MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	407457552
2	NC_018622	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407457552
3	NC_018622	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	407457554
4	NC_018622	AACAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	407457555
5	NC_018622	AAGAA	2	10	9569	9578	80 %	0 %	20 %	0 %	407457557
6	NC_018622	ATAAA	2	10	13044	13053	80 %	20 %	0 %	0 %	407457558
7	NC_018622	GTTTT	2	10	13558	13567	0 %	80 %	20 %	0 %	407457558
8	NC_018622	GAAAC	2	10	14326	14335	60 %	0 %	20 %	20 %	407457559
9	NC_018622	AACAA	2	10	15355	15364	80 %	0 %	0 %	20 %	407457559
10	NC_018622	AATAG	2	10	17067	17076	60 %	20 %	20 %	0 %	407457561
11	NC_018622	GCCTA	2	10	19903	19912	20 %	20 %	20 %	40 %	407457564
12	NC_018622	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	407457565
13	NC_018622	ATCAG	2	10	29179	29188	40 %	20 %	20 %	20 %	407457568
14	NC_018622	GCCAC	2	10	29441	29450	20 %	0 %	20 %	60 %	407457569
15	NC_018622	ATAAA	2	10	34281	34290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018622	AAGGA	2	10	38573	38582	60 %	0 %	40 %	0 %	407457579
17	NC_018622	CCATA	2	10	38780	38789	40 %	20 %	0 %	40 %	407457579
18	NC_018622	GGATT	2	10	39766	39775	20 %	40 %	40 %	0 %	407457580
19	NC_018622	CGCAG	2	10	40531	40540	20 %	0 %	40 %	40 %	407457581
20	NC_018622	CTTTC	2	10	43209	43218	0 %	60 %	0 %	40 %	407457584
21	NC_018622	ACAAA	2	10	43871	43880	80 %	0 %	0 %	20 %	407457585
22	NC_018622	TATGG	2	10	44281	44290	20 %	40 %	40 %	0 %	407457586
23	NC_018622	TCTTT	2	10	46089	46098	0 %	80 %	0 %	20 %	407457588
24	NC_018622	AGCCC	2	10	47086	47095	20 %	0 %	20 %	60 %	407457589
25	NC_018622	TCAAA	2	10	47441	47450	60 %	20 %	0 %	20 %	407457589
26	NC_018622	TCTAT	2	10	49560	49569	20 %	60 %	0 %	20 %	407457591
27	NC_018622	TTTGG	2	10	51474	51483	0 %	60 %	40 %	0 %	407457591
28	NC_018622	TTTTG	2	10	52483	52492	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018622	TTTTC	2	10	55343	55352	0 %	80 %	0 %	20 %	407457595
30	NC_018622	GTAAG	2	10	57391	57400	40 %	20 %	40 %	0 %	407457598
31	NC_018622	TTAAT	2	10	57963	57972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018622	TCTTT	2	10	59407	59416	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018622	AAAAT	2	10	60213	60222	80 %	20 %	0 %	0 %	407457600
34	NC_018622	TAGTT	2	10	62815	62824	20 %	60 %	20 %	0 %	407457600
35	NC_018622	GAATG	2	10	62831	62840	40 %	20 %	40 %	0 %	407457600
36	NC_018622	TCCTA	2	10	64881	64890	20 %	40 %	0 %	40 %	407457602
37	NC_018622	AGAAA	2	10	70137	70146	80 %	0 %	20 %	0 %	407457606
38	NC_018622	GGATA	2	10	70945	70954	40 %	20 %	40 %	0 %	407457608
39	NC_018622	CACTT	2	10	71128	71137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018622	ATAGC	2	10	74384	74393	40 %	20 %	20 %	20 %	407457612
41	NC_018622	GCACA	2	10	77217	77226	40 %	0 %	20 %	40 %	407457614
42	NC_018622	AATTT	2	10	77741	77750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018622	AAAGA	2	10	78170	78179	80 %	0 %	20 %	0 %	407457615
44	NC_018622	GCAGG	2	10	79529	79538	20 %	0 %	60 %	20 %	407457616
45	NC_018622	ACTAG	2	10	79617	79626	40 %	20 %	20 %	20 %	407457616
46	NC_018622	CGTAT	2	10	81552	81561	20 %	40 %	20 %	20 %	407457617
47	NC_018622	GAAAA	2	10	82762	82771	80 %	0 %	20 %	0 %	407457618
48	NC_018622	AGGAA	2	10	84761	84770	60 %	0 %	40 %	0 %	407457621
49	NC_018622	CTTTT	2	10	85650	85659	0 %	80 %	0 %	20 %	407457623
50	NC_018622	CAAAG	2	10	87121	87130	60 %	0 %	20 %	20 %	407457625
51	NC_018622	AACAA	2	10	87288	87297	80 %	0 %	0 %	20 %	407457625
52	NC_018622	AGAAA	2	10	87358	87367	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018622	AAAGA	2	10	89193	89202	80 %	0 %	20 %	0 %	407457627
54	NC_018622	TTTTC	2	10	90208	90217	0 %	80 %	0 %	20 %	407457627
55	NC_018622	AGGAT	2	10	90731	90740	40 %	20 %	40 %	0 %	407457627
56	NC_018622	ATAAC	2	10	90817	90826	60 %	20 %	0 %	20 %	407457627
57	NC_018622	TGGCA	2	10	93302	93311	20 %	20 %	40 %	20 %	407457628
58	NC_018622	AATTA	2	10	93966	93975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018622	TGTTT	2	10	95027	95036	0 %	80 %	20 %	0 %	407457630
60	NC_018622	TCACC	2	10	96601	96610	20 %	20 %	0 %	60 %	407457631
61	NC_018622	AAAAT	2	10	96736	96745	80 %	20 %	0 %	0 %	407457631
62	NC_018622	TTAAT	2	10	97780	97789	40 %	60 %	0 %	0 %	407457632
63	NC_018622	ATTTG	2	10	98963	98972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018622	AAAAT	2	10	99684	99693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018622	ATTAC	2	10	102912	102921	40 %	40 %	0 %	20 %	407457640
66	NC_018622	CTACA	2	10	103286	103295	40 %	20 %	0 %	40 %	407457640
67	NC_018622	AATTA	2	10	104833	104842	60 %	40 %	0 %	0 %	407457642
68	NC_018622	CTATA	2	10	105823	105832	40 %	40 %	0 %	20 %	407457643
69	NC_018622	CTTTT	2	10	108365	108374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018622	AGCTT	2	10	108476	108485	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018622	GTTTG	2	10	108783	108792	0 %	60 %	40 %	0 %	407457647
72	NC_018622	AGTTA	2	10	115588	115597	40 %	40 %	20 %	0 %	407457662
73	NC_018622	AGTTT	2	10	116078	116087	20 %	60 %	20 %	0 %	407457663
74	NC_018622	TTTGC	2	10	116993	117002	0 %	60 %	20 %	20 %	407457665
75	NC_018622	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	407457668
76	NC_018622	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	407457671
77	NC_018622	CTTTT	2	10	122879	122888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018622	GAGAT	2	10	123435	123444	40 %	20 %	40 %	0 %	407457672
79	NC_018622	GTCAA	2	10	124754	124763	40 %	20 %	20 %	20 %	407457674
80	NC_018622	TAGGG	2	10	127226	127235	20 %	20 %	60 %	0 %	407457677
81	NC_018622	AACTT	2	10	128158	128167	40 %	40 %	0 %	20 %	407457677
82	NC_018622	TTCTT	2	10	131362	131371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018622	TGTCA	2	10	132043	132052	20 %	40 %	20 %	20 %	407457680
84	NC_018622	AAAAG	2	10	135449	135458	80 %	0 %	20 %	0 %	407457682
85	NC_018622	TAAAA	2	10	135730	135739	80 %	20 %	0 %	0 %	407457682
86	NC_018622	GATTT	2	10	137989	137998	20 %	60 %	20 %	0 %	407457684
87	NC_018622	TTGTT	2	10	138331	138340	0 %	80 %	20 %	0 %	407457684
88	NC_018622	AAGAA	2	10	138812	138821	80 %	0 %	20 %	0 %	407457684
89	NC_018622	TTCTT	2	10	139406	139415	0 %	80 %	0 %	20 %	407457685
90	NC_018622	CTTTG	2	10	141310	141319	0 %	60 %	20 %	20 %	407457687
91	NC_018622	AGAAA	2	10	143347	143356	80 %	0 %	20 %	0 %	407457690
92	NC_018622	AAAGA	2	10	146012	146021	80 %	0 %	20 %	0 %	407457692
93	NC_018622	TTTTA	2	10	148195	148204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018622	TACTC	2	10	149648	149657	20 %	40 %	0 %	40 %	407457700
95	NC_018622	CGTTT	2	10	149695	149704	0 %	60 %	20 %	20 %	407457700
96	NC_018622	ATTTT	2	10	149835	149844	20 %	80 %	0 %	0 %	407457700
97	NC_018622	ACCAT	2	10	151866	151875	40 %	20 %	0 %	40 %	407457701
98	NC_018622	CAGAA	2	10	152831	152840	60 %	0 %	20 %	20 %	407457702
99	NC_018622	TTCAT	2	10	153401	153410	20 %	60 %	0 %	20 %	407457702
100	NC_018622	AAAGG	2	10	154231	154240	60 %	0 %	40 %	0 %	407457703
101	NC_018622	ATAGG	2	10	155923	155932	40 %	20 %	40 %	0 %	407457705
102	NC_018622	TTTGA	2	10	156009	156018	20 %	60 %	20 %	0 %	407457705
103	NC_018622	GCTTG	2	10	163715	163724	0 %	40 %	40 %	20 %	407457712
104	NC_018622	CTACG	2	10	166298	166307	20 %	20 %	20 %	40 %	407457713
105	NC_018622	AAATG	2	10	166435	166444	60 %	20 %	20 %	0 %	407457713
106	NC_018622	TTTTC	2	10	169258	169267	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018622	CTGTT	2	10	169736	169745	0 %	60 %	20 %	20 %	407457716
108	NC_018622	AATGA	2	10	169771	169780	60 %	20 %	20 %	0 %	407457716
109	NC_018622	ATTTT	2	10	173230	173239	20 %	80 %	0 %	0 %	407457720
110	NC_018622	GAGAG	2	10	173247	173256	40 %	0 %	60 %	0 %	407457720
111	NC_018622	CAAAA	2	10	173577	173586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018622	CGCAT	2	10	173947	173956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018622	CTAAG	2	10	181196	181205	40 %	20 %	20 %	20 %	407457727
114	NC_018622	TTTTC	2	10	181796	181805	0 %	80 %	0 %	20 %	407457727
115	NC_018622	GGTAC	2	10	183791	183800	20 %	20 %	40 %	20 %	407457729
116	NC_018622	AGGGA	2	10	186978	186987	40 %	0 %	60 %	0 %	407457734
117	NC_018622	AATGT	2	10	187387	187396	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018622	AGGAA	2	10	188001	188010	60 %	0 %	40 %	0 %	407457735
119	NC_018622	TTCTT	2	10	188380	188389	0 %	80 %	0 %	20 %	407457735
120	NC_018622	GATAA	2	10	191023	191032	60 %	20 %	20 %	0 %	407457735
121	NC_018622	TTTTA	2	10	193925	193934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018622	ATTTA	2	10	193959	193968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018622	TTATT	2	10	194235	194244	20 %	80 %	0 %	0 %	407457737
124	NC_018622	CCCTA	2	10	195288	195297	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_018622	AGGGT	2	10	197144	197153	20 %	20 %	60 %	0 %	407457739
126	NC_018622	AGCTA	2	10	197640	197649	40 %	20 %	20 %	20 %	407457739
127	NC_018622	TTTTC	2	10	197747	197756	0 %	80 %	0 %	20 %	407457739
128	NC_018622	CTTTA	2	10	197945	197954	20 %	60 %	0 %	20 %	407457739
129	NC_018622	GTTTT	2	10	198625	198634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018622	ATTAA	2	10	201053	201062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018622	TTGGT	2	10	201429	201438	0 %	60 %	40 %	0 %	407457744
132	NC_018622	AGCAA	2	10	203906	203915	60 %	0 %	20 %	20 %	407457747
133	NC_018622	ATGTG	2	10	204292	204301	20 %	40 %	40 %	0 %	407457748
134	NC_018622	TAATG	2	10	205021	205030	40 %	40 %	20 %	0 %	407457748
135	NC_018622	AAAAT	2	10	206967	206976	80 %	20 %	0 %	0 %	407457752
136	NC_018622	TGGTT	2	10	207886	207895	0 %	60 %	40 %	0 %	407457752
137	NC_018622	TCTCT	2	10	208664	208673	0 %	60 %	0 %	40 %	407457754
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