MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 1371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018620	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018620	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018620	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018620	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018620	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018620	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018620	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018620	CAA	2	6	13984	13989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018620	TCT	2	6	14034	14039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018620	AAT	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018620	TTA	2	6	16930	16935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	AAT	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018620	TCC	2	6	18548	18553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018620	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018620	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018620	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018620	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018620	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018620	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018620	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018620	TGA	3	9	23843	23851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018620	AAG	2	6	23888	23893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018620	CTA	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018620	TTG	2	6	24013	24018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018620	CTG	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018620	AGT	2	6	24067	24072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018620	TTG	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018620	TCC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018620	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018620	TTC	2	6	26612	26617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018620	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018620	AGG	2	6	31739	31744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018620	AGA	2	6	31962	31967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018620	CTT	2	6	31977	31982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018620	AAT	2	6	32402	32407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	TTA	2	6	33423	33428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018620	AAG	2	6	33444	33449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018620	TGT	3	9	33523	33531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018620	AAG	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018620	TGG	2	6	34225	34230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018620	TTC	2	6	37584	37589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018620	TTC	2	6	37625	37630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018620	TGC	2	6	37673	37678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018620	AGA	2	6	37863	37868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018620	TAT	2	6	38098	38103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018620	GAA	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018620	TTA	2	6	42380	42385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018620	GAA	2	6	42402	42407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018620	AGT	2	6	42691	42696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018620	CAA	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018620	GTT	2	6	43443	43448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018620	GAC	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018620	ACG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018620	GTC	2	6	44211	44216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018620	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018620	GAT	2	6	52225	52230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018620	TCG	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018620	TTG	2	6	52307	52312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018620	GTC	2	6	52411	52416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018620	AAG	2	6	52511	52516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018620	AAT	2	6	54525	54530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018620	TCA	2	6	56015	56020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018620	GTT	2	6	57776	57781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018620	TGG	2	6	57856	57861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018620	TAA	2	6	57966	57971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018620	GGC	2	6	59411	59416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018620	GAG	2	6	59470	59475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018620	ATT	2	6	59519	59524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018620	TTA	2	6	59546	59551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	TAA	2	6	59620	59625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018620	CTA	2	6	59936	59941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018620	TTG	2	6	64340	64345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018620	AGA	2	6	64367	64372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018620	AAT	2	6	64404	64409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018620	AAT	2	6	64598	64603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018620	TGT	2	6	66114	66119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018620	ATT	2	6	66139	66144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018620	ATA	2	6	71200	71205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018620	TTA	3	9	74052	74060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018620	ATC	2	6	76049	76054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018620	TCA	2	6	77374	77379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018620	TTC	2	6	77451	77456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018620	TAT	2	6	77483	77488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018620	TAT	2	6	77742	77747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018620	TTC	2	6	80537	80542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018620	AAT	2	6	80559	80564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018620	TTA	2	6	83393	83398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018620	AAT	2	6	83400	83405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018620	AGT	2	6	83413	83418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018620	GTT	2	6	87351	87356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018620	AGA	2	6	93485	93490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018620	AAG	2	6	93522	93527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018620	TAA	2	6	93529	93534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018620	AAT	2	6	93608	93613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018620	TTG	2	6	93646	93651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018620	GGT	2	6	93655	93660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018620	GTT	2	6	93925	93930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018620	AAG	2	6	98637	98642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018620	TCT	2	6	98909	98914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018620	GCT	2	6	99183	99188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018620	ACA	2	6	99239	99244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018620	ATG	2	6	99341	99346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018620	ATA	2	6	99394	99399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018620	GTT	2	6	99427	99432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018620	ACT	2	6	99499	99504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018620	ATC	2	6	99521	99526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018620	TAG	2	6	99555	99560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018620	TTC	2	6	99660	99665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018620	ACT	2	6	101698	101703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018620	CAA	2	6	101748	101753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018620	TCT	2	6	108283	108288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018620	AAC	2	6	108403	108408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018620	AGA	2	6	109102	109107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018620	GAA	2	6	110153	110158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018620	ATT	2	6	112344	112349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018620	TAC	2	6	118304	118309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018620	GAG	2	6	119125	119130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018620	ACT	2	6	120726	120731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018620	TCT	2	6	122610	122615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018620	AAT	2	6	122736	122741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018620	ATT	2	6	122756	122761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018620	TGG	2	6	122769	122774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018620	GCG	2	6	123094	123099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018620	TTC	3	9	123157	123165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018620	TCC	2	6	125258	125263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018620	TAC	2	6	125270	125275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018620	TGT	2	6	125277	125282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018620	AAT	2	6	125733	125738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018620	ATT	2	6	128276	128281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018620	TTA	2	6	128311	128316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018620	TGT	2	6	128507	128512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018620	ACA	2	6	128579	128584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018620	TAC	2	6	128595	128600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018620	CTT	2	6	130330	130335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018620	ATT	2	6	130437	130442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018620	AGG	2	6	130457	130462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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