MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 2975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407454813
2	NC_018620	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407454813
3	NC_018620	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407454814
4	NC_018620	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407454814
5	NC_018620	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	407454815
6	NC_018620	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	407454815
7	NC_018620	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	407454816
8	NC_018620	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	407454816
9	NC_018620	TGGT	2	8	3491	3498	0 %	50 %	50 %	0 %	407454816
10	NC_018620	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	407454816
11	NC_018620	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018620	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	407454817
13	NC_018620	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	407454818
14	NC_018620	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	407454819
16	NC_018620	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	407454819
17	NC_018620	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	407454819
18	NC_018620	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	407454820
19	NC_018620	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	407454820
20	NC_018620	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	407454820
21	NC_018620	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	407454820
22	NC_018620	ATTT	2	8	9402	9409	25 %	75 %	0 %	0 %	407454821
23	NC_018620	AAAG	2	8	10226	10233	75 %	0 %	25 %	0 %	407454821
24	NC_018620	AAGT	2	8	10525	10532	50 %	25 %	25 %	0 %	407454821
25	NC_018620	AGGG	2	8	10764	10771	25 %	0 %	75 %	0 %	407454821
26	NC_018620	TAAG	2	8	10774	10781	50 %	25 %	25 %	0 %	407454821
27	NC_018620	AAAG	2	8	11067	11074	75 %	0 %	25 %	0 %	407454822
28	NC_018620	AGTA	2	8	11725	11732	50 %	25 %	25 %	0 %	407454822
29	NC_018620	TCTT	2	8	12006	12013	0 %	75 %	0 %	25 %	407454822
30	NC_018620	TAAT	2	8	12147	12154	50 %	50 %	0 %	0 %	407454822
31	NC_018620	CAAA	2	8	12458	12465	75 %	0 %	0 %	25 %	407454822
32	NC_018620	AGAT	2	8	12568	12575	50 %	25 %	25 %	0 %	407454822
33	NC_018620	AAGA	2	8	12579	12586	75 %	0 %	25 %	0 %	407454822
34	NC_018620	ACTT	2	8	12701	12708	25 %	50 %	0 %	25 %	407454822
35	NC_018620	CACT	2	8	12798	12805	25 %	25 %	0 %	50 %	407454822
36	NC_018620	GCAA	2	8	13326	13333	50 %	0 %	25 %	25 %	407454822
37	NC_018620	GAAA	2	8	13746	13753	75 %	0 %	25 %	0 %	407454822
38	NC_018620	AGAT	2	8	14315	14322	50 %	25 %	25 %	0 %	407454825
39	NC_018620	TTGT	2	8	14365	14372	0 %	75 %	25 %	0 %	407454825
40	NC_018620	GGAT	2	8	14949	14956	25 %	25 %	50 %	0 %	407454825
41	NC_018620	CCCA	2	8	15420	15427	25 %	0 %	0 %	75 %	407454825
42	NC_018620	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018620	AGAA	2	8	17164	17171	75 %	0 %	25 %	0 %	407454827
44	NC_018620	TCTT	2	8	17434	17441	0 %	75 %	0 %	25 %	407454827
45	NC_018620	TTTC	2	8	17681	17688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018620	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	407454828
47	NC_018620	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	407454828
48	NC_018620	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	407454828
49	NC_018620	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	407454830
50	NC_018620	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	407454830
51	NC_018620	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	407454830
52	NC_018620	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	407454830
53	NC_018620	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	407454830
54	NC_018620	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	407454831
55	NC_018620	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	407454831
56	NC_018620	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	407454831
57	NC_018620	CAAT	2	8	22281	22288	50 %	25 %	0 %	25 %	407454832
58	NC_018620	AGAA	2	8	22698	22705	75 %	0 %	25 %	0 %	407454832
59	NC_018620	TGAT	2	8	22905	22912	25 %	50 %	25 %	0 %	407454832
60	NC_018620	TGTC	2	8	24055	24062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018620	AGCT	2	8	24168	24175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018620	AATT	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	407454833
63	NC_018620	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	407454833
64	NC_018620	TCTG	2	8	24925	24932	0 %	50 %	25 %	25 %	407454833
65	NC_018620	TAGT	2	8	24982	24989	25 %	50 %	25 %	0 %	407454833
66	NC_018620	TTGC	2	8	25253	25260	0 %	50 %	25 %	25 %	407454833
67	NC_018620	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	407454833
68	NC_018620	GAGT	2	8	25625	25632	25 %	25 %	50 %	0 %	407454833
69	NC_018620	TCAT	2	8	25789	25796	25 %	50 %	0 %	25 %	407454833
70	NC_018620	TCTT	2	8	26014	26021	0 %	75 %	0 %	25 %	407454833
71	NC_018620	ATAG	2	8	26107	26114	50 %	25 %	25 %	0 %	407454833
72	NC_018620	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	407454833
73	NC_018620	ATTT	2	8	26653	26660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018620	CTGG	2	8	27184	27191	0 %	25 %	50 %	25 %	407454834
76	NC_018620	AATC	2	8	27720	27727	50 %	25 %	0 %	25 %	407454834
77	NC_018620	AATT	2	8	27957	27964	50 %	50 %	0 %	0 %	407454834
78	NC_018620	AGAT	2	8	28451	28458	50 %	25 %	25 %	0 %	407454834
79	NC_018620	ATCG	2	8	28582	28589	25 %	25 %	25 %	25 %	407454834
80	NC_018620	AAAT	2	8	28803	28810	75 %	25 %	0 %	0 %	407454834
81	NC_018620	GTGA	2	8	29026	29033	25 %	25 %	50 %	0 %	407454834
82	NC_018620	GGCA	2	8	29081	29088	25 %	0 %	50 %	25 %	407454834
83	NC_018620	AGGG	2	8	29425	29432	25 %	0 %	75 %	0 %	407454835
84	NC_018620	GAAT	2	8	29619	29626	50 %	25 %	25 %	0 %	407454836
85	NC_018620	ACCA	2	8	30234	30241	50 %	0 %	0 %	50 %	407454836
86	NC_018620	GTTT	2	8	31405	31412	0 %	75 %	25 %	0 %	407454838
87	NC_018620	TTTC	2	8	31645	31652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018620	TCTA	2	8	32049	32056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018620	AATT	2	8	32373	32380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018620	TTAA	2	8	32413	32420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018620	ATTT	2	8	32428	32435	25 %	75 %	0 %	0 %	407454840
92	NC_018620	TTGT	2	8	32454	32461	0 %	75 %	25 %	0 %	407454840
93	NC_018620	TAGA	2	8	32660	32667	50 %	25 %	25 %	0 %	407454840
94	NC_018620	TTTA	2	8	33114	33121	25 %	75 %	0 %	0 %	407454840
95	NC_018620	TTAA	2	8	33509	33516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018620	AGAT	2	8	33552	33559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018620	TTAG	2	8	33607	33614	25 %	50 %	25 %	0 %	407454841
98	NC_018620	TGAA	2	8	34011	34018	50 %	25 %	25 %	0 %	407454842
99	NC_018620	GTAC	2	8	34089	34096	25 %	25 %	25 %	25 %	407454842
100	NC_018620	GATA	2	8	34125	34132	50 %	25 %	25 %	0 %	407454842
101	NC_018620	TCTT	2	8	34385	34392	0 %	75 %	0 %	25 %	407454843
102	NC_018620	AGGA	2	8	35337	35344	50 %	0 %	50 %	0 %	407454843
103	NC_018620	TAAT	2	8	36125	36132	50 %	50 %	0 %	0 %	407454844
104	NC_018620	CGCT	2	8	36841	36848	0 %	25 %	25 %	50 %	407454844
105	NC_018620	TCAA	2	8	37774	37781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018620	AAAG	2	8	38196	38203	75 %	0 %	25 %	0 %	407454845
107	NC_018620	TAAT	2	8	38212	38219	50 %	50 %	0 %	0 %	407454845
108	NC_018620	TCAA	2	8	38348	38355	50 %	25 %	0 %	25 %	407454845
109	NC_018620	TTTA	2	8	38681	38688	25 %	75 %	0 %	0 %	407454845
110	NC_018620	CTTT	2	8	38811	38818	0 %	75 %	0 %	25 %	407454845
111	NC_018620	AGCG	2	8	39000	39007	25 %	0 %	50 %	25 %	407454845
112	NC_018620	GAAA	2	8	41237	41244	75 %	0 %	25 %	0 %	407454848
113	NC_018620	AGCA	2	8	41408	41415	50 %	0 %	25 %	25 %	407454848
114	NC_018620	CTGT	2	8	41876	41883	0 %	50 %	25 %	25 %	407454848
115	NC_018620	TCTT	2	8	41916	41923	0 %	75 %	0 %	25 %	407454848
116	NC_018620	GAAG	2	8	42327	42334	50 %	0 %	50 %	0 %	407454848
117	NC_018620	AATA	2	8	42358	42365	75 %	25 %	0 %	0 %	407454848
118	NC_018620	GAAA	2	8	43495	43502	75 %	0 %	25 %	0 %	407454852
119	NC_018620	GTCG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018620	TTAA	2	8	44223	44230	50 %	50 %	0 %	0 %	407454853
121	NC_018620	ATCA	2	8	44812	44819	50 %	25 %	0 %	25 %	407454853
122	NC_018620	ATGA	2	8	45090	45097	50 %	25 %	25 %	0 %	407454853
123	NC_018620	TAAA	2	8	45989	45996	75 %	25 %	0 %	0 %	407454854
124	NC_018620	GAAA	2	8	46971	46978	75 %	0 %	25 %	0 %	407454856
125	NC_018620	TCTT	2	8	47077	47084	0 %	75 %	0 %	25 %	407454856
126	NC_018620	GCTT	2	8	47606	47613	0 %	50 %	25 %	25 %	407454856
127	NC_018620	AAGA	2	8	48048	48055	75 %	0 %	25 %	0 %	407454857
128	NC_018620	TGTT	2	8	48458	48465	0 %	75 %	25 %	0 %	407454857
129	NC_018620	ATAA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018620	TAAA	2	8	49695	49702	75 %	25 %	0 %	0 %	407454858
131	NC_018620	AAGC	2	8	49724	49731	50 %	0 %	25 %	25 %	407454858
132	NC_018620	CCAA	2	8	49748	49755	50 %	0 %	0 %	50 %	407454858
133	NC_018620	TTCC	2	8	49895	49902	0 %	50 %	0 %	50 %	407454858
134	NC_018620	AACA	2	8	50872	50879	75 %	0 %	0 %	25 %	407454858
135	NC_018620	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018620	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018620	GAAG	2	8	52719	52726	50 %	0 %	50 %	0 %	407454859
138	NC_018620	ATCC	2	8	53025	53032	25 %	25 %	0 %	50 %	407454860
139	NC_018620	AGCA	2	8	53317	53324	50 %	0 %	25 %	25 %	407454860
140	NC_018620	TTCA	2	8	53477	53484	25 %	50 %	0 %	25 %	407454860
141	NC_018620	GTAT	2	8	54130	54137	25 %	50 %	25 %	0 %	407454861
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143	NC_018620	AAAG	2	8	54782	54789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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