MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 1374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018623	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018623	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018623	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018623	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018623	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018623	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018623	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018623	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018623	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018623	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018623	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018623	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018623	TCC	2	6	18549	18554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018623	GTT	2	6	20324	20329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018623	TCC	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018623	TTA	2	6	20340	20345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018623	TCT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018623	AAT	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018623	TAA	2	6	21724	21729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018623	TAA	2	6	21788	21793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018623	ATT	2	6	23765	23770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018623	AAG	2	6	23892	23897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018623	CTT	2	6	24519	24524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018623	AGG	2	6	24540	24545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018623	GTA	2	6	24553	24558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018623	GCA	2	6	24614	24619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018623	TTA	2	6	24623	24628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018623	TCA	2	6	24758	24763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018623	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018623	TTG	2	6	26625	26630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018623	ACT	2	6	26649	26654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018623	AGA	2	6	31972	31977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018623	AAT	2	6	32410	32415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018623	TTA	2	6	33431	33436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018623	AAG	2	6	33452	33457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018623	TGT	3	9	33527	33535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018623	TGA	2	6	33560	33565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018623	ACA	2	6	33570	33575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018623	ATT	2	6	33589	33594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018623	TGG	2	6	34229	34234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018623	ATT	2	6	34268	34273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018623	TTC	2	6	37589	37594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018623	TTC	2	6	37630	37635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018623	TGC	2	6	37678	37683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018623	AGA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018623	TAT	2	6	38104	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018623	GAA	2	6	39480	39485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018623	GCA	2	6	39924	39929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018623	GAA	2	6	42408	42413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018623	AGT	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018623	CAA	2	6	42772	42777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018623	GTT	2	6	43449	43454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018623	GAC	2	6	44138	44143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018623	ACG	2	6	44173	44178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018623	GTC	2	6	44214	44219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018623	GAA	2	6	49509	49514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018623	GAT	2	6	52228	52233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018623	TCG	2	6	52295	52300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018623	TTG	2	6	52310	52315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018623	GTC	2	6	52414	52419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018623	AAG	2	6	52514	52519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018623	AAT	2	6	54530	54535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018623	ACT	2	6	54809	54814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018623	GTT	2	6	57781	57786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018623	TGG	2	6	57861	57866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018623	TAA	2	6	57971	57976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018623	GGC	2	6	59450	59455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018623	GAG	2	6	59509	59514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018623	ATT	2	6	59558	59563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018623	TTA	2	6	59585	59590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018623	TAA	2	6	59660	59665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018623	AGA	2	6	59736	59741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018623	CTA	2	6	59975	59980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018623	CAA	2	6	63299	63304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018623	GTT	2	6	64379	64384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018623	AGA	2	6	64407	64412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018623	AAT	2	6	64444	64449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018623	TTG	2	6	64473	64478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018623	AAT	2	6	64638	64643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018623	TGT	2	6	66154	66159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018623	ATT	2	6	66179	66184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018623	ATA	2	6	71240	71245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018623	TTA	3	9	74097	74105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018623	ATC	2	6	76094	76099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018623	TCA	2	6	77419	77424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018623	ATT	2	6	77506	77511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018623	TAA	2	6	77714	77719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018623	TAT	2	6	77775	77780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018623	AAT	2	6	80586	80591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018623	TGT	2	6	81807	81812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018623	CAA	2	6	81892	81897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018623	TCC	2	6	81907	81912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018623	TTA	2	6	83420	83425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018623	ATC	2	6	84787	84792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018623	GTT	2	6	87377	87382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018623	ATA	2	6	93326	93331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018623	AGA	2	6	93358	93363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018623	ATC	2	6	93407	93412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018623	AGA	2	6	93510	93515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018623	AAG	2	6	93548	93553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018623	TAA	2	6	93555	93560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018623	AAT	2	6	93634	93639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018623	TTG	2	6	93672	93677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018623	GTT	2	6	93951	93956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018623	AAG	2	6	98663	98668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018623	TCT	2	6	98936	98941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018623	GCT	2	6	99210	99215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018623	ACA	2	6	99266	99271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018623	AAT	2	6	99329	99334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018623	ATG	2	6	99368	99373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018623	ATA	2	6	99421	99426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018623	GTT	2	6	99454	99459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018623	ACT	2	6	99526	99531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018623	TAG	2	6	99582	99587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018623	TTC	2	6	99687	99692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018623	ACT	2	6	101725	101730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018623	CAA	2	6	101775	101780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018623	TTA	2	6	107105	107110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018623	TCT	2	6	108310	108315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018623	AAC	2	6	108430	108435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018623	TGG	2	6	108444	108449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018623	TGT	2	6	108564	108569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018623	AGA	2	6	109129	109134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018623	GAA	2	6	110180	110185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018623	ATT	2	6	112371	112376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018623	TAC	2	6	118331	118336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018623	GAG	2	6	119152	119157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018623	ACT	2	6	120753	120758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018623	TCT	2	6	122637	122642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018623	AAT	2	6	122763	122768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018623	ATT	2	6	122783	122788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018623	TGG	2	6	122796	122801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018623	GCG	2	6	123121	123126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018623	TTC	3	9	123184	123192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018623	TCC	2	6	125285	125290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018623	TAC	2	6	125297	125302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018623	TGT	2	6	125304	125309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018623	AAT	2	6	125760	125765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018623	ATT	2	6	128303	128308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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