MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	TGAAGG	2	12	2021	2032	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018612	CGGGGA	2	12	95306	95317	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018612	GGTGAG	2	12	95729	95740	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018612	GGCCGG	2	12	142028	142039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018612	ATTTCC	2	12	151925	151936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018612	GGCACG	2	12	152438	152449	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018612	GACGCG	2	12	153540	153551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018612	TTCGTG	2	12	234894	234905	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018612	GCGTCG	2	12	388862	388873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018612	GGGTCG	2	12	399522	399533	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018612	CCGCCA	2	12	468250	468261	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018612	CAGCGA	2	12	471121	471132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018612	CGCGGT	2	12	497567	497578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018612	AGGGAA	2	12	574304	574315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018612	CGGCGA	2	12	587674	587685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018612	CGGCGA	2	12	587730	587741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018612	CGGGCG	2	12	838956	838967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018612	CTCGAC	2	12	857991	858002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018612	ACGAGA	2	12	900432	900443	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018612	GTCGAC	2	12	995614	995625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018612	TCGGGT	2	12	1024563	1024574	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018612	CGGCCG	2	12	1044121	1044132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018612	TGTTAC	2	12	1079778	1079789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018612	CGATCC	2	12	1093401	1093412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018612	CGGCAC	2	12	1100655	1100666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018612	GCGGAC	2	12	1103782	1103793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018612	CCGTCG	2	12	1244741	1244752	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018612	GCCCTC	2	12	1345060	1345071	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018612	AATGAG	2	12	1441797	1441808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018612	GCCCGG	2	12	1506515	1506526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018612	TCTGCA	2	12	1547681	1547692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018612	GTTTGC	2	12	1550184	1550195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018612	CGCTGC	2	12	1555769	1555780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018612	GACCGT	2	12	1695311	1695322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018612	CAAAAG	2	12	1720759	1720770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018612	GCAGCG	2	12	1739443	1739454	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018612	TGGCCC	2	12	1739480	1739491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018612	AAAGCG	2	12	1740182	1740193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018612	CCGTCG	2	12	1766466	1766477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018612	CGCGCC	2	12	1822048	1822059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018612	CCCCGG	2	12	1822606	1822617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018612	CTCCGG	2	12	1822648	1822659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018612	CCGACG	2	12	1869046	1869057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018612	GACACG	2	12	1869282	1869293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018612	CGATCG	2	12	1870717	1870728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018612	GATCCG	2	12	1874466	1874477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018612	CGGAAC	2	12	1876983	1876994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018612	CCGGCG	2	12	1877018	1877029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018612	CGGCGC	2	12	1904029	1904040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018612	ACACTG	2	12	1908744	1908755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018612	ACCGAG	2	12	2082989	2083000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018612	CCTCGT	2	12	2136794	2136805	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018612	GAGCGG	2	12	2167337	2167348	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018612	CAGCGC	2	12	2188118	2188129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018612	TTAATG	2	12	2216308	2216319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018612	GCTGTG	2	12	2219149	2219160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018612	CGCTGG	2	12	2324971	2324982	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018612	TAACTC	2	12	2375247	2375258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018612	GGTTGA	2	12	2375262	2375273	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018612	GCGGTG	2	12	2432755	2432766	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018612	ACCAGA	2	12	2522641	2522652	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018612	CCGTTG	2	12	2531464	2531475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018612	GCGCCG	2	12	2531573	2531584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018612	GACGCG	2	12	2578534	2578545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018612	CAAGAT	2	12	2586994	2587005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018612	CCCAAG	2	12	2613688	2613699	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018612	TTTCGG	2	12	2627486	2627497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018612	GCCACC	2	12	2633514	2633525	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018612	CACCGT	2	12	2656190	2656201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018612	GTCAAC	2	12	2661218	2661229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018612	TCTACG	2	12	2666245	2666256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018612	CCGCGG	2	12	2670412	2670423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018612	CGCGGC	2	12	2671259	2671270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018612	GTTTCG	2	12	2686275	2686286	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018612	GCGATC	2	12	2749444	2749455	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018612	AGAGGG	2	12	2880827	2880838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018612	GGTGCG	2	12	2884456	2884467	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018612	GACGCG	2	12	2951629	2951640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018612	CAAGAT	2	12	3017239	3017250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018612	CGCCTG	2	12	3020145	3020156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018612	GTAGCG	2	12	3025835	3025846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018612	GGTGAT	2	12	3039047	3039058	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018612	GCCATC	2	12	3040908	3040919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018612	GACGGT	2	12	3058337	3058348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018612	TACGGG	2	12	3058458	3058469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018612	TCACCA	2	12	3062686	3062697	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018612	CGGAAG	2	12	3115000	3115011	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018612	GCGCCG	2	12	3135647	3135658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018612	AGCTGT	2	12	3146288	3146299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018612	CGCGCA	2	12	3154199	3154210	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018612	CCGGTT	2	12	3193920	3193931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018612	GTGGGA	2	12	3233784	3233795	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018612	GAGGAC	2	12	3258980	3258991	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018612	ACGGCG	2	12	3328217	3328228	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018612	CGCCCC	2	12	3361003	3361014	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_018612	CGGTGT	2	12	3484538	3484549	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018612	GTGGCG	2	12	3523453	3523464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018612	CGGTTC	2	12	3708790	3708801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018612	CTGGCC	2	12	3723746	3723757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018612	GCCGGG	2	12	3754106	3754117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018612	CACCCG	2	12	3772641	3772652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018612	GGCGCG	2	12	3801122	3801133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018612	CGACAT	2	12	3802114	3802125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018612	CATCGC	2	12	3832339	3832350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018612	CCGAGT	2	12	3850185	3850196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018612	CCTCGA	2	12	3859347	3859358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018612	CGCGAG	2	12	3905377	3905388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018612	CAGGGC	2	12	3945268	3945279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018612	GGCGTG	2	12	4011229	4011240	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018612	CCGTCA	2	12	4059241	4059252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018612	GGCGTT	2	12	4105051	4105062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018612	GTCACC	2	12	4143601	4143612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018612	CGTGCT	2	12	4291628	4291639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018612	CACCGC	2	12	4340876	4340887	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018612	CCCGAC	2	12	4416585	4416596	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018612	TGGCGG	2	12	4448493	4448504	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018612	GCGCGG	2	12	4487254	4487265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018612	GCTGGT	2	12	4520174	4520185	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018612	CGGCGA	2	12	4550346	4550357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018612	CGGCGA	2	12	4550403	4550414	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018612	CGGCGA	2	12	4550460	4550471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018612	CGGCGA	2	12	4550517	4550528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018612	TCGATG	2	12	4623651	4623662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018612	CCGCGG	2	12	4733161	4733172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018612	CAAGGA	2	12	4746636	4746647	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018612	GTGCAC	2	12	4759972	4759983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018612	CGAGGT	2	12	4760772	4760783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018612	TGTTCG	2	12	4797284	4797295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018612	TTGTCG	2	12	4805133	4805144	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018612	GTCACC	2	12	4819929	4819940	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018612	GACGGT	2	12	4820165	4820176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018612	CGGCGA	2	12	4821022	4821033	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018612	GTCGCC	2	12	4821086	4821097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018612	ACCCGG	2	12	4821801	4821812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018612	GGGCGA	2	12	4854576	4854587	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018612	CGCGTC	2	12	4856881	4856892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018612	GCCGGG	2	12	4866319	4866330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018612	CGGCAC	2	12	4933337	4933348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018612	TACTGG	2	12	4963158	4963169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_018612	GCCCCT	2	12	4986075	4986086	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018612	AACGGG	2	12	4990562	4990573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_018612	CCTGTG	2	12	5136462	5136473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018612	CGTCGC	2	12	5143491	5143502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018612	AACGCG	2	12	5156429	5156440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018612	TCATTT	2	12	5193322	5193333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_018612	GAATCT	2	12	5205295	5205306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_018612	CATCAC	2	12	5229926	5229937	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018612	GTCGGG	2	12	5234933	5234944	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_018612	CGCGGG	2	12	5241452	5241463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018612	AACCCG	2	12	5242203	5242214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018612	AAGTCG	2	12	5272097	5272108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_018612	GGCTGC	2	12	5331788	5331799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018612	CCCGGG	2	12	5421704	5421715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018612	CGGGCT	2	12	5442125	5442136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018612	GCCGGA	2	12	5450757	5450768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018612	CGGCGA	2	12	5480134	5480145	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_018612	CGTCGG	2	12	5564650	5564661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.