MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 15382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454813
4	NC_018620	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454813
5	NC_018620	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454813
6	NC_018620	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454813
7	NC_018620	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454813
8	NC_018620	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454813
9	NC_018620	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454813
10	NC_018620	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454813
11	NC_018620	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454813
12	NC_018620	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454813
13	NC_018620	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454813
14	NC_018620	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454813
15	NC_018620	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454813
16	NC_018620	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454813
17	NC_018620	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454813
18	NC_018620	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018620	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454814
21	NC_018620	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454814
22	NC_018620	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454814
23	NC_018620	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454814
24	NC_018620	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454814
25	NC_018620	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454814
26	NC_018620	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454814
27	NC_018620	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454814
28	NC_018620	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454814
29	NC_018620	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454814
30	NC_018620	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454814
31	NC_018620	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454814
32	NC_018620	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454814
33	NC_018620	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454814
34	NC_018620	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454814
35	NC_018620	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454814
36	NC_018620	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454814
37	NC_018620	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454815
38	NC_018620	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454815
39	NC_018620	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454815
40	NC_018620	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454815
41	NC_018620	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454815
42	NC_018620	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454815
43	NC_018620	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454815
44	NC_018620	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454815
45	NC_018620	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018620	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018620	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018620	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
49	NC_018620	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454816
50	NC_018620	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454816
51	NC_018620	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454816
52	NC_018620	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454816
53	NC_018620	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454816
54	NC_018620	AAG	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
55	NC_018620	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
56	NC_018620	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454816
57	NC_018620	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
58	NC_018620	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454816
59	NC_018620	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454816
60	NC_018620	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
61	NC_018620	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454816
62	NC_018620	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454816
63	NC_018620	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454816
64	NC_018620	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454816
65	NC_018620	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
66	NC_018620	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
67	NC_018620	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454816
68	NC_018620	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
69	NC_018620	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454816
70	NC_018620	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454816
71	NC_018620	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454816
72	NC_018620	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018620	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454817
75	NC_018620	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454817
76	NC_018620	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454817
77	NC_018620	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454817
78	NC_018620	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454817
79	NC_018620	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454817
80	NC_018620	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454817
81	NC_018620	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454817
82	NC_018620	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454817
83	NC_018620	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454817
84	NC_018620	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454817
85	NC_018620	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454817
86	NC_018620	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454817
87	NC_018620	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454817
88	NC_018620	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454817
89	NC_018620	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454817
90	NC_018620	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454817
91	NC_018620	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454817
92	NC_018620	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454817
93	NC_018620	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454817
94	NC_018620	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454817
95	NC_018620	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454817
96	NC_018620	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454817
97	NC_018620	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454817
98	NC_018620	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454817
99	NC_018620	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018620	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454819
101	NC_018620	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454819
102	NC_018620	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454819
103	NC_018620	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454819
104	NC_018620	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454819
105	NC_018620	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454819
106	NC_018620	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454819
107	NC_018620	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454819
108	NC_018620	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454819
109	NC_018620	CCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454819
110	NC_018620	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454819
111	NC_018620	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454819
112	NC_018620	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454819
113	NC_018620	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454819
114	NC_018620	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454819
115	NC_018620	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454819
116	NC_018620	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454819
117	NC_018620	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454819
118	NC_018620	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454820
119	NC_018620	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454820
120	NC_018620	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454820
121	NC_018620	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454820
122	NC_018620	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454820
123	NC_018620	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454820
124	NC_018620	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454820
125	NC_018620	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454820
126	NC_018620	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454820
127	NC_018620	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454820
128	NC_018620	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454820
129	NC_018620	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454820
130	NC_018620	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454821
131	NC_018620	CAT	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454821
132	NC_018620	TTC	2	6	9022	9027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454821
133	NC_018620	GAA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454821
134	NC_018620	GAG	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454821
135	NC_018620	AGT	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454821
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140	NC_018620	GCA	2	6	9996	10001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454821
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143	NC_018620	TCT	2	6	10145	10150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454821
144	NC_018620	GAA	2	6	10253	10258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454821
145	NC_018620	AAG	2	6	10346	10351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454821
146	NC_018620	TAA	2	6	10405	10410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454821
147	NC_018620	TGG	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454821
148	NC_018620	ATG	2	6	10591	10596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454821
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153	NC_018620	ATT	2	6	11159	11164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454822
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162	NC_018620	TCG	2	6	11718	11723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454822
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168	NC_018620	TAG	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454822
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189	NC_018620	TAG	2	6	13796	13801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454822
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231	NC_018620	AAT	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018620	TTA	2	6	16930	16935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_018620	AAT	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018620	GAA	2	6	17105	17110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454827
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250	NC_018620	TAA	2	6	18575	18580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454829
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256	NC_018620	AAG	2	6	19559	19564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454830
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258	NC_018620	GAA	2	6	19573	19578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454830
259	NC_018620	TCA	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454830
260	NC_018620	CTT	2	6	19651	19656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454830
261	NC_018620	CAA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454830
262	NC_018620	CGT	2	6	19801	19806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454830
263	NC_018620	TGC	2	6	19839	19844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454830
264	NC_018620	GTT	2	6	19877	19882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454830
265	NC_018620	GTT	2	6	20026	20031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454830
266	NC_018620	TAC	2	6	20085	20090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454830
267	NC_018620	ATC	2	6	20136	20141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454830
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271	NC_018620	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_018620	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018620	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018620	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_018620	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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378	NC_018620	TTA	2	6	26821	26826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454834
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382	NC_018620	TAA	2	6	26970	26975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454834
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