MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018623	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018623	GA	3	6	31716	31721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018623	TC	3	6	31982	31987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018623	GA	3	6	34261	34266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018623	AG	3	6	37613	37618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018623	TG	3	6	37706	37711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018623	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018623	TA	3	6	52212	52217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018623	GT	4	8	59893	59900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018623	TG	3	6	63308	63313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018623	GC	3	6	83033	83038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018623	AT	3	6	94009	94014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018623	GA	3	6	97065	97070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018623	GA	3	6	98975	98980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018623	AG	3	6	101786	101791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018623	TA	3	6	108455	108460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018623	AG	3	6	112360	112365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018623	AT	3	6	123206	123211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018623	TA	4	8	124052	124059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018623	TA	4	8	125320	125327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018623	TG	4	8	128423	128430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018623	AC	3	6	128558	128563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018623	AT	3	6	130235	130240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018623	TA	3	6	130518	130523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018623	CT	3	6	130614	130619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018623	CT	3	6	130745	130750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018623	GA	3	6	134354	134359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018623	TG	3	6	140253	140258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018623	GT	3	6	148807	148812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018623	GT	3	6	148831	148836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018623	AG	3	6	158076	158081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018623	TC	3	6	170998	171003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018623	GA	3	6	171471	171476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018623	TA	3	6	173156	173161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018623	AG	3	6	173200	173205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018623	AT	3	6	175395	175400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018623	AG	3	6	179424	179429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018623	CT	3	6	193664	193669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018623	TC	3	6	193736	193741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018623	CT	3	6	195215	195220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018623	AG	3	6	198293	198298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018623	TA	3	6	198314	198319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018623	AT	3	6	210309	210314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018623	AT	3	6	213203	213208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018623	AT	3	6	215395	215400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018623	GA	3	6	215455	215460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018623	GT	3	6	215495	215500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018623	CT	3	6	215532	215537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018623	AG	3	6	215759	215764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018623	CT	3	6	215819	215824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018623	AG	3	6	222859	222864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018623	GT	3	6	225874	225879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018623	TA	4	8	232195	232202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018623	AG	3	6	236916	236921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018623	AT	3	6	236986	236991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018623	AG	3	6	241017	241022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018623	TC	3	6	251345	251350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018623	TA	3	6	282027	282032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018623	TC	3	6	291598	291603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018623	TC	3	6	301039	301044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018623	AT	3	6	301143	301148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018623	GT	3	6	301328	301333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018623	GA	3	6	301393	301398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018623	TC	3	6	301423	301428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018623	AG	3	6	310446	310451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018623	TA	3	6	311280	311285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018623	GA	3	6	313508	313513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018623	AG	3	6	322996	323001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018623	TC	3	6	336855	336860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018623	TA	3	6	339849	339854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018623	GT	3	6	342277	342282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018623	TG	3	6	343801	343806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018623	CT	3	6	345352	345357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018623	TA	3	6	345425	345430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018623	TA	3	6	346837	346842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018623	TA	3	6	351004	351009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018623	CT	4	8	353622	353629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018623	AT	3	6	362304	362309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018623	TA	3	6	364945	364950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018623	AG	3	6	365951	365956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018623	AT	3	6	369345	369350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018623	CT	3	6	370920	370925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018623	TA	3	6	381454	381459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_018623	TA	3	6	396053	396058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_018623	CT	3	6	408123	408128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018623	TC	3	6	416114	416119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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92	NC_018623	AG	3	6	435051	435056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018623	GA	3	6	435061	435066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018623	TC	3	6	439595	439600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018623	AG	3	6	441579	441584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018623	CT	3	6	441650	441655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018623	CT	3	6	444052	444057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018623	TG	3	6	455008	455013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018623	AG	3	6	455157	455162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_018623	AT	3	6	459481	459486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018623	AG	3	6	464504	464509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018623	AG	3	6	471075	471080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018623	TA	3	6	472394	472399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018623	AC	3	6	473882	473887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018623	AG	3	6	475264	475269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018623	TA	3	6	475344	475349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018623	CT	3	6	481759	481764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018623	AG	4	8	483747	483754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018623	TC	3	6	485320	485325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018623	TA	3	6	488081	488086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018623	GA	3	6	498602	498607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018623	TC	3	6	500054	500059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018623	AT	3	6	507794	507799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018623	AT	3	6	507832	507837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018623	AG	3	6	514517	514522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018623	GT	3	6	523531	523536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018623	GA	3	6	530698	530703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018623	AT	3	6	550859	550864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018623	GT	3	6	558815	558820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018623	TA	3	6	576167	576172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018623	GA	3	6	584056	584061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018623	TG	3	6	584162	584167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018623	AC	3	6	584308	584313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018623	AG	3	6	584532	584537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018623	AC	3	6	594972	594977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018623	GT	3	6	594992	594997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018623	AG	3	6	595103	595108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018623	TC	3	6	595286	595291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018623	AT	3	6	597942	597947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018623	TA	4	8	598086	598093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018623	GA	5	10	615214	615223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018623	CT	3	6	615259	615264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018623	TA	3	6	616620	616625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018623	CT	3	6	616646	616651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018623	AC	3	6	621595	621600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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138	NC_018623	TA	3	6	623386	623391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018623	AT	3	6	623406	623411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_018623	CT	3	6	625731	625736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018623	TA	4	8	639352	639359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018623	AT	3	6	639582	639587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018623	GT	3	6	640735	640740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018623	AT	3	6	641376	641381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018623	AT	3	6	642089	642094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018623	TA	3	6	644578	644583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018623	TA	3	6	645256	645261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018623	AC	3	6	647317	647322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018623	CA	3	6	653516	653521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_018623	TA	3	6	661409	661414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018623	AT	3	6	664745	664750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.