827
73	NC_018625	AACG	2	8	30845	30852	50 %	0 %	25 %	25 %	406591829
74	NC_018625	GTTT	2	8	31409	31416	0 %	75 %	25 %	0 %	406591829
75	NC_018625	ATTT	2	8	32432	32439	25 %	75 %	0 %	0 %	406591831
76	NC_018625	TTGT	2	8	32458	32465	0 %	75 %	25 %	0 %	406591831
77	NC_018625	TAGA	2	8	32664	32671	50 %	25 %	25 %	0 %	406591831
78	NC_018625	TTTA	2	8	33118	33125	25 %	75 %	0 %	0 %	406591831
79	NC_018625	TTAG	2	8	33605	33612	25 %	50 %	25 %	0 %	406591832
80	NC_018625	TGAA	2	8	34009	34016	50 %	25 %	25 %	0 %	406591833
81	NC_018625	GTAC	2	8	34087	34094	25 %	25 %	25 %	25 %	406591833
82	NC_018625	GATA	2	8	34123	34130	50 %	25 %	25 %	0 %	406591833
83	NC_018625	TCTT	2	8	34383	34390	0 %	75 %	0 %	25 %	406591834
84	NC_018625	AGGA	2	8	35335	35342	50 %	0 %	50 %	0 %	406591834
85	NC_018625	TAAT	2	8	36123	36130	50 %	50 %	0 %	0 %	406591835
86	NC_018625	AAAG	2	8	38193	38200	75 %	0 %	25 %	0 %	406591838
87	NC_018625	TAAT	2	8	38209	38216	50 %	50 %	0 %	0 %	406591838
88	NC_018625	TCAA	2	8	38345	38352	50 %	25 %	0 %	25 %	406591838
89	NC_018625	TTTA	2	8	38678	38685	25 %	75 %	0 %	0 %	406591838
90	NC_018625	CTTT	2	8	38808	38815	0 %	75 %	0 %	25 %	406591838
91	NC_018625	CCTG	2	8	40294	40301	0 %	25 %	25 %	50 %	406591842
92	NC_018625	GAAA	2	8	41235	41242	75 %	0 %	25 %	0 %	406591842
93	NC_018625	AGCA	2	8	41406	41413	50 %	0 %	25 %	25 %	406591842
94	NC_018625	CTGT	2	8	41874	41881	0 %	50 %	25 %	25 %	406591842
95	NC_018625	TCTT	2	8	41914	41921	0 %	75 %	0 %	25 %	406591842
96	NC_018625	GAAG	2	8	42325	42332	50 %	0 %	50 %	0 %	406591842
97	NC_018625	AATA	2	8	42356	42363	75 %	25 %	0 %	0 %	406591842
98	NC_018625	GAAA	2	8	43493	43500	75 %	0 %	25 %	0 %	406591846
99	NC_018625	TAAT	2	8	43819	43826	50 %	50 %	0 %	0 %	406591846
100	NC_018625	TTAA	2	8	44221	44228	50 %	50 %	0 %	0 %	406591847
101	NC_018625	ATCA	2	8	44810	44817	50 %	25 %	0 %	25 %	406591847
102	NC_018625	ATGA	2	8	45088	45095	50 %	25 %	25 %	0 %	406591847
103	NC_018625	TAAA	2	8	45988	45995	75 %	25 %	0 %	0 %	406591849
104	NC_018625	GAAA	2	8	46970	46977	75 %	0 %	25 %	0 %	406591850
105	NC_018625	TCTT	2	8	47076	47083	0 %	75 %	0 %	25 %	406591850
106	NC_018625	GCTT	2	8	47605	47612	0 %	50 %	25 %	25 %	406591850
107	NC_018625	TGTT	2	8	48457	48464	0 %	75 %	25 %	0 %	406591851
108	NC_018625	TAAA	2	8	49694	49701	75 %	25 %	0 %	0 %	406591852
109	NC_018625	AAGC	2	8	49723	49730	50 %	0 %	25 %	25 %	406591852
110	NC_018625	CCAA	2	8	49747	49754	50 %	0 %	0 %	50 %	406591852
111	NC_018625	TTCC	2	8	49894	49901	0 %	50 %	0 %	50 %	406591852
112	NC_018625	AACA	2	8	50871	50878	75 %	0 %	0 %	25 %	406591852
113	NC_018625	GAAG	2	8	52718	52725	50 %	0 %	50 %	0 %	406591853
114	NC_018625	ATCC	2	8	53024	53031	25 %	25 %	0 %	50 %	406591854
115	NC_018625	AGCA	2	8	53316	53323	50 %	0 %	25 %	25 %	406591854
116	NC_018625	TTCA	2	8	53476	53483	25 %	50 %	0 %	25 %	406591854
117	NC_018625	GTAT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	25 %	0 %	406591855
118	NC_018625	CATA	2	8	54324	54331	50 %	25 %	0 %	25 %	406591855
119	NC_018625	TAGC	2	8	55855	55862	25 %	25 %	25 %	25 %	406591857
120	NC_018625	CTGT	2	8	56034	56041	0 %	50 %	25 %	25 %	406591857
121	NC_018625	CTTT	2	8	56424	56431	0 %	75 %	0 %	25 %	406591858
122	NC_018625	AGAA	2	8	56444	56451	75 %	0 %	25 %	0 %	406591858
123	NC_018625	GAAG	2	8	56613	56620	50 %	0 %	50 %	0 %	406591858
124	NC_018625	GTAA	2	8	56836	56843	50 %	25 %	25 %	0 %	406591858
125	NC_018625	TTAG	2	8	56959	56966	25 %	50 %	25 %	0 %	406591858
126	NC_018625	CTTT	2	8	57309	57316	0 %	75 %	0 %	25 %	406591859
127	NC_018625	GTTA	2	8	57466	57473	25 %	50 %	25 %	0 %	406591859
128	NC_018625	AGCT	2	8	58624	58631	25 %	25 %	25 %	25 %	406591860
129	NC_018625	CCAA	2	8	58899	58906	50 %	0 %	0 %	50 %	406591860
130	NC_018625	CGTA	2	8	60459	60466	25 %	25 %	25 %	25 %	406591861
131	NC_018625	CCGT	2	8	60516	60523	0 %	25 %	25 %	50 %	406591861
132	NC_018625	GTTG	2	8	61159	61166	0 %	50 %	50 %	0 %	406591861
133	NC_018625	TCTG	2	8	62007	62014	0 %	50 %	25 %	25 %	406591861
134	NC_018625	GCTT	2	8	62653	62660	0 %	50 %	25 %	25 %	406591861
135	NC_018625	AAGA	2	8	63837	63844	75 %	0 %	25 %	0 %	406591862
136	NC_018625	ATGA	2	8	65127	65134	50 %	25 %	25 %	0 %	406591863
137	NC_018625	TGCA	2	8	65413	65420	25 %	25 %	25 %	25 %	406591863
138	NC_018625	GAAA	2	8	65636	65643	75 %	0 %	25 %	0 %	406591863
139	NC_018625	TATC	2	8	66277	66284	25 %	50 %	0 %	25 %	406591864
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