MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	ATTTAA	2	12	33592	33603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	TTTTTA	2	12	39391	39402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018622	TTTTAA	2	12	42715	42726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018622	ATTATA	2	12	77755	77766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018622	TTTCTT	2	12	123037	123048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018622	AGAAAA	2	12	163066	163077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018622	TTTTAT	2	12	164545	164556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018622	TATGAA	2	12	198474	198485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018622	TTTTTA	2	12	210474	210485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018622	TAAAGA	2	12	226832	226843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018622	AATTAT	2	12	239696	239707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018622	TTGAAT	2	12	244010	244021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018622	ATATAA	2	12	261760	261771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018622	GGGAAA	2	12	267727	267738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018622	TAAGAA	2	12	277646	277657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018622	TAAAAT	2	12	291456	291467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018622	TGAAAA	2	12	327837	327848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018622	ATTTTT	2	12	362188	362199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018622	AAAATC	2	12	387200	387211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018622	AAAAAT	2	12	461174	461185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018622	TATAAT	2	12	480556	480567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018622	TTAATT	2	12	498253	498264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018622	CGTTTA	2	12	625331	625342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018622	TTCTAT	2	12	625347	625358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018622	ATACTA	2	12	625366	625377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018622	TTTTTA	2	12	638619	638630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018622	ATTTCT	2	12	641161	641172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018622	TTTATA	2	12	641364	641375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018622	TCATTC	2	12	644268	644279	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018622	AAGGGA	2	12	683117	683128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018622	ATTAAT	2	12	685806	685817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018622	TAAAAG	2	12	713990	714001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018622	ATTTTA	2	12	726682	726693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018622	TAACCT	2	12	768063	768074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018622	TTGATT	2	12	794968	794979	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018622	ATCCCG	2	12	886525	886536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018622	ATTCTT	2	12	887803	887814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018622	TCGCAA	2	12	888151	888162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018622	ATTTTA	2	12	919953	919964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018622	ATCTAT	2	12	935245	935256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018622	ATAAAA	2	12	951690	951701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018622	TTTTCT	2	12	982645	982656	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018622	AAATAA	2	12	987864	987875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018622	TCGCTT	2	12	990683	990694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018622	TTATCC	2	12	991587	991598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018622	AAATTT	2	12	993738	993749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018622	CTTTGT	2	12	1005176	1005187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018622	AAAAAT	2	12	1025449	1025460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018622	TAATTT	2	12	1072082	1072093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018622	AAAATA	2	12	1110582	1110593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018622	TACAGA	2	12	1123260	1123271	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018622	GTTAAA	2	12	1136187	1136198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018622	CCTTCG	2	12	1138975	1138986	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.