MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 1388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018625	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018625	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018625	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018625	TAT	2	6	3054	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018625	ATT	3	9	3069	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018625	TGT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018625	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018625	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018625	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018625	AGG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018625	CCT	2	6	8764	8769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018625	AAG	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018625	GTT	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018625	AAT	2	6	16847	16852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018625	TTA	2	6	16927	16932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018625	AAT	2	6	17005	17010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018625	TCC	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018625	GTT	2	6	20320	20325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018625	TCC	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018625	TTA	2	6	20336	20341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018625	TCT	2	6	20384	20389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018625	AAT	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018625	TAA	2	6	21720	21725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018625	TAA	2	6	21784	21789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018625	TTC	2	6	23764	23769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018625	AGA	2	6	23899	23904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018625	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018625	TAT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018625	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018625	AGG	2	6	31743	31748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018625	AGA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018625	CTT	2	6	31981	31986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018625	AAT	2	6	32406	32411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018625	TTA	2	6	33427	33432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018625	AAG	2	6	33448	33453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018625	TGT	3	9	33521	33529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018625	AAG	2	6	33566	33571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018625	TGG	2	6	34223	34228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018625	TCT	2	6	36468	36473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018625	AGA	3	9	36545	36553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018625	AAT	2	6	36586	36591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018625	TGA	2	6	36609	36614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018625	GCT	2	6	36782	36787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018625	TCC	2	6	36796	36801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018625	TTC	2	6	37581	37586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018625	TTC	2	6	37622	37627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018625	TGC	2	6	37670	37675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018625	AGA	2	6	37860	37865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018625	TAT	2	6	38095	38100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018625	GAA	2	6	39472	39477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018625	TTA	2	6	42378	42383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018625	GAA	2	6	42400	42405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018625	AGT	2	6	42689	42694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018625	CAA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018625	GTT	2	6	43441	43446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018625	GAC	2	6	44133	44138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018625	ACG	2	6	44168	44173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018625	GTC	2	6	44209	44214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018625	GAA	2	6	49505	49510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018625	GAT	2	6	52224	52229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018625	TCG	2	6	52291	52296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018625	TTG	2	6	52306	52311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018625	GTC	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018625	AAG	2	6	52510	52515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018625	AAT	2	6	54526	54531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018625	TGG	2	6	57857	57862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018625	GAT	2	6	57957	57962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018625	TAA	2	6	57967	57972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018625	GGT	2	6	58086	58091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018625	GGC	2	6	59444	59449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018625	GAG	2	6	59503	59508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018625	ATT	2	6	59552	59557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018625	TTA	2	6	59579	59584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018625	TAA	2	6	59653	59658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018625	AGA	2	6	59729	59734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018625	CTA	2	6	59968	59973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018625	CAA	2	6	63292	63297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018625	TTG	2	6	64373	64378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018625	GAA	2	6	64400	64405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018625	TCC	2	6	64485	64490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018625	AAT	2	6	64631	64636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018625	ATA	2	6	71232	71237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018625	TTA	3	9	74084	74092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018625	ATC	2	6	76081	76086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018625	TCA	2	6	77406	77411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018625	TTC	2	6	77483	77488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018625	TAT	2	6	77515	77520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018625	TAT	2	6	77774	77779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018625	AGA	2	6	80491	80496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018625	AAT	2	6	80587	80592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018625	TTA	2	6	83421	83426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018625	AAT	2	6	83428	83433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018625	AGT	2	6	83441	83446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018625	GTT	2	6	87379	87384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018625	AGA	2	6	93511	93516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018625	AAG	2	6	93548	93553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018625	TAA	2	6	93555	93560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018625	AAT	2	6	93634	93639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018625	TTG	2	6	93672	93677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018625	GGT	2	6	93681	93686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018625	GTT	2	6	93951	93956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018625	AAG	2	6	98664	98669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018625	TCT	2	6	98935	98940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018625	GCT	2	6	99209	99214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018625	ACA	2	6	99265	99270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018625	ATG	2	6	99367	99372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018625	ATA	2	6	99420	99425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018625	GTT	2	6	99453	99458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018625	ACT	2	6	99525	99530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018625	ATC	2	6	99547	99552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018625	TAG	2	6	99581	99586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018625	TTC	2	6	99686	99691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018625	ACT	2	6	101724	101729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018625	CAA	2	6	101774	101779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018625	TCT	2	6	108308	108313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018625	AAC	2	6	108428	108433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018625	AGA	2	6	109127	109132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018625	GAA	2	6	110178	110183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018625	ATT	2	6	112369	112374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018625	TAC	2	6	118329	118334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018625	GAG	2	6	119150	119155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018625	ACT	2	6	120751	120756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018625	TAA	2	6	122259	122264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018625	AGT	2	6	122277	122282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018625	ATC	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018625	ATT	2	6	122299	122304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018625	GAA	2	6	122317	122322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018625	GAA	2	6	122329	122334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018625	TCT	2	6	122636	122641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018625	AGT	2	6	122665	122670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018625	AAT	2	6	122762	122767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018625	ATT	2	6	122782	122787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018625	TGG	2	6	122795	122800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018625	GCG	2	6	123120	123125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018625	TTC	3	9	123183	123191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018625	TCC	2	6	125284	125289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018625	TAC	2	6	125296	125301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018625	TGT	2	6	125303	125308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018625	AAT	2	6	125759	125764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_018625	CAT	2	6	213239	213244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_018625	GCA	2	6	239951	239956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_018625	TAC	2	6	329195	329200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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