MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	ATTTAA	2	12	33596	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	TTTTAA	2	12	42718	42729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018619	ATTATA	2	12	77756	77767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018619	TTTCTT	2	12	123027	123038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018619	TTCCGT	2	12	148015	148026	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018619	AGAAAA	2	12	163046	163057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018619	TTTTTA	2	12	210466	210477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018619	TAAAGA	2	12	226819	226830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018619	ATTATA	2	12	239689	239700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018619	TTGAAT	2	12	244002	244013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018619	ATATAA	2	12	261751	261762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018619	GGGAAA	2	12	267716	267727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018619	TATTTC	2	12	271248	271259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018619	TAAGAA	2	12	277633	277644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018619	TAAAAT	2	12	291636	291647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018619	TGAAAA	2	12	337011	337022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018619	AAAATC	2	12	396396	396407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018619	AAAAAT	2	12	470349	470360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018619	TATAAT	2	12	489835	489846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018619	TTTTCT	2	12	501933	501944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018619	TTAATT	2	12	507529	507540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018619	CTTTTG	2	12	656226	656237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018619	AAATAC	2	12	661782	661793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018619	CAATCT	2	12	662368	662379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018619	TCCATT	2	12	680415	680426	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018619	AAGGGA	2	12	703463	703474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018619	ATTAAT	2	12	706153	706164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018619	TAAAAG	2	12	739691	739702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018619	ATTTTA	2	12	752383	752394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018619	TAACCT	2	12	793760	793771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018619	TTTAGC	2	12	804868	804879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018619	CTATGT	2	12	814046	814057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018619	TTTTCC	2	12	846451	846462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018619	TTTTTA	2	12	860767	860778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018619	ATTTTA	2	12	951196	951207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018619	ATCTAT	2	12	966483	966494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018619	ATAAAA	2	12	982930	982941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018619	TTTTCT	2	12	1013887	1013898	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018619	AAATAA	2	12	1019109	1019120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018619	TCGCTT	2	12	1021968	1021979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018619	TTATCC	2	12	1022872	1022883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018619	AAATTT	2	12	1025012	1025023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018619	CTTTGT	2	12	1036454	1036465	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018619	AAAAAT	2	12	1056728	1056739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018619	TAATTT	2	12	1103353	1103364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018619	AAAATA	2	12	1141857	1141868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018619	TACAGA	2	12	1154533	1154544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018619	GTTAAA	2	12	1167460	1167471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018619	CCTTCG	2	12	1170250	1170261	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.