MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018624	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018624	TC	3	6	31850	31855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018624	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018624	TA	3	6	52214	52219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018624	TG	3	6	63290	63295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018624	GA	3	6	97051	97056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018624	GA	3	6	98960	98965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018624	AG	3	6	101771	101776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018624	AG	3	6	112343	112348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018624	AT	3	6	123189	123194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018624	TA	4	8	124035	124042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018624	TA	4	8	125303	125310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018624	TG	4	8	128406	128413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018624	AC	3	6	128540	128545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018624	AT	3	6	130217	130222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018624	TA	3	6	130500	130505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018624	CT	3	6	130596	130601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018624	CT	3	6	130727	130732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018624	GA	3	6	134339	134344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018624	AT	3	6	147189	147194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018624	GT	3	6	148804	148809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018624	GT	3	6	148828	148833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018624	AG	3	6	158061	158066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018624	TA	3	6	173139	173144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018624	AG	3	6	173183	173188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018624	AT	3	6	175377	175382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018624	AG	3	6	179446	179451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018624	CT	3	6	193687	193692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018624	AT	3	6	210329	210334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018624	AT	3	6	213213	213218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018624	AT	3	6	215405	215410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018624	GA	3	6	215465	215470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018624	GT	3	6	215505	215510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018624	CT	3	6	215542	215547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018624	AG	3	6	215770	215775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018624	TC	3	6	215829	215834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018624	AG	3	6	222888	222893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018624	TA	3	6	232225	232230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018624	AG	3	6	236968	236973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018624	AT	3	6	237038	237043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018624	GA	3	6	239856	239861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018624	AG	3	6	241065	241070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018624	AG	3	6	244031	244036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018624	GT	3	6	261573	261578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018624	TC	3	6	266683	266688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018624	AT	4	8	266721	266728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018624	TC	3	6	267825	267830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018624	TG	3	6	267971	267976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018624	TG	3	6	276754	276759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018624	GT	3	6	277596	277601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018624	TC	3	6	282097	282102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018624	TA	3	6	282146	282151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018624	AT	3	6	301325	301330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018624	TC	3	6	301631	301636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018624	AC	3	6	310718	310723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018624	AG	3	6	313713	313718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018624	GA	3	6	313763	313768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018624	TG	3	6	330040	330045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018624	GA	3	6	330086	330091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018624	TA	3	6	332857	332862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018624	AG	3	6	333004	333009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018624	TC	3	6	342476	342481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018624	TA	3	6	345469	345474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018624	GT	3	6	347896	347901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018624	TG	3	6	349420	349425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018624	CT	3	6	350971	350976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018624	TA	3	6	351044	351049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018624	TA	3	6	352456	352461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018624	TA	3	6	356623	356628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018624	CT	4	8	359240	359247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018624	AT	3	6	367922	367927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018624	TA	3	6	370563	370568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018624	AG	3	6	371569	371574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018624	AT	3	6	374963	374968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018624	TG	3	6	375212	375217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018624	CT	3	6	376540	376545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018624	TA	3	6	387084	387089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018624	AC	3	6	391141	391146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018624	TA	3	6	401684	401689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018624	CT	3	6	413755	413760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018624	TC	3	6	421745	421750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018624	AT	3	6	425628	425633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018624	GA	3	6	429960	429965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018624	GA	3	6	440694	440699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018624	TC	3	6	445227	445232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018624	AG	3	6	447211	447216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018624	CT	3	6	447282	447287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018624	TA	3	6	448399	448404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018624	CT	3	6	449682	449687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018624	TG	3	6	460638	460643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018624	AG	3	6	460787	460792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018624	CT	4	8	463668	463675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018624	AG	3	6	470496	470501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018624	AG	3	6	477066	477071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018624	TA	3	6	478380	478385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018624	AC	3	6	479838	479843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018624	AG	3	6	481363	481368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018624	TA	3	6	481443	481448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018624	CT	3	6	487858	487863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018624	AG	4	8	489846	489853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018624	TC	3	6	491419	491424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018624	TA	3	6	494181	494186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018624	AT	3	6	499525	499530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018624	GA	3	6	504702	504707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018624	TC	3	6	506153	506158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018624	AT	3	6	513891	513896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018624	AT	3	6	513929	513934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018624	AG	3	6	520614	520619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018624	GT	3	6	529627	529632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018624	GA	3	6	536794	536799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018624	CT	4	8	545889	545896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018624	AT	3	6	556954	556959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018624	GT	3	6	564911	564916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018624	GA	3	6	590155	590160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018624	TG	3	6	590261	590266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018624	AC	3	6	590407	590412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018624	AG	3	6	590631	590636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018624	AC	3	6	601085	601090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018624	GT	3	6	601105	601110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018624	AG	3	6	601216	601221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018624	TC	3	6	601399	601404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018624	AT	3	6	604055	604060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018624	TA	4	8	604199	604206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018624	GA	5	10	621329	621338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018624	CT	3	6	621374	621379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018624	CT	3	6	622758	622763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018624	AC	3	6	627732	627737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018624	TA	3	6	629527	629532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018624	AT	3	6	629547	629552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018624	CT	3	6	631870	631875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018624	TA	3	6	645616	645621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018624	TA	3	6	645716	645721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018624	AT	3	6	646869	646874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018624	CA	3	6	654392	654397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018624	AT	3	6	655473	655478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018624	TA	3	6	655732	655737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018624	TA	3	6	656409	656414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018624	TC	3	6	658219	658224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018624	AG	3	6	661944	661949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018624	TA	3	6	662000	662005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018624	CA	3	6	664710	664715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018624	AT	3	6	675943	675948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018624	CT	3	6	676147	676152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018624	CT	3	6	688285	688290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018624	GC	3	6	695114	695119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018624	AT	3	6	699709	699714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_018624	CT	4	8	703813	703820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018624	CT	3	6	704333	704338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018624	GA	4	8	704764	704771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018624	TA	3	6	705194	705199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018624	GA	3	6	705294	705299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.