MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 14329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
2	NC_018625	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591805
3	NC_018625	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
4	NC_018625	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
5	NC_018625	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591805
6	NC_018625	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591805
7	NC_018625	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591805
8	NC_018625	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591805
9	NC_018625	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
10	NC_018625	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591805
11	NC_018625	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
12	NC_018625	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591805
13	NC_018625	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
14	NC_018625	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591805
15	NC_018625	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591805
16	NC_018625	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
17	NC_018625	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
18	NC_018625	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591806
19	NC_018625	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
20	NC_018625	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591806
21	NC_018625	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
22	NC_018625	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
23	NC_018625	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591806
24	NC_018625	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
25	NC_018625	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591806
26	NC_018625	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
27	NC_018625	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591806
28	NC_018625	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
29	NC_018625	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
30	NC_018625	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591806
31	NC_018625	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
32	NC_018625	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591806
33	NC_018625	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591806
34	NC_018625	AGT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591807
35	NC_018625	TTA	2	6	2652	2657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
36	NC_018625	TCC	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591807
37	NC_018625	TTC	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591807
38	NC_018625	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
39	NC_018625	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591807
40	NC_018625	TAT	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
41	NC_018625	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
42	NC_018625	GAA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591808
43	NC_018625	ATG	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591808
44	NC_018625	AGT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591808
45	NC_018625	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591808
46	NC_018625	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591808
47	NC_018625	ATC	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591809
48	NC_018625	TGG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591809
49	NC_018625	AAG	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
50	NC_018625	AGA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
51	NC_018625	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591809
52	NC_018625	GAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
53	NC_018625	AGC	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591809
54	NC_018625	TAA	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591809
55	NC_018625	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
56	NC_018625	CTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591809
57	NC_018625	ATG	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591809
58	NC_018625	GAT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591809
59	NC_018625	GCT	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591809
60	NC_018625	GAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
61	NC_018625	AAG	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
62	NC_018625	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591809
63	NC_018625	AAG	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
64	NC_018625	AGA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
65	NC_018625	TTA	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591809
66	NC_018625	CAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591809
67	NC_018625	AGA	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591810
68	NC_018625	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591810
69	NC_018625	TAT	2	6	5618	5623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591810
70	NC_018625	GTT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
71	NC_018625	CAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
72	NC_018625	GAT	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
73	NC_018625	TGT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
74	NC_018625	GGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591810
75	NC_018625	CAA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
76	NC_018625	TGA	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
77	NC_018625	GAT	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
78	NC_018625	TGT	3	9	5980	5988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
79	NC_018625	TGA	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
80	NC_018625	TGC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591810
81	NC_018625	TGC	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591810
82	NC_018625	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
83	NC_018625	GAA	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591810
84	NC_018625	GAG	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591810
85	NC_018625	TTC	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591810
86	NC_018625	CCT	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591810
87	NC_018625	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591810
88	NC_018625	GTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
89	NC_018625	ACA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
90	NC_018625	ATA	2	6	6587	6592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591810
91	NC_018625	CAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
92	NC_018625	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591812
93	NC_018625	CAT	2	6	6913	6918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591812
94	NC_018625	ACA	2	6	6931	6936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591812
95	NC_018625	GTG	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591812
96	NC_018625	TGT	2	6	7010	7015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591812
97	NC_018625	TTC	2	6	7101	7106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591812
98	NC_018625	GTT	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591812
99	NC_018625	CAT	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591812
100	NC_018625	AGA	2	6	7167	7172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591812
101	NC_018625	TAA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591812
102	NC_018625	TTG	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591812
103	NC_018625	CTC	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591812
104	NC_018625	GGA	2	6	7459	7464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591812
105	NC_018625	TGA	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591812
106	NC_018625	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591812
107	NC_018625	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591812
108	NC_018625	TTC	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591812
109	NC_018625	TTG	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591813
110	NC_018625	TGC	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591813
111	NC_018625	AAG	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591813
112	NC_018625	TTA	2	6	8250	8255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591813
113	NC_018625	CTT	2	6	8269	8274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591813
114	NC_018625	GAA	2	6	8340	8345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591813
115	NC_018625	TTC	2	6	8375	8380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591813
116	NC_018625	TTC	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591813
117	NC_018625	GAA	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591814
118	NC_018625	CAT	2	6	8934	8939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591814
119	NC_018625	TTC	2	6	9019	9024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591814
120	NC_018625	GAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591814
121	NC_018625	GAG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591814
122	NC_018625	AGT	2	6	9246	9251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591814
123	NC_018625	TTA	2	6	9438	9443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591814
124	NC_018625	AGA	2	6	9687	9692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591814
125	NC_018625	GTT	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591814
126	NC_018625	CTT	2	6	9972	9977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591814
127	NC_018625	GCA	2	6	9993	9998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591814
128	NC_018625	CCA	2	6	10036	10041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591814
129	NC_018625	ATG	2	6	10134	10139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591814
130	NC_018625	TCT	2	6	10142	10147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591814
131	NC_018625	GAA	2	6	10250	10255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591814
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253	NC_018625	GAG	3	9	20599	20607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591822
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257	NC_018625	GTA	2	6	20917	20922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591822
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500	NC_018625	TTC	2	6	40387	40392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591842

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