MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	ATTTAA	2	12	33591	33602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	TTTTAA	2	12	42714	42725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	ATTATA	2	12	77719	77730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018620	TTTCTT	2	12	123004	123015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018620	TTTTAT	2	12	164440	164451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018620	TATGAA	2	12	198370	198381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018620	TTTTTA	2	12	210371	210382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018620	TAAAGA	2	12	226729	226740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018620	AATTAT	2	12	239592	239603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018620	TTGAAT	2	12	243906	243917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018620	ATATAA	2	12	261658	261669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018620	GGGAAA	2	12	267624	267635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018620	TAAGAA	2	12	277541	277552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018620	TAAAAT	2	12	291351	291362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	TGAAAA	2	12	331422	331433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018620	TTGACT	2	12	342331	342342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018620	ATTTTT	2	12	365659	365670	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018620	AAAATC	2	12	390663	390674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018620	AAAAAT	2	12	464634	464645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	TATAAT	2	12	484015	484026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018620	TTAATT	2	12	501711	501722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018620	CGTTTA	2	12	628942	628953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018620	TTCTAT	2	12	628958	628969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018620	ATACTA	2	12	628977	628988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018620	TTTTTA	2	12	642233	642244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018620	ATTTCT	2	12	644773	644784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018620	TTTATA	2	12	644976	644987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018620	AAGGGA	2	12	686727	686738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018620	ATTAAT	2	12	689417	689428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018620	TAAAAG	2	12	720400	720411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018620	ATTTTA	2	12	733091	733102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018620	TAACCT	2	12	774472	774483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018620	TTGATT	2	12	801362	801373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018620	ATCCCG	2	12	892889	892900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018620	ATTCTT	2	12	894167	894178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018620	TCGCAA	2	12	894515	894526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018620	ATTTTA	2	12	926313	926324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018620	ATCTAT	2	12	941604	941615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018620	ATAAAA	2	12	958050	958061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	TTTTCT	2	12	989004	989015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018620	AAATAA	2	12	994223	994234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018620	TCGCTT	2	12	997043	997054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018620	TTATCC	2	12	997947	997958	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018620	AAATTT	2	12	1000097	1000108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018620	CTTTGT	2	12	1011540	1011551	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018620	AAAAAT	2	12	1031813	1031824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018620	TAATTT	2	12	1078444	1078455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018620	AAAATA	2	12	1116945	1116956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018620	TACAGA	2	12	1129623	1129634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018620	GTTAAA	2	12	1142550	1142561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018620	CCTTCG	2	12	1145338	1145349	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.