MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	407460167
2	NC_018624	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407460167
3	NC_018624	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	407460169
4	NC_018624	AACAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	407460170
5	NC_018624	AAGAA	2	10	9569	9578	80 %	0 %	20 %	0 %	407460172
6	NC_018624	ATAAA	2	10	13044	13053	80 %	20 %	0 %	0 %	407460173
7	NC_018624	AACTC	2	10	13488	13497	40 %	20 %	0 %	40 %	407460173
8	NC_018624	GTTTT	2	10	13558	13567	0 %	80 %	20 %	0 %	407460173
9	NC_018624	GAAAC	2	10	14326	14335	60 %	0 %	20 %	20 %	407460174
10	NC_018624	AACAA	2	10	15355	15364	80 %	0 %	0 %	20 %	407460174
11	NC_018624	AATAG	2	10	17067	17076	60 %	20 %	20 %	0 %	407460176
12	NC_018624	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	407460180
13	NC_018624	GCCAC	2	10	29445	29454	20 %	0 %	20 %	60 %	407460186
14	NC_018624	AAGGA	2	10	38577	38586	60 %	0 %	40 %	0 %	407460196
15	NC_018624	CCATA	2	10	38784	38793	40 %	20 %	0 %	40 %	407460196
16	NC_018624	CTTTA	2	10	38950	38959	20 %	60 %	0 %	20 %	407460196
17	NC_018624	CTTTC	2	10	43213	43222	0 %	60 %	0 %	40 %	407460202
18	NC_018624	ACAAA	2	10	43875	43884	80 %	0 %	0 %	20 %	407460203
19	NC_018624	TATGG	2	10	44285	44294	20 %	40 %	40 %	0 %	407460204
20	NC_018624	TCTTT	2	10	46093	46102	0 %	80 %	0 %	20 %	407460206
21	NC_018624	AGCCC	2	10	47090	47099	20 %	0 %	20 %	60 %	407460207
22	NC_018624	TCAAA	2	10	47445	47454	60 %	20 %	0 %	20 %	407460207
23	NC_018624	TCTAT	2	10	49564	49573	20 %	60 %	0 %	20 %	407460209
24	NC_018624	TTTGG	2	10	51478	51487	0 %	60 %	40 %	0 %	407460209
25	NC_018624	TTTTC	2	10	55347	55356	0 %	80 %	0 %	20 %	407460213
26	NC_018624	GTAAG	2	10	57395	57404	40 %	20 %	40 %	0 %	407460216
27	NC_018624	AAAAT	2	10	60200	60209	80 %	20 %	0 %	0 %	407460218
28	NC_018624	GTTAT	2	10	61233	61242	20 %	60 %	20 %	0 %	407460218
29	NC_018624	TAGTT	2	10	62802	62811	20 %	60 %	20 %	0 %	407460218
30	NC_018624	GAATG	2	10	62818	62827	40 %	20 %	40 %	0 %	407460218
31	NC_018624	TCCTA	2	10	64867	64876	20 %	40 %	0 %	40 %	407460220
32	NC_018624	AGAAA	2	10	70123	70132	80 %	0 %	20 %	0 %	407460224
33	NC_018624	ATAGC	2	10	74370	74379	40 %	20 %	20 %	20 %	407460230
34	NC_018624	GCACA	2	10	77203	77212	40 %	0 %	20 %	40 %	407460232
35	NC_018624	AAAGA	2	10	78156	78165	80 %	0 %	20 %	0 %	407460233
36	NC_018624	AGTTC	2	10	79161	79170	20 %	40 %	20 %	20 %	407460233
37	NC_018624	CGTAT	2	10	81530	81539	20 %	40 %	20 %	20 %	407460235
38	NC_018624	GAAAA	2	10	82740	82749	80 %	0 %	20 %	0 %	407460236
39	NC_018624	AGGAA	2	10	84739	84748	60 %	0 %	40 %	0 %	407460239
40	NC_018624	CTTTT	2	10	85627	85636	0 %	80 %	0 %	20 %	407460241
41	NC_018624	CAAAG	2	10	87098	87107	60 %	0 %	20 %	20 %	407460243
42	NC_018624	AACAA	2	10	87265	87274	80 %	0 %	0 %	20 %	407460243
43	NC_018624	AAAGA	2	10	89171	89180	80 %	0 %	20 %	0 %	407460245
44	NC_018624	TTTTC	2	10	90186	90195	0 %	80 %	0 %	20 %	407460245
45	NC_018624	AGGAT	2	10	90709	90718	40 %	20 %	40 %	0 %	407460245
46	NC_018624	ATAAC	2	10	90795	90804	60 %	20 %	0 %	20 %	407460245
47	NC_018624	TGGCA	2	10	93280	93289	20 %	20 %	40 %	20 %	407460246
48	NC_018624	TGTTT	2	10	95005	95014	0 %	80 %	20 %	0 %	407460248
49	NC_018624	TCACC	2	10	96579	96588	20 %	20 %	0 %	60 %	407460249
50	NC_018624	AAAAT	2	10	96714	96723	80 %	20 %	0 %	0 %	407460249
51	NC_018624	TTAAT	2	10	97758	97767	40 %	60 %	0 %	0 %	407460250
52	NC_018624	ATTAC	2	10	102889	102898	40 %	40 %	0 %	20 %	407460258
53	NC_018624	CTACA	2	10	103263	103272	40 %	20 %	0 %	40 %	407460258
54	NC_018624	AATTA	2	10	104810	104819	60 %	40 %	0 %	0 %	407460260
55	NC_018624	CTATA	2	10	105800	105809	40 %	40 %	0 %	20 %	407460261
56	NC_018624	AGCTT	2	10	108453	108462	20 %	40 %	20 %	20 %	407460265
57	NC_018624	GTTTG	2	10	108760	108769	0 %	60 %	40 %	0 %	407460265
58	NC_018624	AGTTA	2	10	115565	115574	40 %	40 %	20 %	0 %	407460280
59	NC_018624	AGTTT	2	10	116055	116064	20 %	60 %	20 %	0 %	407460281
60	NC_018624	TTTGC	2	10	116970	116979	0 %	60 %	20 %	20 %	407460283
61	NC_018624	TTTAC	2	10	119167	119176	20 %	60 %	0 %	20 %	407460286
62	NC_018624	AATTA	2	10	122060	122069	60 %	40 %	0 %	0 %	407460289
63	NC_018624	GAGAT	2	10	123412	123421	40 %	20 %	40 %	0 %	407460290
64	NC_018624	GTCAA	2	10	124731	124740	40 %	20 %	20 %	20 %	407460292
65	NC_018624	TAGGG	2	10	127203	127212	20 %	20 %	60 %	0 %	407460295
66	NC_018624	AACTT	2	10	128135	128144	40 %	40 %	0 %	20 %	407460295
67	NC_018624	TGTCA	2	10	132020	132029	20 %	40 %	20 %	20 %	407460298
68	NC_018624	AAAAG	2	10	135426	135435	80 %	0 %	20 %	0 %	407460300
69	NC_018624	TAAAA	2	10	135707	135716	80 %	20 %	0 %	0 %	407460300
70	NC_018624	GATTT	2	10	137966	137975	20 %	60 %	20 %	0 %	407460302
71	NC_018624	TTGTT	2	10	138308	138317	0 %	80 %	20 %	0 %	407460302
72	NC_018624	AAGAA	2	10	138789	138798	80 %	0 %	20 %	0 %	407460302
73	NC_018624	TTCTT	2	10	139382	139391	0 %	80 %	0 %	20 %	407460303
74	NC_018624	CTTTG	2	10	141286	141295	0 %	60 %	20 %	20 %	407460305
75	NC_018624	AGAAA	2	10	143323	143332	80 %	0 %	20 %	0 %	407460308
76	NC_018624	AAAGA	2	10	145988	145997	80 %	0 %	20 %	0 %	407460310
77	NC_018624	TACTC	2	10	149619	149628	20 %	40 %	0 %	40 %	407460317
78	NC_018624	CGTTT	2	10	149666	149675	0 %	60 %	20 %	20 %	407460317
79	NC_018624	ATTTT	2	10	149806	149815	20 %	80 %	0 %	0 %	407460317
80	NC_018624	ACCAT	2	10	151837	151846	40 %	20 %	0 %	40 %	407460318
81	NC_018624	CAGAA	2	10	152802	152811	60 %	0 %	20 %	20 %	407460319
82	NC_018624	TTCAT	2	10	153372	153381	20 %	60 %	0 %	20 %	407460319
83	NC_018624	AAAGG	2	10	154202	154211	60 %	0 %	40 %	0 %	407460320
84	NC_018624	ATAGG	2	10	155894	155903	40 %	20 %	40 %	0 %	407460322
85	NC_018624	TTTGA	2	10	155980	155989	20 %	60 %	20 %	0 %	407460322
86	NC_018624	AAGGT	2	10	160921	160930	40 %	20 %	40 %	0 %	407460325
87	NC_018624	TTTTG	2	10	161860	161869	0 %	80 %	20 %	0 %	407460327
88	NC_018624	GGGGC	2	10	162007	162016	0 %	0 %	80 %	20 %	407460327
89	NC_018624	AGCAT	2	10	163299	163308	40 %	20 %	20 %	20 %	407460329
90	NC_018624	AAATG	2	10	166414	166423	60 %	20 %	20 %	0 %	407460330
91	NC_018624	GGGGA	2	10	168189	168198	20 %	0 %	80 %	0 %	407460331
92	NC_018624	CTGTT	2	10	169705	169714	0 %	60 %	20 %	20 %	407460333
93	NC_018624	AATGA	2	10	169740	169749	60 %	20 %	20 %	0 %	407460333
94	NC_018624	ATTTT	2	10	173199	173208	20 %	80 %	0 %	0 %	407460337
95	NC_018624	GAGAG	2	10	173216	173225	40 %	0 %	60 %	0 %	407460337
96	NC_018624	CTAAG	2	10	181165	181174	40 %	20 %	20 %	20 %	407460344
97	NC_018624	TTTTC	2	10	181765	181774	0 %	80 %	0 %	20 %	407460344
98	NC_018624	GGTAC	2	10	183760	183769	20 %	20 %	40 %	20 %	407460346
99	NC_018624	AGGGA	2	10	186947	186956	40 %	0 %	60 %	0 %	407460351
100	NC_018624	AGGAA	2	10	187970	187979	60 %	0 %	40 %	0 %	407460352
101	NC_018624	TTCTT	2	10	188349	188358	0 %	80 %	0 %	20 %	407460352
102	NC_018624	GATAA	2	10	190992	191001	60 %	20 %	20 %	0 %	407460352
103	NC_018624	CCCTT	2	10	193196	193205	0 %	40 %	0 %	60 %	407460353
104	NC_018624	AGTTA	2	10	194187	194196	40 %	40 %	20 %	0 %	407460354
105	NC_018624	TTATT	2	10	194207	194216	20 %	80 %	0 %	0 %	407460354
106	NC_018624	AGGGT	2	10	197124	197133	20 %	20 %	60 %	0 %	407460356
107	NC_018624	TGGAT	2	10	197565	197574	20 %	40 %	40 %	0 %	407460356
108	NC_018624	CTAAA	2	10	197622	197631	60 %	20 %	0 %	20 %	407460356
109	NC_018624	CTTTA	2	10	197925	197934	20 %	60 %	0 %	20 %	407460356
110	NC_018624	AAAAT	2	10	198102	198111	80 %	20 %	0 %	0 %	407460356
111	NC_018624	TTGGT	2	10	201405	201414	0 %	60 %	40 %	0 %	407460361
112	NC_018624	AGCAA	2	10	203882	203891	60 %	0 %	20 %	20 %	407460364
113	NC_018624	TAATG	2	10	204997	205006	40 %	40 %	20 %	0 %	407460365
114	NC_018624	AAAAT	2	10	206943	206952	80 %	20 %	0 %	0 %	407460369
115	NC_018624	TGGTT	2	10	207862	207871	0 %	60 %	40 %	0 %	407460369
116	NC_018624	TCTCT	2	10	208640	208649	0 %	60 %	0 %	40 %	407460371
117	NC_018624	GAAAA	2	10	214173	214182	80 %	0 %	20 %	0 %	407460377
118	NC_018624	TAGCA	2	10	214539	214548	40 %	20 %	20 %	20 %	407460378
119	NC_018624	AAGAA	2	10	215237	215246	80 %	0 %	20 %	0 %	407460378
120	NC_018624	GAAAG	2	10	216538	216547	60 %	0 %	40 %	0 %	407460380
121	NC_018624	GTTAG	2	10	218522	218531	20 %	40 %	40 %	0 %	407460381
122	NC_018624	TGGAT	2	10	218674	218683	20 %	40 %	40 %	0 %	407460381
123	NC_018624	TTGTA	2	10	221338	221347	20 %	60 %	20 %	0 %	407460381
124	NC_018624	GCTTA	2	10	222469	222478	20 %	40 %	20 %	20 %	407460381
125	NC_018624	GCTGA	2	10	227348	227357	20 %	20 %	40 %	20 %	407460385
126	NC_018624	AGGAG	2	10	230658	230667	40 %	0 %	60 %	0 %	407460390
127	NC_018624	TGCCC	2	10	230961	230970	0 %	20 %	20 %	60 %	407460390
128	NC_018624	TACCT	2	10	231827	231836	20 %	40 %	0 %	40 %	407460391
129	NC_018624	CTAGT	2	10	232118	232127	20 %	40 %	20 %	20 %	407460391
130	NC_018624	TGCGT	2	10	234284	234293	0 %	40 %	40 %	20 %	407460393
131	NC_018624	GTTTT	2	10	234329	234338	0 %	80 %	20 %	0 %	407460393
132	NC_018624	TAAAA	2	10	240091	240100	80 %	20 %	0 %	0 %	407460398
133	NC_018624	TTCAG	2	10	241319	241328	20 %	40 %	20 %	20 %	407460400
134	NC_018624	TTTAG	2	10	242609	242618	20 %	60 %	20 %	0 %	407460400
135	NC_018624	GTTGT	2	10	243414	243423	0 %	60 %	40 %	0 %	407460402
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