MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407453020
2	NC_018618	ATAAA	2	10	5548	5557	80 %	20 %	0 %	0 %	407453022
3	NC_018618	AAAAT	2	10	5816	5825	80 %	20 %	0 %	0 %	407453023
4	NC_018618	TAAAA	2	10	6860	6869	80 %	20 %	0 %	0 %	407453023
5	NC_018618	AACAA	2	10	7907	7916	80 %	0 %	0 %	20 %	407453024
6	NC_018618	CATGC	2	10	8074	8083	20 %	20 %	20 %	40 %	407453024
7	NC_018618	AAATT	2	10	8650	8659	60 %	40 %	0 %	0 %	407453024
8	NC_018618	AATAC	2	10	10275	10284	60 %	20 %	0 %	20 %	407453027
9	NC_018618	GTAAC	2	10	10330	10339	40 %	20 %	20 %	20 %	407453027
10	NC_018618	TAATA	2	10	11103	11112	60 %	40 %	0 %	0 %	407453028
11	NC_018618	ATCTA	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	407453029
12	NC_018618	TTGTT	2	10	14162	14171	0 %	80 %	20 %	0 %	407453030
13	NC_018618	CAAAA	2	10	14836	14845	80 %	0 %	0 %	20 %	407453030
14	NC_018618	TGCAT	2	10	15065	15074	20 %	40 %	20 %	20 %	407453030
15	NC_018618	ATATT	2	10	15590	15599	40 %	60 %	0 %	0 %	407453031
16	NC_018618	TAAAT	2	10	15619	15628	60 %	40 %	0 %	0 %	407453031
17	NC_018618	ATTTT	2	10	17526	17535	20 %	80 %	0 %	0 %	407453032
18	NC_018618	CATAT	2	10	17727	17736	40 %	40 %	0 %	20 %	407453033
19	NC_018618	AAACA	2	10	23845	23854	80 %	0 %	0 %	20 %	407453037
20	NC_018618	TATTT	2	10	26440	26449	20 %	80 %	0 %	0 %	407453038
21	NC_018618	TTCAT	2	10	26849	26858	20 %	60 %	0 %	20 %	407453038
22	NC_018618	TAATT	2	10	27152	27161	40 %	60 %	0 %	0 %	407453038
23	NC_018618	TACTT	2	10	27182	27191	20 %	60 %	0 %	20 %	407453038
24	NC_018618	TAAAA	2	10	27513	27522	80 %	20 %	0 %	0 %	407453038
25	NC_018618	AACAA	2	10	28331	28340	80 %	0 %	0 %	20 %	407453039
26	NC_018618	AAAAC	2	10	31654	31663	80 %	0 %	0 %	20 %	407453040
27	NC_018618	AATTT	2	10	31676	31685	40 %	60 %	0 %	0 %	407453040
28	NC_018618	TAATA	2	10	31819	31828	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
29	NC_018618	AATTA	2	10	31851	31860	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
30	NC_018618	ATAAA	2	10	35822	35831	80 %	20 %	0 %	0 %	407453043
31	NC_018618	TTGTT	2	10	36703	36712	0 %	80 %	20 %	0 %	407453044
32	NC_018618	GAAAA	2	10	37388	37397	80 %	0 %	20 %	0 %	407453044
33	NC_018618	ACAAA	2	10	40648	40657	80 %	0 %	0 %	20 %	407453045
34	NC_018618	CATAA	2	10	40731	40740	60 %	20 %	0 %	20 %	407453045
35	NC_018618	ATTTA	2	10	40804	40813	40 %	60 %	0 %	0 %	407453046
36	NC_018618	AACAA	2	10	43735	43744	80 %	0 %	0 %	20 %	407453050
37	NC_018618	AATGA	2	10	45935	45944	60 %	20 %	20 %	0 %	407453052
38	NC_018618	GCTTT	2	10	47589	47598	0 %	60 %	20 %	20 %	407453054
39	NC_018618	ATTAT	2	10	51155	51164	40 %	60 %	0 %	0 %	407453056
40	NC_018618	ACAAA	2	10	51503	51512	80 %	0 %	0 %	20 %	407453056
41	NC_018618	GGAAA	2	10	52285	52294	60 %	0 %	40 %	0 %	407453057
42	NC_018618	AATAC	2	10	52776	52785	60 %	20 %	0 %	20 %	407453058
43	NC_018618	TAAAA	2	10	53953	53962	80 %	20 %	0 %	0 %	407453059
44	NC_018618	ATTAC	2	10	54541	54550	40 %	40 %	0 %	20 %	407453060
45	NC_018618	ATTAA	2	10	54812	54821	60 %	40 %	0 %	0 %	407453061
46	NC_018618	AATTA	2	10	55543	55552	60 %	40 %	0 %	0 %	407453061
47	NC_018618	CAAAG	2	10	55909	55918	60 %	0 %	20 %	20 %	407453061
48	NC_018618	AAAAT	2	10	57176	57185	80 %	20 %	0 %	0 %	407453062
49	NC_018618	GTTTT	2	10	57688	57697	0 %	80 %	20 %	0 %	407453062
50	NC_018618	GTGTT	2	10	57770	57779	0 %	60 %	40 %	0 %	407453062
51	NC_018618	AAGAA	2	10	58112	58121	80 %	0 %	20 %	0 %	407453062
52	NC_018618	CTTTA	2	10	58954	58963	20 %	60 %	0 %	20 %	407453063
53	NC_018618	AAGAA	2	10	62140	62149	80 %	0 %	20 %	0 %	407453064
54	NC_018618	AACAA	2	10	62883	62892	80 %	0 %	0 %	20 %	407453064
55	NC_018618	CAAAT	2	10	62958	62967	60 %	20 %	0 %	20 %	407453064
56	NC_018618	AGGTA	2	10	63670	63679	40 %	20 %	40 %	0 %	407453064
57	NC_018618	TTAAA	2	10	64773	64782	60 %	40 %	0 %	0 %	407453065
58	NC_018618	ATATT	2	10	64846	64855	40 %	60 %	0 %	0 %	407453065
59	NC_018618	AATAA	2	10	65288	65297	80 %	20 %	0 %	0 %	407453065
60	NC_018618	AGTTA	2	10	68300	68309	40 %	40 %	20 %	0 %	407453066
61	NC_018618	TAAAA	2	10	68636	68645	80 %	20 %	0 %	0 %	407453066
62	NC_018618	ATAAA	2	10	68716	68725	80 %	20 %	0 %	0 %	407453066
63	NC_018618	GATAT	2	10	69001	69010	40 %	40 %	20 %	0 %	407453066
64	NC_018618	ATAAA	2	10	71762	71771	80 %	20 %	0 %	0 %	407453067
65	NC_018618	ATAAA	2	10	74721	74730	80 %	20 %	0 %	0 %	407453069
66	NC_018618	CAAAA	2	10	74817	74826	80 %	0 %	0 %	20 %	407453069
67	NC_018618	TATAA	2	10	75065	75074	60 %	40 %	0 %	0 %	407453069
68	NC_018618	ATGTG	2	10	75136	75145	20 %	40 %	40 %	0 %	407453069
69	NC_018618	AAAAT	2	10	75377	75386	80 %	20 %	0 %	0 %	407453069
70	NC_018618	AAGAG	2	10	75651	75660	60 %	0 %	40 %	0 %	407453070
71	NC_018618	TAATA	2	10	75924	75933	60 %	40 %	0 %	0 %	407453070
72	NC_018618	TTAAA	2	10	76043	76052	60 %	40 %	0 %	0 %	407453070
73	NC_018618	ATTTT	2	10	77112	77121	20 %	80 %	0 %	0 %	407453071
74	NC_018618	AAAAG	2	10	77233	77242	80 %	0 %	20 %	0 %	407453071
75	NC_018618	ACAAA	2	10	77343	77352	80 %	0 %	0 %	20 %	407453071
76	NC_018618	ATTTA	2	10	77375	77384	40 %	60 %	0 %	0 %	407453071
77	NC_018618	AATAT	2	10	77456	77465	60 %	40 %	0 %	0 %	407453071
78	NC_018618	AAAAG	2	10	78933	78942	80 %	0 %	20 %	0 %	407453073
79	NC_018618	AAACA	2	10	79088	79097	80 %	0 %	0 %	20 %	407453073
80	NC_018618	TTACA	2	10	79116	79125	40 %	40 %	0 %	20 %	407453073
81	NC_018618	TTTTA	2	10	79640	79649	20 %	80 %	0 %	0 %	407453074
82	NC_018618	GTTTT	2	10	79840	79849	0 %	80 %	20 %	0 %	407453074
83	NC_018618	GATTT	2	10	80907	80916	20 %	60 %	20 %	0 %	407453075
84	NC_018618	AAGCA	2	10	82757	82766	60 %	0 %	20 %	20 %	407453076
85	NC_018618	AGTGT	2	10	82949	82958	20 %	40 %	40 %	0 %	407453076
86	NC_018618	ATTTA	2	10	83792	83801	40 %	60 %	0 %	0 %	407453078
87	NC_018618	ATTTG	2	10	85506	85515	20 %	60 %	20 %	0 %	407453081
88	NC_018618	TAAAA	2	10	85665	85674	80 %	20 %	0 %	0 %	407453081
89	NC_018618	TCAAA	2	10	88071	88080	60 %	20 %	0 %	20 %	407453082
90	NC_018618	AATAG	2	10	89283	89292	60 %	20 %	20 %	0 %	407453082
91	NC_018618	ATTAG	2	10	89340	89349	40 %	40 %	20 %	0 %	407453082
92	NC_018618	TAAAT	2	10	89531	89540	60 %	40 %	0 %	0 %	407453082
93	NC_018618	AAAAT	2	10	89915	89924	80 %	20 %	0 %	0 %	407453083
94	NC_018618	GGTGA	2	10	90002	90011	20 %	20 %	60 %	0 %	407453083
95	NC_018618	AAAAT	2	10	90528	90537	80 %	20 %	0 %	0 %	407453083
96	NC_018618	TATAT	2	10	91425	91434	40 %	60 %	0 %	0 %	407453083
97	NC_018618	TGAAA	2	10	95503	95512	60 %	20 %	20 %	0 %	407453086
98	NC_018618	ACAAT	2	10	95593	95602	60 %	20 %	0 %	20 %	407453086
99	NC_018618	AAAAT	2	10	95978	95987	80 %	20 %	0 %	0 %	407453086
100	NC_018618	GTAGA	2	10	97800	97809	40 %	20 %	40 %	0 %	407453087
101	NC_018618	ATTTT	2	10	98101	98110	20 %	80 %	0 %	0 %	407453087
102	NC_018618	TTAAT	2	10	98193	98202	40 %	60 %	0 %	0 %	407453087
103	NC_018618	CAAGG	2	10	99341	99350	40 %	0 %	40 %	20 %	407453090
104	NC_018618	AAAAT	2	10	99692	99701	80 %	20 %	0 %	0 %	407453090
105	NC_018618	CAGAA	2	10	101642	101651	60 %	0 %	20 %	20 %	407453095
106	NC_018618	TAAAA	2	10	102024	102033	80 %	20 %	0 %	0 %	407453095
107	NC_018618	GTAAA	2	10	103275	103284	60 %	20 %	20 %	0 %	407453099
108	NC_018618	TTAAT	2	10	105953	105962	40 %	60 %	0 %	0 %	407453104
109	NC_018618	ATTTT	2	10	108018	108027	20 %	80 %	0 %	0 %	407453108
110	NC_018618	AGGCA	2	10	110806	110815	40 %	0 %	40 %	20 %	407453113
111	NC_018618	AAAAC	2	10	114374	114383	80 %	0 %	0 %	20 %	407453117
112	NC_018618	TTAGG	2	10	115657	115666	20 %	40 %	40 %	0 %	407453119
113	NC_018618	GTTTG	2	10	116850	116859	0 %	60 %	40 %	0 %	407453119
114	NC_018618	ATTTT	2	10	116899	116908	20 %	80 %	0 %	0 %	407453119
115	NC_018618	AAGTA	2	10	119202	119211	60 %	20 %	20 %	0 %	407453120
116	NC_018618	ATCAA	2	10	121550	121559	60 %	20 %	0 %	20 %	407453122
117	NC_018618	TAATC	2	10	121663	121672	40 %	40 %	0 %	20 %	407453122
118	NC_018618	TAAAG	2	10	135842	135851	60 %	20 %	20 %	0 %	407453128
119	NC_018618	GATAT	2	10	136827	136836	40 %	40 %	20 %	0 %	407453128
120	NC_018618	AAAGT	2	10	137164	137173	60 %	20 %	20 %	0 %	407453128
121	NC_018618	ACAGG	2	10	137295	137304	40 %	0 %	40 %	20 %	407453128
122	NC_018618	AAATA	2	10	138106	138115	80 %	20 %	0 %	0 %	407453128
123	NC_018618	TAAGA	2	10	138134	138143	60 %	20 %	20 %	0 %	407453128
124	NC_018618	AGAAA	2	10	138753	138762	80 %	0 %	20 %	0 %	407453129
125	NC_018618	TTGCT	2	10	140839	140848	0 %	60 %	20 %	20 %	407453130
126	NC_018618	ATATT	2	10	142977	142986	40 %	60 %	0 %	0 %	407453132
127	NC_018618	TATAG	2	10	143932	143941	40 %	40 %	20 %	0 %	407453135
128	NC_018618	GTTTT	2	10	146336	146345	0 %	80 %	20 %	0 %	407453136
129	NC_018618	AAAAT	2	10	148407	148416	80 %	20 %	0 %	0 %	407453138
130	NC_018618	AAAAT	2	10	149104	149113	80 %	20 %	0 %	0 %	407453138
131	NC_018618	GTGAT	2	10	149191	149200	20 %	40 %	40 %	0 %	407453138
132	NC_018618	GTTGA	2	10	149747	149756	20 %	40 %	40 %	0 %	407453139
133	NC_018618	TATAT	2	10	150505	150514	40 %	60 %	0 %	0 %	407453140
134	NC_018618	GGAAT	2	10	150979	150988	40 %	20 %	40 %	0 %	407453140
135	NC_018618	TAAAT	2	10	151662	151671	60 %	40 %	0 %	0 %	407453140
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137	NC_018618	ATTTA	2	10	152519	152528	40 %	60 %	0 %	0 %	407453141
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.