MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 15778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018619	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018619	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018619	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018619	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453477
7	NC_018619	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453477
8	NC_018619	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453477
9	NC_018619	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453477
10	NC_018619	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453477
11	NC_018619	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453477
12	NC_018619	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453477
13	NC_018619	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453477
14	NC_018619	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453477
15	NC_018619	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453477
16	NC_018619	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453477
17	NC_018619	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453477
18	NC_018619	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018619	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018619	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
21	NC_018619	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453478
22	NC_018619	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
23	NC_018619	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453478
24	NC_018619	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
25	NC_018619	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
26	NC_018619	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453478
27	NC_018619	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
28	NC_018619	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453478
29	NC_018619	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
30	NC_018619	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453478
31	NC_018619	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
32	NC_018619	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
33	NC_018619	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453478
34	NC_018619	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
35	NC_018619	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453478
36	NC_018619	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453478
37	NC_018619	AGT	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453479
38	NC_018619	TTA	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
39	NC_018619	TCC	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453479
40	NC_018619	TTC	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453479
41	NC_018619	TTA	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
42	NC_018619	AGA	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453479
43	NC_018619	TAT	2	6	2970	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
44	NC_018619	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
45	NC_018619	TAT	2	6	3056	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018619	ATT	3	9	3071	3079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018619	TGT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018619	GAA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453480
49	NC_018619	ATG	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453480
50	NC_018619	AGT	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453480
51	NC_018619	CTT	2	6	3541	3546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453480
52	NC_018619	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453480
53	NC_018619	ATG	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
54	NC_018619	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453481
55	NC_018619	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453481
56	NC_018619	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
57	NC_018619	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453481
58	NC_018619	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
59	NC_018619	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453481
60	NC_018619	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453481
61	NC_018619	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
62	NC_018619	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453481
63	NC_018619	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
64	NC_018619	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
65	NC_018619	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453481
66	NC_018619	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
67	NC_018619	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
68	NC_018619	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453481
69	NC_018619	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
70	NC_018619	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
71	NC_018619	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453481
72	NC_018619	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453481
73	NC_018619	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018619	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018619	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453482
76	NC_018619	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453482
77	NC_018619	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453482
78	NC_018619	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
79	NC_018619	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
80	NC_018619	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
81	NC_018619	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
82	NC_018619	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453482
83	NC_018619	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
84	NC_018619	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
85	NC_018619	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
86	NC_018619	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
87	NC_018619	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
88	NC_018619	GCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453482
89	NC_018619	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453482
90	NC_018619	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
91	NC_018619	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453482
92	NC_018619	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453482
93	NC_018619	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453482
94	NC_018619	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453482
95	NC_018619	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453482
96	NC_018619	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
97	NC_018619	ACA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
98	NC_018619	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453482
99	NC_018619	CAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
100	NC_018619	GAA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018619	GAA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453484
102	NC_018619	CAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453484
103	NC_018619	ACA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453484
104	NC_018619	GTG	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453484
105	NC_018619	TGT	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453484
106	NC_018619	TTC	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453484
107	NC_018619	GTT	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453484
108	NC_018619	CAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453484
109	NC_018619	AGA	2	6	7169	7174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453484
110	NC_018619	TAA	2	6	7252	7257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453484
111	NC_018619	TTG	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453484
112	NC_018619	CTC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453484
113	NC_018619	GGA	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453484
114	NC_018619	TGA	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453484
115	NC_018619	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453484
116	NC_018619	TGC	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453484
117	NC_018619	TTC	2	6	7891	7896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453484
118	NC_018619	TTG	2	6	8053	8058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453485
119	NC_018619	TGC	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453485
120	NC_018619	AAG	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453485
121	NC_018619	TTA	2	6	8252	8257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453485
122	NC_018619	CTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453485
123	NC_018619	GAA	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453485
124	NC_018619	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453485
125	NC_018619	TTC	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453485
126	NC_018619	AGG	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453485
127	NC_018619	CCT	2	6	8766	8771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453485
128	NC_018619	AAG	2	6	8814	8819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453485
129	NC_018619	GTT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453485
130	NC_018619	GAA	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453485
131	NC_018619	CAT	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453485
132	NC_018619	TTC	2	6	9022	9027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453485
133	NC_018619	GAA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453485
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230	NC_018619	AAT	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_018619	TAA	2	6	18575	18580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453492
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254	NC_018619	ATA	2	6	19565	19570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453493
255	NC_018619	GAA	2	6	19573	19578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453493
256	NC_018619	TCA	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453493
257	NC_018619	CTT	2	6	19651	19656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453493
258	NC_018619	CAA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453493
259	NC_018619	CGT	2	6	19801	19806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453493
260	NC_018619	TGC	2	6	19839	19844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453493
261	NC_018619	GTT	2	6	19877	19882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453493
262	NC_018619	GTT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453494
263	NC_018619	TAC	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453494
264	NC_018619	ATC	2	6	20135	20140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453494
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271	NC_018619	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_018619	TAA	2	6	21785	21790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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