MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 15304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018622	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
4	NC_018622	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457549
5	NC_018622	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
6	NC_018622	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
7	NC_018622	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457549
8	NC_018622	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457549
9	NC_018622	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457549
10	NC_018622	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457549
11	NC_018622	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457549
12	NC_018622	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
13	NC_018622	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457549
14	NC_018622	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
15	NC_018622	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457549
16	NC_018622	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457549
17	NC_018622	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
18	NC_018622	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018622	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018622	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
21	NC_018622	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457550
22	NC_018622	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
23	NC_018622	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457550
24	NC_018622	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
25	NC_018622	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
26	NC_018622	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457550
27	NC_018622	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
28	NC_018622	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457550
29	NC_018622	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
30	NC_018622	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457550
31	NC_018622	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
32	NC_018622	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
33	NC_018622	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457550
34	NC_018622	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
35	NC_018622	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457550
36	NC_018622	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457550
37	NC_018622	AGT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457551
38	NC_018622	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
39	NC_018622	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457551
40	NC_018622	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457551
41	NC_018622	TTA	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
42	NC_018622	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457551
43	NC_018622	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
44	NC_018622	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
45	NC_018622	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018622	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018622	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018622	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
49	NC_018622	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
50	NC_018622	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457552
51	NC_018622	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457552
52	NC_018622	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457552
53	NC_018622	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457552
54	NC_018622	AAG	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
55	NC_018622	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
56	NC_018622	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457552
57	NC_018622	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
58	NC_018622	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457552
59	NC_018622	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457552
60	NC_018622	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
61	NC_018622	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457552
62	NC_018622	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
63	NC_018622	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
64	NC_018622	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457552
65	NC_018622	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
66	NC_018622	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
67	NC_018622	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457552
68	NC_018622	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
69	NC_018622	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
70	NC_018622	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457552
71	NC_018622	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457552
72	NC_018622	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018622	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018622	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457553
75	NC_018622	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457553
76	NC_018622	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457553
77	NC_018622	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
78	NC_018622	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
79	NC_018622	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
80	NC_018622	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
81	NC_018622	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457553
82	NC_018622	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
83	NC_018622	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
84	NC_018622	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
85	NC_018622	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
86	NC_018622	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
87	NC_018622	GCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457553
88	NC_018622	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457553
89	NC_018622	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
90	NC_018622	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457553
91	NC_018622	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457553
92	NC_018622	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457553
93	NC_018622	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457553
94	NC_018622	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457553
95	NC_018622	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
96	NC_018622	ACA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
97	NC_018622	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457553
98	NC_018622	CAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
99	NC_018622	GAA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018622	GAA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457555
101	NC_018622	CAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457555
102	NC_018622	ACA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457555
103	NC_018622	GTG	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457555
104	NC_018622	TGT	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457555
105	NC_018622	TTC	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457555
106	NC_018622	GTT	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457555
107	NC_018622	CAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457555
108	NC_018622	AGA	2	6	7169	7174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457555
109	NC_018622	CCT	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457555
110	NC_018622	TAA	2	6	7252	7257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457555
111	NC_018622	TTG	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457555
112	NC_018622	CTC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457555
113	NC_018622	GGA	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457555
114	NC_018622	TGA	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457555
115	NC_018622	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457555
116	NC_018622	TGC	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457555
117	NC_018622	TTC	2	6	7891	7896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457555
118	NC_018622	TTG	2	6	8053	8058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457556
119	NC_018622	TGC	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457556
120	NC_018622	AAG	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457556
121	NC_018622	TTA	2	6	8252	8257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457556
122	NC_018622	CTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457556
123	NC_018622	GAA	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457556
124	NC_018622	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457556
125	NC_018622	TTC	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457556
126	NC_018622	AGG	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457556
127	NC_018622	CCT	2	6	8766	8771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457556
128	NC_018622	AAG	2	6	8814	8819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457556
129	NC_018622	GTT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457556
130	NC_018622	GAA	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457557
131	NC_018622	CAT	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457557
132	NC_018622	TTC	2	6	9021	9026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457557
133	NC_018622	GAA	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457557
134	NC_018622	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457557
135	NC_018622	AGT	2	6	9248	9253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457557
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140	NC_018622	GCA	2	6	9995	10000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457557
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145	NC_018622	AAG	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457557
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148	NC_018622	ATG	2	6	10590	10595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457557
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153	NC_018622	ATT	2	6	11158	11163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457558
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162	NC_018622	TCG	2	6	11717	11722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457558
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183	NC_018622	GAG	2	6	13242	13247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457558
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189	NC_018622	TAG	2	6	13795	13800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457558
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202	NC_018622	GCA	3	9	15203	15211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457559
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222	NC_018622	CAT	2	6	16295	16300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457560
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226	NC_018622	GAG	2	6	16480	16485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457560
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229	NC_018622	ATA	3	9	16787	16795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457560
230	NC_018622	TAA	2	6	16806	16811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457560
231	NC_018622	AAT	2	6	16849	16854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018622	TTA	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_018622	AAT	2	6	17007	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018622	GAA	2	6	17104	17109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457561
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238	NC_018622	AGA	2	6	17427	17432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457561
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240	NC_018622	ATC	2	6	17819	17824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457562
241	NC_018622	CAT	2	6	17970	17975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457562
242	NC_018622	TTC	2	6	18106	18111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457562
243	NC_018622	AGT	2	6	18145	18150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457562
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246	NC_018622	ATA	2	6	18392	18397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457562
247	NC_018622	TTA	2	6	18438	18443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457562
248	NC_018622	CAT	2	6	18447	18452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457562
249	NC_018622	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_018622	TAA	2	6	18574	18579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457563
251	NC_018622	GGA	2	6	18861	18866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457564
252	NC_018622	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457564
253	NC_018622	TGA	2	6	19093	19098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457564
254	NC_018622	CTG	2	6	19162	19167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457564
255	NC_018622	CAA	2	6	19318	19323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457564
256	NC_018622	AAG	2	6	19558	19563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457564
257	NC_018622	ATA	2	6	19564	19569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457564
258	NC_018622	GAA	2	6	19572	19577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457564
259	NC_018622	TCA	2	6	19627	19632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457564
260	NC_018622	CTT	2	6	19650	19655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457564
261	NC_018622	CAA	2	6	19699	19704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457564
262	NC_018622	CGT	2	6	19800	19805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457564
263	NC_018622	TGC	2	6	19838	19843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457564
264	NC_018622	GTT	2	6	19876	19881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457564
265	NC_018622	GTT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457564
266	NC_018622	TAC	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457564
267	NC_018622	ATC	2	6	20135	20140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457564
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271	NC_018622	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_018622	TTA	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018622	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018622	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_018622	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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