MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 3027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	407453477
3	NC_018619	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	407453478
4	NC_018619	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	407453478
5	NC_018619	TGTT	2	8	2839	2846	0 %	75 %	25 %	0 %	407453479
6	NC_018619	GAAG	2	8	2950	2957	50 %	0 %	50 %	0 %	407453479
7	NC_018619	AGTA	2	8	2980	2987	50 %	25 %	25 %	0 %	407453479
8	NC_018619	TTTG	2	8	3298	3305	0 %	75 %	25 %	0 %	407453480
9	NC_018619	TCCT	2	8	3324	3331	0 %	50 %	0 %	50 %	407453480
10	NC_018619	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407453481
11	NC_018619	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018619	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407453482
13	NC_018619	TAAT	2	8	6731	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	407453483
14	NC_018619	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018619	AGAA	2	8	6963	6970	75 %	0 %	25 %	0 %	407453484
16	NC_018619	TCCC	2	8	7280	7287	0 %	25 %	0 %	75 %	407453484
17	NC_018619	GTAG	2	8	7314	7321	25 %	25 %	50 %	0 %	407453484
18	NC_018619	AATA	2	8	8011	8018	75 %	25 %	0 %	0 %	407453485
19	NC_018619	ATGA	2	8	8482	8489	50 %	25 %	25 %	0 %	407453485
20	NC_018619	TGGA	2	8	8670	8677	25 %	25 %	50 %	0 %	407453485
21	NC_018619	CTGT	2	8	8680	8687	0 %	50 %	25 %	25 %	407453485
22	NC_018619	ATTT	2	8	9402	9409	25 %	75 %	0 %	0 %	407453485
23	NC_018619	AAAG	2	8	10226	10233	75 %	0 %	25 %	0 %	407453485
24	NC_018619	AAGT	2	8	10525	10532	50 %	25 %	25 %	0 %	407453485
25	NC_018619	AGGG	2	8	10764	10771	25 %	0 %	75 %	0 %	407453485
26	NC_018619	TAAG	2	8	10774	10781	50 %	25 %	25 %	0 %	407453485
27	NC_018619	AAAG	2	8	11067	11074	75 %	0 %	25 %	0 %	407453486
28	NC_018619	AGTA	2	8	11725	11732	50 %	25 %	25 %	0 %	407453486
29	NC_018619	TCTT	2	8	12006	12013	0 %	75 %	0 %	25 %	407453486
30	NC_018619	TAAT	2	8	12147	12154	50 %	50 %	0 %	0 %	407453486
31	NC_018619	CAAA	2	8	12458	12465	75 %	0 %	0 %	25 %	407453486
32	NC_018619	AGAT	2	8	12568	12575	50 %	25 %	25 %	0 %	407453486
33	NC_018619	AAGA	2	8	12579	12586	75 %	0 %	25 %	0 %	407453486
34	NC_018619	ACTT	2	8	12701	12708	25 %	50 %	0 %	25 %	407453486
35	NC_018619	CACT	2	8	12798	12805	25 %	25 %	0 %	50 %	407453486
36	NC_018619	GCAA	2	8	13326	13333	50 %	0 %	25 %	25 %	407453486
37	NC_018619	GAAA	2	8	13746	13753	75 %	0 %	25 %	0 %	407453486
38	NC_018619	AGAT	2	8	14315	14322	50 %	25 %	25 %	0 %	407453487
39	NC_018619	TTGT	2	8	14365	14372	0 %	75 %	25 %	0 %	407453487
40	NC_018619	GGAT	2	8	14949	14956	25 %	25 %	50 %	0 %	407453487
41	NC_018619	CCCA	2	8	15420	15427	25 %	0 %	0 %	75 %	407453487
42	NC_018619	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018619	AGAA	2	8	17164	17171	75 %	0 %	25 %	0 %	407453489
44	NC_018619	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018619	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018619	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	407453491
47	NC_018619	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	407453491
48	NC_018619	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	407453491
49	NC_018619	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	407453493
50	NC_018619	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	407453493
51	NC_018619	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	407453493
52	NC_018619	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	407453493
53	NC_018619	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	407453493
54	NC_018619	TGGT	2	8	20447	20454	0 %	50 %	50 %	0 %	407453495
55	NC_018619	TAAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	407453495
56	NC_018619	TATG	2	8	21586	21593	25 %	50 %	25 %	0 %	407453495
57	NC_018619	CAAT	2	8	22280	22287	50 %	25 %	0 %	25 %	407453496
58	NC_018619	AGAA	2	8	22697	22704	75 %	0 %	25 %	0 %	407453496
59	NC_018619	TGAT	2	8	22904	22911	25 %	50 %	25 %	0 %	407453496
60	NC_018619	AGCT	2	8	24165	24172	25 %	25 %	25 %	25 %	407453497
61	NC_018619	AAAT	2	8	24502	24509	75 %	25 %	0 %	0 %	407453497
62	NC_018619	AATT	2	8	24627	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	407453497
63	NC_018619	ATAA	2	8	24694	24701	75 %	25 %	0 %	0 %	407453497
64	NC_018619	TTCT	2	8	24925	24932	0 %	75 %	0 %	25 %	407453497
65	NC_018619	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407453497
66	NC_018619	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407453497
67	NC_018619	ATTC	2	8	25881	25888	25 %	50 %	0 %	25 %	407453497
68	NC_018619	TTTC	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	407453497
69	NC_018619	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407453497
70	NC_018619	TAAA	2	8	26472	26479	75 %	25 %	0 %	0 %	407453497
71	NC_018619	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	407453498
72	NC_018619	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	407453498
73	NC_018619	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407453499
74	NC_018619	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407453499
75	NC_018619	AAAT	2	8	28807	28814	75 %	25 %	0 %	0 %	407453499
76	NC_018619	GGCA	2	8	29085	29092	25 %	0 %	50 %	25 %	407453499
77	NC_018619	AGGG	2	8	29430	29437	25 %	0 %	75 %	0 %	407453500
78	NC_018619	GAAT	2	8	29624	29631	50 %	25 %	25 %	0 %	407453501
79	NC_018619	AGAA	2	8	29789	29796	75 %	0 %	25 %	0 %	407453501
80	NC_018619	ACCA	2	8	30239	30246	50 %	0 %	0 %	50 %	407453501
81	NC_018619	GTTT	2	8	31410	31417	0 %	75 %	25 %	0 %	407453503
82	NC_018619	TTTC	2	8	31650	31657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018619	TCTA	2	8	32054	32061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018619	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018619	TTAA	2	8	32418	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018619	ATTT	2	8	32433	32440	25 %	75 %	0 %	0 %	407453505
87	NC_018619	TTGT	2	8	32459	32466	0 %	75 %	25 %	0 %	407453505
88	NC_018619	TAGA	2	8	32665	32672	50 %	25 %	25 %	0 %	407453505
89	NC_018619	TTTA	2	8	33119	33126	25 %	75 %	0 %	0 %	407453505
90	NC_018619	TTAA	2	8	33514	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018619	AGAT	2	8	33557	33564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018619	TGAA	2	8	34016	34023	50 %	25 %	25 %	0 %	407453507
93	NC_018619	GTAC	2	8	34094	34101	25 %	25 %	25 %	25 %	407453507
94	NC_018619	GATA	2	8	34130	34137	50 %	25 %	25 %	0 %	407453507
95	NC_018619	TCTT	2	8	34390	34397	0 %	75 %	0 %	25 %	407453508
96	NC_018619	AGGA	2	8	35342	35349	50 %	0 %	50 %	0 %	407453508
97	NC_018619	TAAT	2	8	36130	36137	50 %	50 %	0 %	0 %	407453509
98	NC_018619	CGCT	2	8	36846	36853	0 %	25 %	25 %	50 %	407453509
99	NC_018619	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018619	AAAG	2	8	38201	38208	75 %	0 %	25 %	0 %	407453510
101	NC_018619	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	407453510
102	NC_018619	TCAA	2	8	38353	38360	50 %	25 %	0 %	25 %	407453510
103	NC_018619	TTTA	2	8	38686	38693	25 %	75 %	0 %	0 %	407453510
104	NC_018619	CTTT	2	8	38816	38823	0 %	75 %	0 %	25 %	407453510
105	NC_018619	AGCG	2	8	39005	39012	25 %	0 %	50 %	25 %	407453510
106	NC_018619	CCTG	2	8	40300	40307	0 %	25 %	25 %	50 %	407453513
107	NC_018619	GAAA	2	8	41241	41248	75 %	0 %	25 %	0 %	407453513
108	NC_018619	AGCA	2	8	41412	41419	50 %	0 %	25 %	25 %	407453513
109	NC_018619	CTGT	2	8	41880	41887	0 %	50 %	25 %	25 %	407453513
110	NC_018619	TCTT	2	8	41920	41927	0 %	75 %	0 %	25 %	407453513
111	NC_018619	GAAG	2	8	42331	42338	50 %	0 %	50 %	0 %	407453513
112	NC_018619	AATA	2	8	42362	42369	75 %	25 %	0 %	0 %	407453513
113	NC_018619	GAAA	2	8	43499	43506	75 %	0 %	25 %	0 %	407453517
114	NC_018619	GTCG	2	8	44197	44204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018619	TTAA	2	8	44227	44234	50 %	50 %	0 %	0 %	407453518
116	NC_018619	ATCA	2	8	44816	44823	50 %	25 %	0 %	25 %	407453518
117	NC_018619	ATGA	2	8	45094	45101	50 %	25 %	25 %	0 %	407453518
118	NC_018619	TAAA	2	8	45993	46000	75 %	25 %	0 %	0 %	407453519
119	NC_018619	GAAA	2	8	46975	46982	75 %	0 %	25 %	0 %	407453521
120	NC_018619	TCTT	2	8	47081	47088	0 %	75 %	0 %	25 %	407453521
121	NC_018619	GCTT	2	8	47610	47617	0 %	50 %	25 %	25 %	407453521
122	NC_018619	AAGA	2	8	48052	48059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018619	TGTT	2	8	48462	48469	0 %	75 %	25 %	0 %	407453522
124	NC_018619	ATAA	2	8	49529	49536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018619	TAAA	2	8	49698	49705	75 %	25 %	0 %	0 %	407453524
126	NC_018619	AAGC	2	8	49727	49734	50 %	0 %	25 %	25 %	407453524
127	NC_018619	CCAA	2	8	49751	49758	50 %	0 %	0 %	50 %	407453524
128	NC_018619	TTCC	2	8	49898	49905	0 %	50 %	0 %	50 %	407453524
129	NC_018619	AACA	2	8	50875	50882	75 %	0 %	0 %	25 %	407453524
130	NC_018619	AAAG	2	8	52609	52616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018619	TTTA	2	8	52619	52626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018619	GAAG	2	8	52722	52729	50 %	0 %	50 %	0 %	407453525
133	NC_018619	ATCC	2	8	53028	53035	25 %	25 %	0 %	50 %	407453526
134	NC_018619	AGCA	2	8	53320	53327	50 %	0 %	25 %	25 %	407453526
135	NC_018619	TTCA	2	8	53480	53487	25 %	50 %	0 %	25 %	407453526
136	NC_018619	GTAT	2	8	54133	54140	25 %	50 %	25 %	0 %	407453527
137	NC_018619	CATA	2	8	54328	54335	50 %	25 %	0 %	25 %	407453527
138	NC_018619	AAAG	2	8	54787	54794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018619	TAGC	2	8	55859	55866	25 %	25 %	25 %	25 %	407453529
140	NC_018619	CTGT	2	8	56038	56045	0 %	50 %	25 %	25 %	407453529
141	NC_018619	CTTT	2	8	56428	56435	0 %	75 %	0 %	25 %	407453530
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