MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 15600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018621	AGA	3	9	77	85	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018621	CGA	2	6	172	177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
4	NC_018621	AGA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456173
5	NC_018621	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
6	NC_018621	TCT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
7	NC_018621	TAT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456173
8	NC_018621	ATG	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456173
9	NC_018621	TGT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456173
10	NC_018621	ATG	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456173
11	NC_018621	ACA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456173
12	NC_018621	AGC	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
13	NC_018621	GTG	2	6	983	988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456173
14	NC_018621	AGC	3	9	1002	1010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456173
15	NC_018621	CTA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456173
16	NC_018621	GGT	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456173
17	NC_018621	CTT	2	6	1130	1135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456173
18	NC_018621	TTC	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018621	GAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018621	CTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
21	NC_018621	ACA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456174
22	NC_018621	ATG	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
23	NC_018621	TTA	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456174
24	NC_018621	TAG	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
25	NC_018621	TAG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
26	NC_018621	CTA	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456174
27	NC_018621	TTC	2	6	1791	1796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
28	NC_018621	ATA	2	6	1991	1996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456174
29	NC_018621	CTT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
30	NC_018621	GAA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456174
31	NC_018621	TGA	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
32	NC_018621	GAT	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456174
33	NC_018621	GTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456174
34	NC_018621	CTT	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456174
35	NC_018621	TAA	2	6	2370	2375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456174
36	NC_018621	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456174
37	NC_018621	AGT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456175
38	NC_018621	TTA	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
39	NC_018621	TCC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456175
40	NC_018621	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456175
41	NC_018621	TTA	2	6	2805	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
42	NC_018621	AGA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456175
43	NC_018621	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
44	NC_018621	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456175
45	NC_018621	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018621	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018621	TGT	2	6	3088	3093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018621	GAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
49	NC_018621	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
50	NC_018621	AGT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
51	NC_018621	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456176
52	NC_018621	CAA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456176
53	NC_018621	ATG	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
54	NC_018621	ATC	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456176
55	NC_018621	TGG	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456176
56	NC_018621	AGA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
57	NC_018621	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456176
58	NC_018621	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
59	NC_018621	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456176
60	NC_018621	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456176
61	NC_018621	AGA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
62	NC_018621	CTT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456176
63	NC_018621	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
64	NC_018621	GAT	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456176
65	NC_018621	GCT	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456176
66	NC_018621	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
67	NC_018621	AAG	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
68	NC_018621	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456176
69	NC_018621	AAG	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
70	NC_018621	AGA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456176
71	NC_018621	TTA	2	6	5134	5139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456176
72	NC_018621	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456176
73	NC_018621	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018621	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018621	AGA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456177
76	NC_018621	TGG	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456177
77	NC_018621	TAT	2	6	5623	5628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456177
78	NC_018621	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
79	NC_018621	CAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
80	NC_018621	GAT	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
81	NC_018621	TGT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
82	NC_018621	GGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456177
83	NC_018621	CAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
84	NC_018621	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
85	NC_018621	GAT	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
86	NC_018621	TGT	3	9	5985	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
87	NC_018621	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
88	NC_018621	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456177
89	NC_018621	TGC	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456177
90	NC_018621	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456177
91	NC_018621	GAA	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456177
92	NC_018621	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456177
93	NC_018621	TTC	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456177
94	NC_018621	CCT	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456177
95	NC_018621	CTT	2	6	6352	6357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456177
96	NC_018621	GTT	2	6	6394	6399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456177
97	NC_018621	ACA	2	6	6552	6557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
98	NC_018621	ATA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456177
99	NC_018621	CAA	2	6	6636	6641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456177
100	NC_018621	GAA	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018621	GAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456179
102	NC_018621	CAT	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456179
103	NC_018621	ACA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456179
104	NC_018621	GTG	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456179
105	NC_018621	TGT	2	6	7015	7020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456179
106	NC_018621	TTC	2	6	7106	7111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456179
107	NC_018621	GTT	2	6	7117	7122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456179
108	NC_018621	CAT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456179
109	NC_018621	AGA	2	6	7172	7177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456179
110	NC_018621	TAA	2	6	7255	7260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456179
111	NC_018621	TTG	2	6	7304	7309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456179
112	NC_018621	CTC	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456179
113	NC_018621	GGA	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456179
114	NC_018621	TGA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456179
115	NC_018621	ATT	2	6	7781	7786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456179
116	NC_018621	TGC	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456179
117	NC_018621	TTC	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456179
118	NC_018621	TTG	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456180
119	NC_018621	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456180
120	NC_018621	AAG	2	6	8171	8176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456180
121	NC_018621	TTA	2	6	8255	8260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456180
122	NC_018621	CTT	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456180
123	NC_018621	GAA	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456180
124	NC_018621	TTC	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456180
125	NC_018621	TTC	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456180
126	NC_018621	AGG	2	6	8712	8717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456180
127	NC_018621	CCT	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456180
128	NC_018621	AAG	2	6	8817	8822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456180
129	NC_018621	GTT	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456180
130	NC_018621	GAA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456181
131	NC_018621	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456181
132	NC_018621	TTC	2	6	9024	9029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456181
133	NC_018621	GAA	2	6	9085	9090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456181
134	NC_018621	GAG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456181
135	NC_018621	AGT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456181
136	NC_018621	TTA	2	6	9443	9448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456181
137	NC_018621	AGA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456181
138	NC_018621	GTT	2	6	9738	9743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456181
139	NC_018621	CTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456181
140	NC_018621	GCA	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456181
141	NC_018621	CCA	2	6	10041	10046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456181
142	NC_018621	ATG	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456181
143	NC_018621	TCT	2	6	10147	10152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456181
144	NC_018621	AAG	2	6	10348	10353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456181
145	NC_018621	TGG	2	6	10418	10423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456181
146	NC_018621	ATG	2	6	10593	10598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456181
147	NC_018621	GCT	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456181
148	NC_018621	TAG	2	6	10874	10879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456181
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151	NC_018621	ATT	2	6	11161	11166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456182
152	NC_018621	CAA	2	6	11231	11236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456182
153	NC_018621	AGA	2	6	11239	11244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456182
154	NC_018621	GAA	2	6	11286	11291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456182
155	NC_018621	TCT	2	6	11378	11383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456182
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159	NC_018621	GAA	2	6	11648	11653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456182
160	NC_018621	TCG	2	6	11720	11725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456182
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162	NC_018621	CGT	2	6	11971	11976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456182
163	NC_018621	AAG	2	6	11994	11999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456182
164	NC_018621	GTT	2	6	12071	12076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456182
165	NC_018621	AGA	2	6	12187	12192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456182
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181	NC_018621	GAG	2	6	13245	13250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456182
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183	NC_018621	ATA	2	6	13428	13433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456182
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187	NC_018621	TAG	2	6	13798	13803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456182
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197	NC_018621	TTC	2	6	15065	15070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456183
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200	NC_018621	GCA	3	9	15206	15214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456183
201	NC_018621	CCA	2	6	15248	15253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456183
202	NC_018621	TGT	2	6	15636	15641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456183
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218	NC_018621	AGG	2	6	16254	16259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456184
219	NC_018621	CCA	2	6	16284	16289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456184
220	NC_018621	CAT	2	6	16298	16303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456184
221	NC_018621	GGT	2	6	16310	16315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456184
222	NC_018621	GAA	2	6	16384	16389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456184
223	NC_018621	ATT	2	6	16424	16429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456184
224	NC_018621	GAG	2	6	16483	16488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456184
225	NC_018621	TTC	2	6	16580	16585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456184
226	NC_018621	GTA	2	6	16646	16651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456184
227	NC_018621	ATA	3	9	16790	16798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456184
228	NC_018621	TAA	2	6	16809	16814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456184
229	NC_018621	AAT	2	6	16852	16857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_018621	TTA	2	6	16932	16937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_018621	AAT	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018621	GAA	2	6	17107	17112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456185
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236	NC_018621	AGA	2	6	17430	17435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456185
237	NC_018621	TGT	2	6	17642	17647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456185
238	NC_018621	ATC	2	6	17822	17827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456186
239	NC_018621	CAT	2	6	17973	17978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456186
240	NC_018621	TTC	2	6	18109	18114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456186
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245	NC_018621	TTA	2	6	18441	18446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456186
246	NC_018621	CAT	2	6	18450	18455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456186
247	NC_018621	TCC	2	6	18550	18555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456186
248	NC_018621	TAA	2	6	18577	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456186
249	NC_018621	GGA	2	6	18864	18869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456187
250	NC_018621	TTC	2	6	19072	19077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456187
251	NC_018621	TGA	2	6	19096	19101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456187
252	NC_018621	CTG	2	6	19165	19170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456187
253	NC_018621	CAA	2	6	19321	19326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456187
254	NC_018621	AAG	2	6	19561	19566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456187
255	NC_018621	ATA	2	6	19567	19572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456187
256	NC_018621	GAA	2	6	19575	19580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456187
257	NC_018621	TCA	2	6	19630	19635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456187
258	NC_018621	CTT	2	6	19653	19658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456187
259	NC_018621	CAA	2	6	19702	19707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456187
260	NC_018621	CGT	2	6	19803	19808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456187
261	NC_018621	TGC	2	6	19841	19846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456187
262	NC_018621	GTT	2	6	19879	19884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456187
263	NC_018621	GTT	2	6	20028	20033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456187
264	NC_018621	TAC	2	6	20087	20092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456187
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270	NC_018621	TTA	2	6	20341	20346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018621	TCT	2	6	20389	20394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_018621	AAT	2	6	20402	20407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018621	AGT	2	6	20476	20481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456188
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291	NC_018621	TAA	2	6	21789	21794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_018621	TTC	2	6	26616	26621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456192
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377	NC_018621	CAA	2	6	26903	26908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
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380	NC_018621	TAA	2	6	26974	26979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456193
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