MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 3016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407460164
2	NC_018624	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407460164
3	NC_018624	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407460165
4	NC_018624	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407460165
5	NC_018624	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	407460166
6	NC_018624	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	407460166
7	NC_018624	AGTA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	407460166
8	NC_018624	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	407460167
9	NC_018624	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	407460167
10	NC_018624	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407460167
11	NC_018624	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018624	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407460168
13	NC_018624	TAAT	2	8	6731	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	407460169
14	NC_018624	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018624	AGAA	2	8	6963	6970	75 %	0 %	25 %	0 %	407460170
16	NC_018624	TCCC	2	8	7280	7287	0 %	25 %	0 %	75 %	407460170
17	NC_018624	GTAG	2	8	7314	7321	25 %	25 %	50 %	0 %	407460170
18	NC_018624	AATA	2	8	8011	8018	75 %	25 %	0 %	0 %	407460171
19	NC_018624	ATGA	2	8	8482	8489	50 %	25 %	25 %	0 %	407460171
20	NC_018624	TGGA	2	8	8670	8677	25 %	25 %	50 %	0 %	407460171
21	NC_018624	CTGT	2	8	8680	8687	0 %	50 %	25 %	25 %	407460171
22	NC_018624	ATTT	2	8	9401	9408	25 %	75 %	0 %	0 %	407460172
23	NC_018624	AAAG	2	8	10225	10232	75 %	0 %	25 %	0 %	407460172
24	NC_018624	AAGT	2	8	10524	10531	50 %	25 %	25 %	0 %	407460172
25	NC_018624	AGGG	2	8	10763	10770	25 %	0 %	75 %	0 %	407460172
26	NC_018624	TAAG	2	8	10773	10780	50 %	25 %	25 %	0 %	407460172
27	NC_018624	AAAG	2	8	11066	11073	75 %	0 %	25 %	0 %	407460173
28	NC_018624	AGTA	2	8	11724	11731	50 %	25 %	25 %	0 %	407460173
29	NC_018624	TCTT	2	8	12005	12012	0 %	75 %	0 %	25 %	407460173
30	NC_018624	TAAT	2	8	12146	12153	50 %	50 %	0 %	0 %	407460173
31	NC_018624	CAAA	2	8	12457	12464	75 %	0 %	0 %	25 %	407460173
32	NC_018624	AGAT	2	8	12567	12574	50 %	25 %	25 %	0 %	407460173
33	NC_018624	AAGA	2	8	12578	12585	75 %	0 %	25 %	0 %	407460173
34	NC_018624	ACTT	2	8	12700	12707	25 %	50 %	0 %	25 %	407460173
35	NC_018624	CACT	2	8	12797	12804	25 %	25 %	0 %	50 %	407460173
36	NC_018624	GCAA	2	8	13325	13332	50 %	0 %	25 %	25 %	407460173
37	NC_018624	GAAA	2	8	13745	13752	75 %	0 %	25 %	0 %	407460173
38	NC_018624	AGAT	2	8	14314	14321	50 %	25 %	25 %	0 %	407460174
39	NC_018624	TTGT	2	8	14364	14371	0 %	75 %	25 %	0 %	407460174
40	NC_018624	GGAT	2	8	14948	14955	25 %	25 %	50 %	0 %	407460174
41	NC_018624	CCCA	2	8	15419	15426	25 %	0 %	0 %	75 %	407460174
42	NC_018624	TAAA	2	8	17023	17030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018624	AGAA	2	8	17163	17170	75 %	0 %	25 %	0 %	407460176
44	NC_018624	TCTT	2	8	17433	17440	0 %	75 %	0 %	25 %	407460176
45	NC_018624	TTTC	2	8	17680	17687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018624	GTCA	2	8	17836	17843	25 %	25 %	25 %	25 %	407460177
47	NC_018624	AAGC	2	8	18227	18234	50 %	0 %	25 %	25 %	407460177
48	NC_018624	ATTA	2	8	18367	18374	50 %	50 %	0 %	0 %	407460177
49	NC_018624	ATTA	2	8	18989	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	407460179
50	NC_018624	GTTT	2	8	19262	19269	0 %	75 %	25 %	0 %	407460179
51	NC_018624	TTTG	2	8	19502	19509	0 %	75 %	25 %	0 %	407460179
52	NC_018624	TGCC	2	8	19534	19541	0 %	25 %	25 %	50 %	407460179
53	NC_018624	GCGT	2	8	19666	19673	0 %	25 %	50 %	25 %	407460179
54	NC_018624	TGGT	2	8	20447	20454	0 %	50 %	50 %	0 %	407460180
55	NC_018624	TAAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	407460180
56	NC_018624	TATG	2	8	21586	21593	25 %	50 %	25 %	0 %	407460180
57	NC_018624	CAAT	2	8	22281	22288	50 %	25 %	0 %	25 %	407460181
58	NC_018624	AGAA	2	8	22698	22705	75 %	0 %	25 %	0 %	407460181
59	NC_018624	TGAT	2	8	22905	22912	25 %	50 %	25 %	0 %	407460181
60	NC_018624	AGCT	2	8	24166	24173	25 %	25 %	25 %	25 %	407460182
61	NC_018624	AAAT	2	8	24503	24510	75 %	25 %	0 %	0 %	407460182
62	NC_018624	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	407460182
63	NC_018624	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	407460182
64	NC_018624	TTCT	2	8	24925	24932	0 %	75 %	0 %	25 %	407460183
65	NC_018624	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407460183
66	NC_018624	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407460183
67	NC_018624	ATTC	2	8	25881	25888	25 %	50 %	0 %	25 %	407460183
68	NC_018624	TTTC	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	407460183
69	NC_018624	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407460183
70	NC_018624	TAAA	2	8	26472	26479	75 %	25 %	0 %	0 %	407460183
71	NC_018624	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	407460184
72	NC_018624	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	407460184
73	NC_018624	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407460185
74	NC_018624	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
75	NC_018624	AAAT	2	8	28807	28814	75 %	25 %	0 %	0 %	407460185
76	NC_018624	GGCA	2	8	29085	29092	25 %	0 %	50 %	25 %	407460185
77	NC_018624	AGGG	2	8	29430	29437	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018624	GAAT	2	8	29624	29631	50 %	25 %	25 %	0 %	407460187
79	NC_018624	AGAA	2	8	29789	29796	75 %	0 %	25 %	0 %	407460187
80	NC_018624	ACCA	2	8	30239	30246	50 %	0 %	0 %	50 %	407460187
81	NC_018624	GTTT	2	8	31410	31417	0 %	75 %	25 %	0 %	407460189
82	NC_018624	TTTC	2	8	31650	31657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018624	TCTA	2	8	32054	32061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018624	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018624	TTAA	2	8	32418	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018624	ATTT	2	8	32433	32440	25 %	75 %	0 %	0 %	407460191
87	NC_018624	TTGT	2	8	32459	32466	0 %	75 %	25 %	0 %	407460191
88	NC_018624	TAGA	2	8	32665	32672	50 %	25 %	25 %	0 %	407460191
89	NC_018624	TTTA	2	8	33119	33126	25 %	75 %	0 %	0 %	407460191
90	NC_018624	TTAA	2	8	33514	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018624	AGAT	2	8	33557	33564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018624	TGAA	2	8	34016	34023	50 %	25 %	25 %	0 %	407460193
93	NC_018624	GTAC	2	8	34094	34101	25 %	25 %	25 %	25 %	407460193
94	NC_018624	GATA	2	8	34130	34137	50 %	25 %	25 %	0 %	407460193
95	NC_018624	TCTT	2	8	34390	34397	0 %	75 %	0 %	25 %	407460194
96	NC_018624	AGGA	2	8	35342	35349	50 %	0 %	50 %	0 %	407460194
97	NC_018624	TAAT	2	8	36130	36137	50 %	50 %	0 %	0 %	407460195
98	NC_018624	CGCT	2	8	36846	36853	0 %	25 %	25 %	50 %	407460195
99	NC_018624	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018624	AAAG	2	8	38201	38208	75 %	0 %	25 %	0 %	407460196
101	NC_018624	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	407460196
102	NC_018624	TCAA	2	8	38353	38360	50 %	25 %	0 %	25 %	407460196
103	NC_018624	TTTA	2	8	38686	38693	25 %	75 %	0 %	0 %	407460196
104	NC_018624	CTTT	2	8	38816	38823	0 %	75 %	0 %	25 %	407460196
105	NC_018624	AGCG	2	8	39005	39012	25 %	0 %	50 %	25 %	407460196
106	NC_018624	CCTG	2	8	40301	40308	0 %	25 %	25 %	50 %	407460199
107	NC_018624	GAAA	2	8	41242	41249	75 %	0 %	25 %	0 %	407460199
108	NC_018624	AGCA	2	8	41413	41420	50 %	0 %	25 %	25 %	407460199
109	NC_018624	CTGT	2	8	41881	41888	0 %	50 %	25 %	25 %	407460199
110	NC_018624	TCTT	2	8	41921	41928	0 %	75 %	0 %	25 %	407460199
111	NC_018624	GAAG	2	8	42332	42339	50 %	0 %	50 %	0 %	407460199
112	NC_018624	AATA	2	8	42363	42370	75 %	25 %	0 %	0 %	407460199
113	NC_018624	GAAA	2	8	43500	43507	75 %	0 %	25 %	0 %	407460203
114	NC_018624	GTCG	2	8	44198	44205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018624	TTAA	2	8	44228	44235	50 %	50 %	0 %	0 %	407460204
116	NC_018624	ATCA	2	8	44817	44824	50 %	25 %	0 %	25 %	407460204
117	NC_018624	ATGA	2	8	45095	45102	50 %	25 %	25 %	0 %	407460204
118	NC_018624	TAAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	407460205
119	NC_018624	GAAA	2	8	46976	46983	75 %	0 %	25 %	0 %	407460207
120	NC_018624	TCTT	2	8	47082	47089	0 %	75 %	0 %	25 %	407460207
121	NC_018624	GCTT	2	8	47611	47618	0 %	50 %	25 %	25 %	407460207
122	NC_018624	AAGA	2	8	48053	48060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018624	TGTT	2	8	48463	48470	0 %	75 %	25 %	0 %	407460208
124	NC_018624	ATAA	2	8	49531	49538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018624	TAAA	2	8	49700	49707	75 %	25 %	0 %	0 %	407460209
126	NC_018624	AAGC	2	8	49729	49736	50 %	0 %	25 %	25 %	407460209
127	NC_018624	CCAA	2	8	49753	49760	50 %	0 %	0 %	50 %	407460209
128	NC_018624	TTCC	2	8	49900	49907	0 %	50 %	0 %	50 %	407460209
129	NC_018624	AACA	2	8	50877	50884	75 %	0 %	0 %	25 %	407460209
130	NC_018624	AAAG	2	8	52611	52618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018624	TTTA	2	8	52621	52628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018624	GAAG	2	8	52724	52731	50 %	0 %	50 %	0 %	407460210
133	NC_018624	ATCC	2	8	53030	53037	25 %	25 %	0 %	50 %	407460211
134	NC_018624	AGCA	2	8	53322	53329	50 %	0 %	25 %	25 %	407460211
135	NC_018624	TTCA	2	8	53482	53489	25 %	50 %	0 %	25 %	407460211
136	NC_018624	GTAT	2	8	54135	54142	25 %	50 %	25 %	0 %	407460212
137	NC_018624	CATA	2	8	54330	54337	50 %	25 %	0 %	25 %	407460212
138	NC_018624	AAAG	2	8	54789	54796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018624	TAGC	2	8	55861	55868	25 %	25 %	25 %	25 %	407460214
140	NC_018624	CTGT	2	8	56040	56047	0 %	50 %	25 %	25 %	407460214
141	NC_018624	CTTT	2	8	56430	56437	0 %	75 %	0 %	25 %	407460215
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143	NC_018624	GAAG	2	8	56619	56626	50 %	0 %	50 %	0 %	407460215
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