MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407453021
2	NC_018618	AGATAA	2	12	4393	4404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453022
3	NC_018618	CCTATA	2	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453022
4	NC_018618	TGCATT	2	12	4793	4804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407453022
5	NC_018618	ATTAAA	2	12	5495	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
6	NC_018618	TTCCTG	2	12	6023	6034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407453023
7	NC_018618	TAAAAA	2	12	6795	6806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453023
8	NC_018618	TAAATA	2	12	7367	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
9	NC_018618	AAAATA	2	12	7492	7503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453024
10	NC_018618	AGATAA	2	12	7943	7954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453024
11	NC_018618	CATAAA	2	12	8393	8404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453024
12	NC_018618	AAATTA	2	12	9052	9063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
13	NC_018618	AACATA	2	12	9235	9246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453025
14	NC_018618	ACCTAT	2	12	13100	13111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453029
15	NC_018618	CGATTA	2	12	13200	13211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407453029
16	NC_018618	TTTATT	2	12	19528	19539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407453036
17	NC_018618	AATTAT	2	12	24262	24273	50 %	50 %	0 %	0 %	407453037
18	NC_018618	CAGATG	2	12	24276	24287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407453037
19	NC_018618	ATTTAC	2	12	26890	26901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407453038
20	NC_018618	ATAAAA	2	12	31278	31289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453040
21	NC_018618	AGGCAT	2	12	34677	34688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407453043
22	NC_018618	AAATTT	2	12	36880	36891	50 %	50 %	0 %	0 %	407453044
23	NC_018618	AATAAA	2	12	37451	37462	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453044
24	NC_018618	AAAACA	2	12	40590	40601	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407453045
25	NC_018618	CTTTAT	2	12	41419	41430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407453046
26	NC_018618	TTTTAT	2	12	41564	41575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407453046
27	NC_018618	AAATAT	2	12	42863	42874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453049
28	NC_018618	TCCATC	2	12	46279	46290	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407453052
29	NC_018618	TAAAGT	2	12	48245	48256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407453054
30	NC_018618	ACAGCA	2	12	53391	53402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407453058
31	NC_018618	AGTAAA	2	12	53533	53544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453059
32	NC_018618	TTATAG	2	12	54239	54250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407453060
33	NC_018618	GTAAAA	2	12	55019	55030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453061
34	NC_018618	ATTTAT	2	12	56862	56873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453062
35	NC_018618	ATTTTA	2	12	59498	59509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453063
36	NC_018618	TAGAAA	2	12	64434	64445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453065
37	NC_018618	CAAATA	2	12	64833	64844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453065
38	NC_018618	ATAAAA	2	12	74780	74791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453069
39	NC_018618	TTAATA	2	12	76213	76224	50 %	50 %	0 %	0 %	407453070
40	NC_018618	AAAAAT	2	12	78561	78572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453073
41	NC_018618	AATAGT	2	12	79742	79753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407453074
42	NC_018618	TATATT	2	12	80018	80029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453074
43	NC_018618	TTAAAA	2	12	85142	85153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453080
44	NC_018618	TAAAAA	2	12	86632	86643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453082
45	NC_018618	AAAACC	2	12	94118	94129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453084
46	NC_018618	TATAAC	2	12	95125	95136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407453086
47	NC_018618	AAACGG	2	12	95310	95321	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407453086
48	NC_018618	CAGTTC	2	12	95442	95453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407453086
49	NC_018618	ATGCTA	2	12	96054	96065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407453086
50	NC_018618	ACAAAC	2	12	103132	103143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453099
51	NC_018618	TAAAAT	2	12	104836	104847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453103
52	NC_018618	AATAGT	2	12	104954	104965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407453103
53	NC_018618	AGGTAA	2	12	106738	106749	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407453106
54	NC_018618	CAGGAA	2	12	107294	107305	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407453107
55	NC_018618	ATAGAT	2	12	107488	107499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407453107
56	NC_018618	TAAAAA	2	12	107568	107579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453107
57	NC_018618	TTGCTA	2	12	110315	110326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407453112
58	NC_018618	AAATTA	2	12	113712	113723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453115
59	NC_018618	CGTAAA	2	12	113976	113987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407453116
60	NC_018618	ACAGGA	2	12	116229	116240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407453119
61	NC_018618	ATTAAA	2	12	116778	116789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453119
62	NC_018618	AAACAG	2	12	119006	119017	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407453120
63	NC_018618	ATTTTG	2	12	122371	122382	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407453123
64	NC_018618	TAAAAT	2	12	125299	125310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453126
65	NC_018618	AAAAGT	2	12	125349	125360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453126
66	NC_018618	AAAAGA	2	12	134510	134521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407453127
67	NC_018618	AAATGA	2	12	135394	135405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453127
68	NC_018618	AAGGTC	2	12	137623	137634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407453128
69	NC_018618	ATAAAA	2	12	139782	139793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453130
70	NC_018618	AAGGAA	2	12	142160	142171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453131
71	NC_018618	GTTGGG	5	30	142203	142232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453131
72	NC_018618	GTTTGG	2	12	142233	142244	0 %	50 %	50 %	0 %	407453131
73	NC_018618	AATTTA	2	12	142934	142945	50 %	50 %	0 %	0 %	407453132
74	NC_018618	TTAAAT	2	12	144292	144303	50 %	50 %	0 %	0 %	407453135
75	NC_018618	GAAGAT	2	12	149169	149180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407453138
76	NC_018618	TTTTAA	2	12	150410	150421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453140
77	NC_018618	ATTTTA	2	12	151189	151200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453140
78	NC_018618	GTGCAG	2	12	151340	151351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407453140
79	NC_018618	TATAAA	2	12	153009	153020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453142
80	NC_018618	ATTAAA	2	12	153667	153678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453143
81	NC_018618	TAAAAA	2	12	165058	165069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453150
82	NC_018618	CACTTA	2	12	165872	165883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453151
83	NC_018618	TATTTT	2	12	167552	167563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407453152
84	NC_018618	CTTTTA	2	12	173719	173730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407453154
85	NC_018618	ATAACA	2	12	174762	174773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453155
86	NC_018618	TTTATA	2	12	175092	175103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453155
87	NC_018618	ATTTTA	2	12	175290	175301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453155
88	NC_018618	CTTTTA	2	12	177270	177281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407453157
89	NC_018618	CATCTT	2	12	177936	177947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407453157
90	NC_018618	TAACTT	2	12	178351	178362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407453157
91	NC_018618	TGTTTT	2	12	178478	178489	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407453157
92	NC_018618	ATTTAA	2	12	180510	180521	50 %	50 %	0 %	0 %	407453158
93	NC_018618	TTGTTT	2	12	181770	181781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407453158
94	NC_018618	AACCTG	2	12	183026	183037	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407453159
95	NC_018618	TTTACA	2	12	184199	184210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407453160
96	NC_018618	TTAATG	2	12	184248	184259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407453160
97	NC_018618	TTTTGT	2	12	190878	190889	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407453162
98	NC_018618	CAAAAT	2	12	191683	191694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453162
99	NC_018618	AGAAGT	2	12	194356	194367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407453163
100	NC_018618	ATTTAT	2	12	195340	195351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453165
101	NC_018618	TTTGTT	2	12	204104	204115	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407453174
102	NC_018618	ATAAAC	2	12	208940	208951	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407453177
103	NC_018618	TTATAT	2	12	209502	209513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453178
104	NC_018618	ATTTAT	2	12	215890	215901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453182
105	NC_018618	GGTTTA	2	12	218350	218361	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407453184
106	NC_018618	TTTAAT	2	12	218766	218777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453184
107	NC_018618	GTTTTG	2	12	218870	218881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453184
108	NC_018618	ATGTTA	2	12	219780	219791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407453185
109	NC_018618	TTTATA	2	12	220218	220229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453185
110	NC_018618	CAAAAA	2	12	221955	221966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407453186
111	NC_018618	ATTTAT	2	12	223715	223726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453187
112	NC_018618	AATAGA	2	12	224529	224540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453187
113	NC_018618	GCAAAT	2	12	226375	226386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407453189
114	NC_018618	AGGCGG	2	12	226816	226827	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407453189
115	NC_018618	GAAAAA	2	12	227240	227251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407453189
116	NC_018618	AAATTA	2	12	229257	229268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453190
117	NC_018618	TTGTTT	2	12	237384	237395	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407453193
118	NC_018618	TTTTTA	2	12	239556	239567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407453197
119	NC_018618	TTTACC	2	12	242759	242770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407453198
120	NC_018618	TAAAAA	2	12	243266	243277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407453198
121	NC_018618	TATAAA	2	12	245590	245601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453200
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.