MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018618	TGTAGT	2	12	20420	20431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018618	ACATGA	2	12	21708	21719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018618	AGGAAC	3	18	25421	25438	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018618	AGGAAT	2	12	25439	25450	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018618	TGTAAG	2	12	25543	25554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018618	TGCTCT	4	24	28721	28744	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018618	TGTTAT	2	12	28745	28756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018618	TAAAAT	2	12	30706	30717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018618	AACTTT	2	12	33567	33578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018618	ATTTTG	2	12	37744	37755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018618	TACAAC	2	12	37815	37826	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018618	TAACAT	2	12	38612	38623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018618	ACGTTA	3	18	41909	41926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018618	AAAAAG	2	12	49133	49144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018618	CAATAC	2	12	60563	60574	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018618	TTAAGC	2	12	60652	60663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018618	AACAAA	3	18	61495	61512	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018618	TCTACA	2	12	66742	66753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018618	AAAGAA	2	12	67060	67071	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018618	TAAACA	2	12	68003	68014	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018618	AAATAA	2	12	85713	85724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018618	ATTGGT	2	12	105357	105368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018618	ACTAAT	2	12	112501	112512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018618	ATAGTA	2	12	118551	118562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018618	TAGTGG	3	18	118564	118581	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018618	TGTTAA	2	12	123464	123475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018618	GTTAAT	2	12	123778	123789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018618	ATAAAA	2	12	124408	124419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018618	CTAAAA	2	12	124420	124431	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018618	CTAATA	2	12	124432	124443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018618	CTGACA	2	12	126216	126227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018618	TGAAAT	2	12	129143	129154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018618	TAATTT	2	12	129312	129323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018618	ATGTAT	2	12	130625	130636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018618	AAAAAC	2	12	133643	133654	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018618	TAGGAG	2	12	153983	153994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018618	TTTTTG	2	12	154130	154141	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018618	AACCAC	3	18	154257	154274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018618	AACCAA	2	12	154275	154286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018618	AAACCC	2	12	154323	154334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018618	ATTACT	2	12	154992	155003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018618	GTTGTG	4	24	158530	158553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018618	TTAAAG	2	12	163588	163599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018618	TACTGT	2	12	163992	164003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018618	CTGTTG	4	24	164103	164126	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018618	TAGCAG	3	18	164401	164418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018618	GTTAGT	3	18	170929	170946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018618	AAAGAA	2	12	172692	172703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018618	ATTTGT	2	12	179734	179745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018618	TATTAG	3	18	179983	180000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018618	ACAGTT	4	24	180081	180104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018618	GCCGTT	3	18	180105	180122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018618	TTTAGT	2	12	188608	188619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018618	CTGTTT	2	12	188932	188943	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018618	TTTGTT	2	12	189298	189309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018618	TTTATT	2	12	192089	192100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018618	ACTGTT	2	12	192106	192117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018618	CATTAG	2	12	228653	228664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018618	TAAAAA	2	12	229849	229860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018618	ATAACA	2	12	234998	235009	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018618	TTATTT	2	12	243763	243774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018618	TTTTAT	2	12	243891	243902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018618	TTATAT	2	12	246674	246685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018618	TGTTAT	2	12	246686	246697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018618	TTTTTA	2	12	246976	246987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018618	GTTTTT	2	12	248533	248544	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018618	GCTAAT	4	24	251018	251041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018618	TTTTAG	2	12	252513	252524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018618	TTTTGT	2	12	252537	252548	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018618	AGTTGT	2	12	258311	258322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018618	GATGTT	2	12	258838	258849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018618	ATTTAA	2	12	263186	263197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018618	TATTTG	2	12	265344	265355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018618	GAATTT	2	12	265879	265890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018618	ATTAAA	2	12	274545	274556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018618	ATTTAT	2	12	274799	274810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018618	AACAAA	2	12	275706	275717	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018618	TTTTCT	2	12	276010	276021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018618	TAATTA	2	12	276507	276518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018618	AAAAAG	2	12	276874	276885	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018618	TTATTT	2	12	278502	278513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018618	GTTATT	2	12	278957	278968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018618	GATTTT	2	12	279801	279812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018618	ATCTTT	3	18	279813	279830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018618	ATTGTT	2	12	279831	279842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018618	TTTTTA	2	12	279920	279931	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018618	TAAATG	2	12	280063	280074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018618	TTTTAT	2	12	283612	283623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018618	GAATTA	2	12	288344	288355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018618	TTTTTA	2	12	289346	289357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018618	ATGTTA	2	12	289766	289777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018618	TAAAAG	2	12	306095	306106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018618	GTTGAG	4	24	325848	325871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018618	GTTTAG	3	18	325872	325889	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018618	ACAGAA	2	12	326273	326284	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018618	GTAAAC	2	12	326297	326308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018618	TCCCCT	3	18	329403	329420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018618	ATAACA	2	12	330550	330561	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018618	TACAAA	2	12	330656	330667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018618	TTTTAA	2	12	331453	331464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018618	TACTTT	2	12	331763	331774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018618	ACCTAT	2	12	336972	336983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018618	TGAATT	2	12	340579	340590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018618	TCTTGT	2	12	344166	344177	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018618	AGTGTT	2	12	355255	355266	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018618	TAGCAG	2	12	356847	356858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018618	TAGGAG	3	18	356859	356876	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.