MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018625	GT	3	6	8684	8689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018625	AG	3	6	17694	17699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018625	TC	3	6	31849	31854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018625	TC	3	6	37732	37737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018625	TA	3	6	52208	52213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018625	TG	3	6	63301	63306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018625	AT	3	6	94009	94014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018625	GA	3	6	97066	97071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018625	GA	3	6	98974	98979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018625	AG	3	6	101785	101790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018625	AG	3	6	112358	112363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018625	AT	3	6	123205	123210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018625	TA	4	8	125319	125326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018625	TG	4	8	128422	128429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018625	AC	3	6	128556	128561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018625	AT	3	6	130233	130238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018625	TA	3	6	130516	130521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018625	CT	3	6	130612	130617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018625	CT	3	6	130744	130749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018625	AT	3	6	131633	131638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018625	GA	3	6	134356	134361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018625	CA	3	6	147141	147146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018625	AT	3	6	147206	147211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018625	GT	3	6	148821	148826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018625	GT	3	6	148845	148850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018625	AG	3	6	158078	158083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018625	TA	3	6	173169	173174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018625	AG	3	6	173213	173218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018625	AT	3	6	175407	175412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018625	AG	3	6	179475	179480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018625	CT	3	6	193714	193719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018625	AC	3	6	199236	199241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018625	AT	3	6	210359	210364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018625	AT	3	6	213243	213248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018625	AT	3	6	215435	215440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018625	GA	3	6	215495	215500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018625	GT	3	6	215535	215540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018625	CT	3	6	215572	215577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018625	AG	3	6	215801	215806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018625	TC	3	6	215860	215865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018625	AG	3	6	222919	222924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018625	TA	4	8	232254	232261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018625	AG	3	6	236999	237004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018625	AT	3	6	237069	237074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018625	GA	3	6	239888	239893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018625	AG	3	6	241098	241103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018625	AG	3	6	244064	244069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018625	GT	3	6	261608	261613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018625	TC	3	6	266718	266723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018625	AT	4	8	266756	266763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018625	TC	3	6	267860	267865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018625	TG	3	6	268005	268010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018625	TG	3	6	276788	276793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018625	GT	3	6	277630	277635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018625	TC	3	6	281932	281937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018625	TA	3	6	281981	281986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018625	TC	3	6	301467	301472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018625	AC	3	6	310562	310567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018625	AG	3	6	313545	313550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018625	GA	3	6	313595	313600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018625	AC	3	6	319100	319105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018625	CT	3	6	322864	322869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018625	TG	3	6	323367	323372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018625	AT	3	6	329540	329545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018625	TG	3	6	329787	329792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018625	GA	3	6	329833	329838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018625	TA	3	6	332625	332630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018625	AG	3	6	332772	332777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018625	TC	3	6	342246	342251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018625	TA	3	6	344239	344244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018625	AC	3	6	344289	344294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018625	TA	3	6	345240	345245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018625	TG	3	6	347548	347553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018625	GT	3	6	347678	347683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018625	TG	3	6	349205	349210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018625	CT	3	6	350756	350761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018625	TA	3	6	350829	350834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018625	TA	3	6	352239	352244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018625	TA	3	6	356406	356411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018625	CT	4	8	359022	359029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018625	AT	3	6	367703	367708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018625	TA	3	6	370343	370348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018625	AG	3	6	371349	371354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018625	AT	3	6	374743	374748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018625	TG	3	6	374992	374997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018625	CT	3	6	376321	376326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018625	TA	3	6	386865	386870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018625	AC	3	6	390921	390926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018625	TA	3	6	401465	401470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018625	CT	3	6	413537	413542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018625	TC	3	6	421526	421531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018625	AT	3	6	425408	425413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018625	GA	3	6	429740	429745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018625	TA	3	6	440132	440137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018625	GA	3	6	440469	440474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018625	TC	3	6	445002	445007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018625	AG	3	6	446971	446976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018625	CT	3	6	447042	447047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018625	TA	3	6	448159	448164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018625	CT	3	6	449442	449447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018625	TC	3	6	455072	455077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018625	AT	3	6	455486	455491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018625	TG	3	6	460396	460401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018625	AG	3	6	460545	460550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018625	CT	4	8	463425	463432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018625	TA	3	6	466779	466784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018625	AG	3	6	470254	470259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018625	AG	3	6	476825	476830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018625	TA	3	6	478140	478145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018625	AC	3	6	479600	479605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018625	AG	3	6	481017	481022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018625	TA	3	6	481097	481102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018625	CT	3	6	487510	487515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018625	AG	4	8	489498	489505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018625	TC	3	6	491080	491085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018625	TA	3	6	493843	493848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018625	AT	3	6	499184	499189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018625	GA	3	6	504360	504365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018625	TC	3	6	505811	505816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018625	AT	3	6	513551	513556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018625	AT	3	6	513589	513594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018625	AG	3	6	520274	520279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018625	GT	3	6	529288	529293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018625	GA	3	6	536453	536458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018625	CT	4	8	545548	545555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018625	AT	3	6	556616	556621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018625	TG	3	6	560849	560854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018625	GT	3	6	564572	564577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018625	GA	3	6	589821	589826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018625	TG	3	6	589927	589932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018625	AG	3	6	590279	590284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018625	AC	3	6	600734	600739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018625	GT	3	6	600754	600759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018625	AG	3	6	600865	600870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018625	TC	3	6	601049	601054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018625	AT	3	6	603705	603710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018625	TA	4	8	603849	603856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018625	GA	5	10	620940	620949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018625	CT	3	6	620985	620990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018625	CT	3	6	622369	622374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018625	AC	3	6	627343	627348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018625	TA	3	6	629137	629142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018625	AT	3	6	629157	629162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018625	AG	3	6	630048	630053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018625	CT	3	6	631490	631495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018625	TG	3	6	634055	634060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018625	GA	3	6	644844	644849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018625	TA	3	6	645233	645238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018625	TA	3	6	645243	645248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018625	TA	3	6	645343	645348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018625	AT	3	6	646497	646502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018625	TC	3	6	649297	649302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.