MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018622	TC	3	6	31846	31851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018622	TC	3	6	37736	37741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018622	TA	3	6	52210	52215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018622	TG	3	6	63303	63308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018622	GA	3	6	97073	97078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018622	GA	3	6	98982	98987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018622	AG	3	6	101793	101798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018622	TA	3	6	108461	108466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018622	AG	3	6	112366	112371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018622	AT	3	6	123212	123217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018622	TA	4	8	124058	124065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018622	TA	4	8	125326	125333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018622	TG	4	8	128429	128436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018622	AC	3	6	128563	128568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018622	AT	3	6	130240	130245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018622	TA	3	6	130523	130528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018622	CT	3	6	130619	130624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018622	CT	3	6	130750	130755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018622	AT	3	6	131639	131644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018622	GA	3	6	134362	134367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018622	AT	3	6	147213	147218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018622	AG	3	6	158090	158095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018622	TA	3	6	173170	173175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018622	AG	3	6	173214	173219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018622	AG	3	6	179478	179483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018622	CT	3	6	193718	193723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018622	CA	3	6	195509	195514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018622	CA	3	6	198571	198576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018622	AT	3	6	210353	210358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018622	AT	3	6	213237	213242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018622	AT	3	6	215429	215434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018622	GA	3	6	215490	215495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018622	GT	3	6	215530	215535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018622	CT	3	6	215567	215572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018622	AG	3	6	215794	215799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018622	TC	3	6	215853	215858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018622	GC	3	6	217410	217415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018622	AG	3	6	222914	222919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018622	TA	4	8	232249	232256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018622	AG	3	6	236995	237000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018622	AT	3	6	237065	237070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018622	CT	3	6	238606	238611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018622	AT	3	6	239882	239887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018622	GA	3	6	240135	240140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018622	AG	3	6	241088	241093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018622	AG	3	6	244054	244059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018622	GA	3	6	254046	254051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018622	GT	3	6	261595	261600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018622	TC	3	6	266706	266711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018622	AT	4	8	266745	266752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018622	TG	3	6	267995	268000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018622	GT	3	6	277621	277626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018622	TC	3	6	281745	281750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018622	TA	3	6	281794	281799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018622	TC	3	6	301274	301279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018622	AC	3	6	310361	310366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018622	AG	3	6	313335	313340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018622	GA	3	6	313385	313390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018622	AG	3	6	317506	317511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018622	TG	3	6	320679	320684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018622	GA	3	6	320725	320730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018622	AG	3	6	323643	323648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018622	AT	3	6	336102	336107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018622	GT	3	6	338502	338507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018622	TG	3	6	340026	340031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018622	CT	3	6	341575	341580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018622	TA	3	6	341648	341653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018622	TA	3	6	347228	347233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018622	CT	4	8	349845	349852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018622	AT	3	6	358527	358532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018622	TA	3	6	361168	361173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018622	AG	3	6	362174	362179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018622	AT	3	6	365568	365573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018622	TG	3	6	365816	365821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018622	CT	3	6	367143	367148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018622	AG	3	6	371384	371389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018622	TA	3	6	377693	377698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018622	AT	3	6	377910	377915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018622	GT	3	6	380460	380465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018622	AC	3	6	381750	381755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018622	TA	3	6	392293	392298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018622	TG	3	6	403473	403478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018622	CT	3	6	404363	404368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018622	TC	3	6	412353	412358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018622	AT	3	6	416235	416240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018622	GA	3	6	420568	420573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018622	GA	3	6	431302	431307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018622	TC	3	6	435835	435840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018622	AG	3	6	437819	437824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018622	CT	3	6	437890	437895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018622	TA	3	6	439007	439012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018622	CT	3	6	440290	440295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018622	TG	3	6	451246	451251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018622	AG	3	6	451395	451400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018622	CT	4	8	454276	454283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018622	AG	3	6	461105	461110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018622	AG	3	6	467676	467681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018622	TA	3	6	468990	468995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018622	AC	3	6	470448	470453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018622	AG	3	6	471902	471907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018622	TA	3	6	471982	471987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018622	CT	3	6	478399	478404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018622	AG	4	8	480387	480394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018622	TC	3	6	481961	481966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018622	TA	3	6	484723	484728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018622	AT	3	6	490067	490072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018622	GA	3	6	495244	495249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018622	TC	3	6	496696	496701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018622	AT	3	6	504430	504435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018622	AT	3	6	504468	504473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018622	AG	3	6	511153	511158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018622	GT	3	6	520167	520172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018622	GA	3	6	527334	527339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018622	CT	4	8	536429	536436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018622	AT	3	6	547494	547499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018622	GT	3	6	555451	555456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018622	GA	3	6	580685	580690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018622	TG	3	6	580791	580796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018622	AC	3	6	580937	580942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018622	AG	3	6	581161	581166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018622	AC	3	6	591622	591627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018622	GT	3	6	591642	591647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018622	AG	3	6	591753	591758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018622	TC	3	6	591937	591942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018622	AT	3	6	594593	594598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018622	TA	4	8	594737	594744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018622	CA	3	6	600007	600012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018622	GA	5	10	611867	611876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018622	CT	3	6	611912	611917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018622	CT	3	6	613295	613300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018622	AC	3	6	618268	618273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018622	TA	3	6	620062	620067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018622	AT	3	6	620082	620087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018622	CT	3	6	622406	622411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018622	AG	3	6	635067	635072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018622	TA	4	8	635386	635393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018622	TC	3	6	638304	638309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018622	CT	3	6	641089	641094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018622	TA	3	6	641197	641202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018622	TC	3	6	642788	642793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018622	CA	3	6	644132	644137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018622	CT	4	8	644200	644207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018622	AT	3	6	655364	655369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018622	CT	3	6	655568	655573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018622	CT	3	6	667706	667711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018622	GC	3	6	674536	674541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018622	AT	3	6	679131	679136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018622	TG	3	6	683223	683228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018622	CT	4	8	683236	683243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018622	CT	3	6	683682	683687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018622	TA	3	6	683721	683726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.