MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 14550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	AAGG	2	8	814	821	50 %	0 %	50 %	0 %	406028181
2	NC_018612	TCGT	2	8	1651	1658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018612	GTGG	2	8	2119	2126	0 %	25 %	75 %	0 %	406028182
4	NC_018612	CGGG	2	8	2503	2510	0 %	0 %	75 %	25 %	406028182
5	NC_018612	GCCG	2	8	2833	2840	0 %	0 %	50 %	50 %	406028182
6	NC_018612	CGAT	2	8	3006	3013	25 %	25 %	25 %	25 %	406028182
7	NC_018612	CCGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	25 %	50 %	406028182
8	NC_018612	GGGC	2	8	3506	3513	0 %	0 %	75 %	25 %	406028183
9	NC_018612	CGGC	2	8	3668	3675	0 %	0 %	50 %	50 %	406028183
10	NC_018612	GTGC	2	8	3686	3693	0 %	25 %	50 %	25 %	406028183
11	NC_018612	GGTC	2	8	4054	4061	0 %	25 %	50 %	25 %	406028183
12	NC_018612	GCCA	2	8	4115	4122	25 %	0 %	25 %	50 %	406028183
13	NC_018612	GCCG	2	8	4519	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	406028184
14	NC_018612	GCCG	2	8	4884	4891	0 %	0 %	50 %	50 %	406028184
15	NC_018612	CCGC	2	8	5178	5185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_018612	GGGC	2	8	6524	6531	0 %	0 %	75 %	25 %	406033432
17	NC_018612	CGGC	2	8	6604	6611	0 %	0 %	50 %	50 %	406033432
18	NC_018612	GATG	2	8	7064	7071	25 %	25 %	50 %	0 %	406033432
19	NC_018612	GACC	2	8	7279	7286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018612	TGAC	2	8	7300	7307	25 %	25 %	25 %	25 %	406028185
21	NC_018612	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	406028185
22	NC_018612	CCCA	2	8	7986	7993	25 %	0 %	0 %	75 %	406028185
23	NC_018612	TCGC	2	8	8833	8840	0 %	25 %	25 %	50 %	406028185
24	NC_018612	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	406028185
25	NC_018612	ACCT	2	8	9462	9469	25 %	25 %	0 %	50 %	406028185
26	NC_018612	CCGA	2	8	10157	10164	25 %	0 %	25 %	50 %	406028186
27	NC_018612	CCGG	2	8	10181	10188	0 %	0 %	50 %	50 %	406028186
28	NC_018612	GCCG	2	8	10406	10413	0 %	0 %	50 %	50 %	406028186
29	NC_018612	GATC	2	8	11470	11477	25 %	25 %	25 %	25 %	406028187
30	NC_018612	GCGA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	50 %	25 %	406028187
31	NC_018612	ACCA	2	8	11789	11796	50 %	0 %	0 %	50 %	406028187
32	NC_018612	TGCG	2	8	12084	12091	0 %	25 %	50 %	25 %	406028188
33	NC_018612	CGCC	2	8	12555	12562	0 %	0 %	25 %	75 %	406028188
34	NC_018612	AACA	2	8	12696	12703	75 %	0 %	0 %	25 %	406028188
35	NC_018612	CGGC	2	8	12738	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	406028188
36	NC_018612	GCCG	2	8	12934	12941	0 %	0 %	50 %	50 %	406028188
37	NC_018612	CGAA	2	8	13002	13009	50 %	0 %	25 %	25 %	406028188
38	NC_018612	GGGC	2	8	13252	13259	0 %	0 %	75 %	25 %	406028189
39	NC_018612	GGCC	2	8	13711	13718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018612	GACC	2	8	14270	14277	25 %	0 %	25 %	50 %	406028190
41	NC_018612	CCCG	2	8	14383	14390	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_018612	GGTC	2	8	14460	14467	0 %	25 %	50 %	25 %	406028191
43	NC_018612	CGCC	2	8	14703	14710	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_018612	ATTC	2	8	14959	14966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018612	GTCG	2	8	14968	14975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018612	CACG	2	8	15470	15477	25 %	0 %	25 %	50 %	406028193
47	NC_018612	CTGG	2	8	16741	16748	0 %	25 %	50 %	25 %	406028194
48	NC_018612	GCCG	2	8	16893	16900	0 %	0 %	50 %	50 %	406028195
49	NC_018612	CGTC	2	8	17006	17013	0 %	25 %	25 %	50 %	406028195
50	NC_018612	GGCC	2	8	17133	17140	0 %	0 %	50 %	50 %	406028195
51	NC_018612	CGAC	3	12	17734	17745	25 %	0 %	25 %	50 %	406028195
52	NC_018612	GGGC	2	8	17805	17812	0 %	0 %	75 %	25 %	406028195
53	NC_018612	TCGG	2	8	17847	17854	0 %	25 %	50 %	25 %	406028195
54	NC_018612	CGCC	2	8	18381	18388	0 %	0 %	25 %	75 %	406028195
55	NC_018612	GTAG	2	8	18563	18570	25 %	25 %	50 %	0 %	406028195
56	NC_018612	TGCC	2	8	18805	18812	0 %	25 %	25 %	50 %	406028196
57	NC_018612	GGGC	2	8	19010	19017	0 %	0 %	75 %	25 %	406028196
58	NC_018612	CTGG	2	8	19139	19146	0 %	25 %	50 %	25 %	406028196
59	NC_018612	GCCG	2	8	19657	19664	0 %	0 %	50 %	50 %	406028196
60	NC_018612	CGGG	2	8	20805	20812	0 %	0 %	75 %	25 %	406028197
61	NC_018612	CCGC	2	8	21293	21300	0 %	0 %	25 %	75 %	406028197
62	NC_018612	GCCG	2	8	21489	21496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018612	GTCG	2	8	21847	21854	0 %	25 %	50 %	25 %	406028198
64	NC_018612	CCCA	2	8	22064	22071	25 %	0 %	0 %	75 %	406028198
65	NC_018612	CCGA	2	8	22163	22170	25 %	0 %	25 %	50 %	406028198
66	NC_018612	TGGG	2	8	22997	23004	0 %	25 %	75 %	0 %	406028199
67	NC_018612	GCCC	2	8	23575	23582	0 %	0 %	25 %	75 %	406028199
68	NC_018612	GCCG	2	8	24249	24256	0 %	0 %	50 %	50 %	406028199
69	NC_018612	CCGG	2	8	24396	24403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018612	GCGG	2	8	25800	25807	0 %	0 %	75 %	25 %	406028201
71	NC_018612	AGCC	2	8	25915	25922	25 %	0 %	25 %	50 %	406028201
72	NC_018612	GTCA	2	8	26189	26196	25 %	25 %	25 %	25 %	406028201
73	NC_018612	CGGG	2	8	26264	26271	0 %	0 %	75 %	25 %	406028201
74	NC_018612	GGCA	2	8	27257	27264	25 %	0 %	50 %	25 %	406028202
75	NC_018612	GGCC	2	8	27939	27946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018612	CGAG	2	8	28114	28121	25 %	0 %	50 %	25 %	406028204
77	NC_018612	CGCC	2	8	29050	29057	0 %	0 %	25 %	75 %	406028206
78	NC_018612	ACCG	2	8	29146	29153	25 %	0 %	25 %	50 %	406028206
79	NC_018612	TGGC	2	8	29183	29190	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
80	NC_018612	CTGT	2	8	29345	29352	0 %	50 %	25 %	25 %	406028206
81	NC_018612	CGGA	2	8	29954	29961	25 %	0 %	50 %	25 %	406028206
82	NC_018612	CGGT	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
83	NC_018612	GCCG	2	8	30221	30228	0 %	0 %	50 %	50 %	406028206
84	NC_018612	TGGA	2	8	30270	30277	25 %	25 %	50 %	0 %	406028206
85	NC_018612	CGGT	2	8	30300	30307	0 %	25 %	50 %	25 %	406028206
86	NC_018612	CGAG	2	8	31110	31117	25 %	0 %	50 %	25 %	406028207
87	NC_018612	AGCT	2	8	31337	31344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018612	AGGG	2	8	31346	31353	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018612	AGCA	2	8	31584	31591	50 %	0 %	25 %	25 %	406028208
90	NC_018612	GGCG	2	8	32563	32570	0 %	0 %	75 %	25 %	406028208
91	NC_018612	GCAC	2	8	32770	32777	25 %	0 %	25 %	50 %	406028208
92	NC_018612	GCCG	2	8	32815	32822	0 %	0 %	50 %	50 %	406028208
93	NC_018612	CCGA	2	8	33079	33086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018612	CCGG	2	8	33815	33822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018612	CGCC	2	8	34023	34030	0 %	0 %	25 %	75 %	406028209
96	NC_018612	GGGC	2	8	34244	34251	0 %	0 %	75 %	25 %	406028210
97	NC_018612	AGCG	2	8	35005	35012	25 %	0 %	50 %	25 %	406028210
98	NC_018612	CGGC	2	8	35138	35145	0 %	0 %	50 %	50 %	406028210
99	NC_018612	CCCG	2	8	35215	35222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_018612	TGCG	2	8	36552	36559	0 %	25 %	50 %	25 %	406028211
101	NC_018612	CGGC	2	8	37277	37284	0 %	0 %	50 %	50 %	406028213
102	NC_018612	ATCG	2	8	37630	37637	25 %	25 %	25 %	25 %	406028213
103	NC_018612	TCTG	2	8	37677	37684	0 %	50 %	25 %	25 %	406028213
104	NC_018612	CCGG	2	8	37763	37770	0 %	0 %	50 %	50 %	406028213
105	NC_018612	AGCA	2	8	39109	39116	50 %	0 %	25 %	25 %	406028215
106	NC_018612	CGCC	2	8	39329	39336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_018612	GTCC	2	8	39447	39454	0 %	25 %	25 %	50 %	406028216
108	NC_018612	CCGA	2	8	39499	39506	25 %	0 %	25 %	50 %	406028216
109	NC_018612	GCCG	2	8	40016	40023	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
110	NC_018612	GTCG	2	8	40128	40135	0 %	25 %	50 %	25 %	406028216
111	NC_018612	CGGC	2	8	40843	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	406028216
112	NC_018612	GCCG	2	8	41076	41083	0 %	0 %	50 %	50 %	406028217
113	NC_018612	TCGG	2	8	41815	41822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018612	GCGG	2	8	42038	42045	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
115	NC_018612	GACC	2	8	42050	42057	25 %	0 %	25 %	50 %	406028220
116	NC_018612	CCCG	2	8	42295	42302	0 %	0 %	25 %	75 %	406028220
117	NC_018612	GGCG	2	8	42359	42366	0 %	0 %	75 %	25 %	406028220
118	NC_018612	CCAC	2	8	42376	42383	25 %	0 %	0 %	75 %	406028220
119	NC_018612	GCCG	2	8	42605	42612	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
120	NC_018612	GCCG	2	8	42689	42696	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
121	NC_018612	GCCG	2	8	42794	42801	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
122	NC_018612	GCCG	2	8	42827	42834	0 %	0 %	50 %	50 %	406028220
123	NC_018612	CCAG	2	8	44223	44230	25 %	0 %	25 %	50 %	406028222
124	NC_018612	CGGT	2	8	44477	44484	0 %	25 %	50 %	25 %	406028222
125	NC_018612	CGGC	2	8	44603	44610	0 %	0 %	50 %	50 %	406028222
126	NC_018612	CGGT	2	8	44795	44802	0 %	25 %	50 %	25 %	406028222
127	NC_018612	GCCG	2	8	44967	44974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018612	GGCC	2	8	45056	45063	0 %	0 %	50 %	50 %	406028223
129	NC_018612	CATC	2	8	45212	45219	25 %	25 %	0 %	50 %	406028223
130	NC_018612	CAGC	2	8	45600	45607	25 %	0 %	25 %	50 %	406028223
131	NC_018612	ACCG	2	8	45819	45826	25 %	0 %	25 %	50 %	406028223
132	NC_018612	CGCC	2	8	45956	45963	0 %	0 %	25 %	75 %	406028223
133	NC_018612	ACCC	2	8	47011	47018	25 %	0 %	0 %	75 %	406028224
134	NC_018612	TGGG	2	8	47272	47279	0 %	25 %	75 %	0 %	406028225
135	NC_018612	GTCG	2	8	47838	47845	0 %	25 %	50 %	25 %	406028226
136	NC_018612	CGAG	2	8	47888	47895	25 %	0 %	50 %	25 %	406028226
137	NC_018612	GCGG	2	8	48213	48220	0 %	0 %	75 %	25 %	406028226
138	NC_018612	GACG	2	8	49110	49117	25 %	0 %	50 %	25 %	406028227
139	NC_018612	CACC	2	8	49218	49225	25 %	0 %	0 %	75 %	406028227
140	NC_018612	CGGG	2	8	49458	49465	0 %	0 %	75 %	25 %	406028227
141	NC_018612	CCGC	2	8	50318	50325	0 %	0 %	25 %	75 %	406028227
142	NC_018612	CGCC	2	8	50385	50392	0 %	0 %	25 %	75 %	406028227
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279	NC_018612	CCTT	2	8	102598	102605	0 %	50 %	0 %	50 %	406028271
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