MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 4284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	ACCAC	2	10	1385	1394	40 %	0 %	0 %	60 %	406028181
2	NC_018612	CGCAA	2	10	1406	1415	40 %	0 %	20 %	40 %	406028181
3	NC_018612	GGCCG	2	10	2984	2993	0 %	0 %	60 %	40 %	406028182
4	NC_018612	CCGGG	2	10	3165	3174	0 %	0 %	60 %	40 %	406028182
5	NC_018612	CGCGG	2	10	4022	4031	0 %	0 %	60 %	40 %	406028183
6	NC_018612	GCGCC	2	10	4243	4252	0 %	0 %	40 %	60 %	406028183
7	NC_018612	GCACC	2	10	5960	5969	20 %	0 %	20 %	60 %	406033432
8	NC_018612	GAAGT	2	10	6354	6363	40 %	20 %	40 %	0 %	406033432
9	NC_018612	GCAGC	2	10	6938	6947	20 %	0 %	40 %	40 %	406033432
10	NC_018612	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	406028185
11	NC_018612	GGGCA	2	10	7635	7644	20 %	0 %	60 %	20 %	406028185
12	NC_018612	CGGGC	2	10	8553	8562	0 %	0 %	60 %	40 %	406028185
13	NC_018612	GGCGG	2	10	9680	9689	0 %	0 %	80 %	20 %	406028185
14	NC_018612	CGAGG	2	10	10195	10204	20 %	0 %	60 %	20 %	406028186
15	NC_018612	CCGCA	2	10	10355	10364	20 %	0 %	20 %	60 %	406028186
16	NC_018612	CGCTC	2	10	12232	12241	0 %	20 %	20 %	60 %	406028188
17	NC_018612	CCGCG	2	10	13021	13030	0 %	0 %	40 %	60 %	406028188
18	NC_018612	TCCCG	2	10	16871	16880	0 %	20 %	20 %	60 %	406028195
19	NC_018612	CCAGC	2	10	16977	16986	20 %	0 %	20 %	60 %	406028195
20	NC_018612	TCACC	2	10	17123	17132	20 %	20 %	0 %	60 %	406028195
21	NC_018612	GTTGC	2	10	17193	17202	0 %	40 %	40 %	20 %	406028195
22	NC_018612	GCCGG	2	10	19000	19009	0 %	0 %	60 %	40 %	406028196
23	NC_018612	GGCCC	2	10	19118	19127	0 %	0 %	40 %	60 %	406028196
24	NC_018612	GGCGG	2	10	19147	19156	0 %	0 %	80 %	20 %	406028196
25	NC_018612	CGGCG	2	10	19484	19493	0 %	0 %	60 %	40 %	406028196
26	NC_018612	CGGCG	2	10	20035	20044	0 %	0 %	60 %	40 %	406028197
27	NC_018612	TTAGC	2	10	20268	20277	20 %	40 %	20 %	20 %	406028197
28	NC_018612	CGGCG	2	10	20725	20734	0 %	0 %	60 %	40 %	406028197
29	NC_018612	GGGGC	2	10	22207	22216	0 %	0 %	80 %	20 %	406028198
30	NC_018612	AGACC	2	10	22413	22422	40 %	0 %	20 %	40 %	406028198
31	NC_018612	GCTGA	2	10	22555	22564	20 %	20 %	40 %	20 %	406028198
32	NC_018612	TGGGG	2	10	22903	22912	0 %	20 %	80 %	0 %	406028199
33	NC_018612	CCAAT	2	10	24047	24056	40 %	20 %	0 %	40 %	406028199
34	NC_018612	CTGCG	2	10	24126	24135	0 %	20 %	40 %	40 %	406028199
35	NC_018612	ATCGC	2	10	27138	27147	20 %	20 %	20 %	40 %	406028202
36	NC_018612	CAGCG	2	10	28042	28051	20 %	0 %	40 %	40 %	406028204
37	NC_018612	GCGAT	2	10	28986	28995	20 %	20 %	40 %	20 %	406028206
38	NC_018612	TCGGC	2	10	31034	31043	0 %	20 %	40 %	40 %	406028207
39	NC_018612	AGGCG	2	10	32215	32224	20 %	0 %	60 %	20 %	406028208
40	NC_018612	CAGAA	2	10	32688	32697	60 %	0 %	20 %	20 %	406028208
41	NC_018612	GACCG	2	10	34965	34974	20 %	0 %	40 %	40 %	406028210
42	NC_018612	CCAAA	2	10	37079	37088	60 %	0 %	0 %	40 %	406028212
43	NC_018612	CGGCG	2	10	37532	37541	0 %	0 %	60 %	40 %	406028213
44	NC_018612	ACCGG	2	10	37543	37552	20 %	0 %	40 %	40 %	406028213
45	NC_018612	CAGCG	2	10	39041	39050	20 %	0 %	40 %	40 %	406028215
46	NC_018612	CCGTC	2	10	41002	41011	0 %	20 %	20 %	60 %	406028217
47	NC_018612	GGCCG	2	10	42572	42581	0 %	0 %	60 %	40 %	406028220
48	NC_018612	AGCCA	2	10	43257	43266	40 %	0 %	20 %	40 %	406028220
49	NC_018612	CTGCG	2	10	43861	43870	0 %	20 %	40 %	40 %	406028221
50	NC_018612	GTCGG	2	10	44723	44732	0 %	20 %	60 %	20 %	406028222
51	NC_018612	TTGTC	2	10	46910	46919	0 %	60 %	20 %	20 %	406028224
52	NC_018612	GCCGG	2	10	47570	47579	0 %	0 %	60 %	40 %	406028226
53	NC_018612	TCGGG	2	10	48191	48200	0 %	20 %	60 %	20 %	406028226
54	NC_018612	TGGGC	2	10	49281	49290	0 %	20 %	60 %	20 %	406028227
55	NC_018612	GGGTG	2	10	51786	51795	0 %	20 %	80 %	0 %	406028228
56	NC_018612	CGGTG	2	10	53484	53493	0 %	20 %	60 %	20 %	406028230
57	NC_018612	TCGCC	2	10	55684	55693	0 %	20 %	20 %	60 %	406028232
58	NC_018612	GGGGT	2	10	56088	56097	0 %	20 %	80 %	0 %	406028232
59	NC_018612	GCGAC	2	10	57907	57916	20 %	0 %	40 %	40 %	406028234
60	NC_018612	CGGCG	2	10	57926	57935	0 %	0 %	60 %	40 %	406028234
61	NC_018612	GCGCG	2	10	60872	60881	0 %	0 %	60 %	40 %	406028236
62	NC_018612	CAGCG	2	10	60891	60900	20 %	0 %	40 %	40 %	406028236
63	NC_018612	CAGGT	2	10	62756	62765	20 %	20 %	40 %	20 %	406028238
64	NC_018612	CTCCG	2	10	63245	63254	0 %	20 %	20 %	60 %	406028239
65	NC_018612	GGCCC	2	10	65809	65818	0 %	0 %	40 %	60 %	406028241
66	NC_018612	GCGCC	2	10	69359	69368	0 %	0 %	40 %	60 %	406028245
67	NC_018612	GCGCG	2	10	69863	69872	0 %	0 %	60 %	40 %	406028245
68	NC_018612	CTGGC	2	10	72071	72080	0 %	20 %	40 %	40 %	406028246
69	NC_018612	ACGCG	2	10	72455	72464	20 %	0 %	40 %	40 %	406028246
70	NC_018612	CATGA	2	10	73095	73104	40 %	20 %	20 %	20 %	406028246
71	NC_018612	GCGTC	2	10	74988	74997	0 %	20 %	40 %	40 %	406028250
72	NC_018612	GACGG	2	10	76970	76979	20 %	0 %	60 %	20 %	406028252
73	NC_018612	TGGGG	2	10	79480	79489	0 %	20 %	80 %	0 %	406028253
74	NC_018612	TGATC	2	10	79599	79608	20 %	40 %	20 %	20 %	406028253
75	NC_018612	GCAAC	2	10	80278	80287	40 %	0 %	20 %	40 %	406028253
76	NC_018612	TCAAA	2	10	80328	80337	60 %	20 %	0 %	20 %	406028253
77	NC_018612	TGCGC	2	10	81551	81560	0 %	20 %	40 %	40 %	406028254
78	NC_018612	CGCGC	2	10	82458	82467	0 %	0 %	40 %	60 %	406028255
79	NC_018612	TCCGG	2	10	85405	85414	0 %	20 %	40 %	40 %	406028258
80	NC_018612	GTTGG	2	10	85500	85509	0 %	40 %	60 %	0 %	406028258
81	NC_018612	GCCCG	2	10	87780	87789	0 %	0 %	40 %	60 %	406028260
82	NC_018612	CCGCA	2	10	88571	88580	20 %	0 %	20 %	60 %	406028260
83	NC_018612	CCCGG	2	10	88848	88857	0 %	0 %	40 %	60 %	406028260
84	NC_018612	CCGCG	2	10	89491	89500	0 %	0 %	40 %	60 %	406028261
85	NC_018612	TCGAT	2	10	92308	92317	20 %	40 %	20 %	20 %	406028265
86	NC_018612	AAGTT	2	10	93827	93836	40 %	40 %	20 %	0 %	406028265
87	NC_018612	GGACC	2	10	95781	95790	20 %	0 %	40 %	40 %	406028267
88	NC_018612	GCCAG	2	10	96541	96550	20 %	0 %	40 %	40 %	406028267
89	NC_018612	GCACT	2	10	98168	98177	20 %	20 %	20 %	40 %	406028268
90	NC_018612	GCCGT	2	10	101403	101412	0 %	20 %	40 %	40 %	406028270
91	NC_018612	GGCGA	2	10	102076	102085	20 %	0 %	60 %	20 %	406028271
92	NC_018612	CGAAC	2	10	102657	102666	40 %	0 %	20 %	40 %	406028271
93	NC_018612	ACGTC	2	10	102869	102878	20 %	20 %	20 %	40 %	406028271
94	NC_018612	CATGG	2	10	104556	104565	20 %	20 %	40 %	20 %	406028273
95	NC_018612	TGTCC	2	10	104725	104734	0 %	40 %	20 %	40 %	406028273
96	NC_018612	ACGCG	2	10	105738	105747	20 %	0 %	40 %	40 %	406028274
97	NC_018612	CCGGA	2	10	106255	106264	20 %	0 %	40 %	40 %	406028276
98	NC_018612	ATCGA	2	10	109058	109067	40 %	20 %	20 %	20 %	406028282
99	NC_018612	CGTGC	2	10	109807	109816	0 %	20 %	40 %	40 %	406028283
100	NC_018612	CGCTG	2	10	114002	114011	0 %	20 %	40 %	40 %	406028286
101	NC_018612	GGTCC	2	10	118722	118731	0 %	20 %	40 %	40 %	406028292
102	NC_018612	CTTGC	2	10	119599	119608	0 %	40 %	20 %	40 %	406028292
103	NC_018612	CCCAT	2	10	126807	126816	20 %	20 %	0 %	60 %	406028299
104	NC_018612	CGAGC	2	10	129235	129244	20 %	0 %	40 %	40 %	406028300
105	NC_018612	TGACA	2	10	130396	130405	40 %	20 %	20 %	20 %	406028301
106	NC_018612	ATGTC	2	10	131348	131357	20 %	40 %	20 %	20 %	406028302
107	NC_018612	GGTCG	2	10	132267	132276	0 %	20 %	60 %	20 %	406028303
108	NC_018612	GTGCG	2	10	134713	134722	0 %	20 %	60 %	20 %	406028305
109	NC_018612	CTGGT	2	10	136012	136021	0 %	40 %	40 %	20 %	406028306
110	NC_018612	AACGC	2	10	137525	137534	40 %	0 %	20 %	40 %	406028307
111	NC_018612	GAACT	2	10	137876	137885	40 %	20 %	20 %	20 %	406028307
112	NC_018612	TCGCC	2	10	138011	138020	0 %	20 %	20 %	60 %	406028308
113	NC_018612	TGACG	2	10	143627	143636	20 %	20 %	40 %	20 %	406028313
114	NC_018612	GCTGG	2	10	149691	149700	0 %	20 %	60 %	20 %	406028319
115	NC_018612	TGGAA	2	10	150715	150724	40 %	20 %	40 %	0 %	406028320
116	NC_018612	GACAG	2	10	153751	153760	40 %	0 %	40 %	20 %	406028324
117	NC_018612	CCTGG	2	10	154057	154066	0 %	20 %	40 %	40 %	406028324
118	NC_018612	GCCGC	2	10	154273	154282	0 %	0 %	40 %	60 %	406028325
119	NC_018612	CGGTG	2	10	156914	156923	0 %	20 %	60 %	20 %	406028328
120	NC_018612	ACATC	2	10	157078	157087	40 %	20 %	0 %	40 %	406028328
121	NC_018612	CAGCG	2	10	158532	158541	20 %	0 %	40 %	40 %	406028329
122	NC_018612	CGGCG	2	10	158635	158644	0 %	0 %	60 %	40 %	406028329
123	NC_018612	TCTGA	2	10	161099	161108	20 %	40 %	20 %	20 %	406028331
124	NC_018612	GTCGA	2	10	161709	161718	20 %	20 %	40 %	20 %	406028333
125	NC_018612	GGGCA	2	10	162537	162546	20 %	0 %	60 %	20 %	406028333
126	NC_018612	CCGCG	2	10	163182	163191	0 %	0 %	40 %	60 %	406028334
127	NC_018612	GGCGA	2	10	167040	167049	20 %	0 %	60 %	20 %	406028338
128	NC_018612	GCGAT	2	10	172213	172222	20 %	20 %	40 %	20 %	406028343
129	NC_018612	GGGCA	2	10	173621	173630	20 %	0 %	60 %	20 %	406028344
130	NC_018612	TCAGT	2	10	173724	173733	20 %	40 %	20 %	20 %	406028344
131	NC_018612	AGCGG	2	10	175389	175398	20 %	0 %	60 %	20 %	406028345
132	NC_018612	TCGCA	2	10	176183	176192	20 %	20 %	20 %	40 %	406028346
133	NC_018612	CACCG	2	10	176911	176920	20 %	0 %	20 %	60 %	406028347
134	NC_018612	GCCCG	2	10	182297	182306	0 %	0 %	40 %	60 %	406028352
135	NC_018612	GCCCG	2	10	182619	182628	0 %	0 %	40 %	60 %	406028352
136	NC_018612	CAGCA	2	10	183392	183401	40 %	0 %	20 %	40 %	406028354
137	NC_018612	GCGCA	2	10	183621	183630	20 %	0 %	40 %	40 %	406028354
138	NC_018612	CGACG	2	10	183649	183658	20 %	0 %	40 %	40 %	406028354
139	NC_018612	TCGGG	2	10	188023	188032	0 %	20 %	60 %	20 %	406028358
140	NC_018612	GACGG	2	10	188059	188068	20 %	0 %	60 %	20 %	406028358
141	NC_018612	ATTGC	2	10	188924	188933	20 %	40 %	20 %	20 %	406028359
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149	NC_018612	CCGGA	2	10	202298	202307	20 %	0 %	40 %	40 %	406028371
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153	NC_018612	GGCGT	2	10	205659	205668	0 %	20 %	60 %	20 %	406028373
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167	NC_018612	GGGTC	2	10	218850	218859	0 %	20 %	60 %	20 %	406028386
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175	NC_018612	GATCC	2	10	234644	234653	20 %	20 %	20 %	40 %	406028398
176	NC_018612	CCCGG	2	10	238268	238277	0 %	0 %	40 %	60 %	406028402
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183	NC_018612	CGATC	2	10	247139	247148	20 %	20 %	20 %	40 %	406028409
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249	NC_018612	CGGCT	2	10	341326	341335	0 %	20 %	40 %	40 %	406028510
250	NC_018612	CGGCC	2	10	343027	343036	0 %	0 %	40 %	60 %	406028511
251	NC_018612	ACGCC	2	10	344314	344323	20 %	0 %	20 %	60 %	406028512
252	NC_018612	CCGTC	2	10	346057	346066	0 %	20 %	20 %	60 %	406028514
253	NC_018612	TGCTG	2	10	346761	346770	0 %	40 %	40 %	20 %	406028516
254	NC_018612	CGCGG	2	10	346992	347001	0 %	0 %	60 %	40 %	406028516
255	NC_018612	CGGGG	3	15	347534	347548	0 %	0 %	80 %	20 %	406028515
256	NC_018612	CCCGG	2	10	347810	347819	0 %	0 %	40 %	60 %	406028515
257	NC_018612	GCTGG	2	10	348654	348663	0 %	20 %	60 %	20 %	406028517
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259	NC_018612	GGCCA	2	10	356257	356266	20 %	0 %	40 %	40 %	406028521
260	NC_018612	GCTCC	2	10	356447	356456	0 %	20 %	20 %	60 %	406028521
261	NC_018612	CGTGG	2	10	357602	357611	0 %	20 %	60 %	20 %	406028522
262	NC_018612	GCCGC	2	10	358283	358292	0 %	0 %	40 %	60 %	406028523
263	NC_018612	CGGCG	2	10	359460	359469	0 %	0 %	60 %	40 %	406028524
264	NC_018612	GCGCC	2	10	360120	360129	0 %	0 %	40 %	60 %	406028526
265	NC_018612	GTCAC	2	10	360611	360620	20 %	20 %	20 %	40 %	406028526
266	NC_018612	CGGCA	2	10	360928	360937	20 %	0 %	40 %	40 %	406028526
267	NC_018612	GACCT	2	10	361096	361105	20 %	20 %	20 %	40 %	406028526
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378	NC_018612	CGACC	2	10	502659	502668	20 %	0 %	20 %	60 %	406028660
379	NC_018612	GGACC	2	10	506285	506294	20 %	0 %	40 %	40 %	406028663
380	NC_018612	CAGCC	2	10	506571	506580	20 %	0 %	20 %	60 %	406028663
381	NC_018612	GCGTC	2	10	508028	508037	0 %	20 %	40 %	40 %	406028666
382	NC_018612	CCGCC	2	10	509094	509103	0 %	0 %	20 %	80 %	406028666
383	NC_018612	AGCGC	2	10	514099	514108	20 %	0 %	40 %	40 %	406028671
384	NC_018612	CGGAC	2	10	519302	519311	20 %	0 %	40 %	40 %	406028677
385	NC_018612	GCGCC	2	10	520827	520836	0 %	0 %	40 %	60 %	406028678
386	NC_018612	GTGCG	2	10	521409	521418	0 %	20 %	60 %	20 %	406028678
387	NC_018612	CCGGG	2	10	523638	523647	0 %	0 %	60 %	40 %	406028680
388	NC_018612	CCGCC	2	10	524022	524031	0 %	0 %	20 %	80 %	406028680
389	NC_018612	GCCGG	2	10	524713	524722	0 %	0 %	60 %	40 %	406028681
390	NC_018612	CTGGC	2	10	525424	525433	0 %	20 %	40 %	40 %	406028682
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392	NC_018612	GGCGA	2	10	526549	526558	20 %	0 %	60 %	20 %	406028684
393	NC_018612	TGCCC	2	10	529835	529844	0 %	20 %	20 %	60 %	406028688
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