MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 7921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	CGA	2	6	1696	1701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018612	TCG	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018612	TTC	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018612	CGT	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018612	GGA	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018612	GTT	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018612	GTC	3	9	1934	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018612	GCC	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018612	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018612	GAG	2	6	9871	9876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018612	TGC	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018612	GGC	2	6	10884	10889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018612	TCG	2	6	10903	10908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018612	TCC	2	6	10988	10993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018612	ACG	2	6	11084	11089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018612	ACC	2	6	11132	11137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018612	TCG	2	6	13590	13595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018612	GCC	2	6	13662	13667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018612	CGG	2	6	13751	13756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018612	TCG	2	6	13780	13785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018612	ACA	2	6	14679	14684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018612	CGG	2	6	14722	14727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018612	CAA	2	6	14758	14763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018612	TGC	2	6	14819	14824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018612	CAC	2	6	14845	14850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018612	GGT	2	6	14912	14917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018612	TGC	2	6	14976	14981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018612	CGC	2	6	16137	16142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018612	CGG	2	6	21504	21509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018612	AGG	2	6	22834	22839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018612	CGG	2	6	22852	22857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018612	CTC	2	6	24386	24391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018612	CAT	2	6	24421	24426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018612	CGT	2	6	24931	24936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018612	GGT	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018612	GCG	2	6	26820	26825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018612	GTT	2	6	26903	26908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018612	TAC	2	6	27007	27012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018612	GGC	2	6	28422	28427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018612	CAT	2	6	28481	28486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018612	TCG	2	6	28567	28572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018612	ACA	2	6	28638	28643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018612	CCT	2	6	28705	28710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018612	TGC	2	6	31394	31399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018612	GCG	2	6	31400	31405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018612	GTG	2	6	32960	32965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018612	GCG	2	6	32996	33001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018612	GCC	2	6	33094	33099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018612	GCG	2	6	33190	33195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018612	TGC	2	6	33248	33253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018612	TCC	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018612	CTT	2	6	33318	33323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018612	TCA	2	6	33410	33415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018612	CTA	2	6	33464	33469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018612	ACG	2	6	33533	33538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018612	CGT	2	6	33546	33551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018612	AGC	2	6	33602	33607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018612	GAA	2	6	33640	33645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018612	CGC	2	6	33689	33694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018612	GAT	2	6	33788	33793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018612	CCA	2	6	35185	35190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018612	CAA	2	6	36669	36674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018612	AAC	2	6	37189	37194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018612	ACG	2	6	38899	38904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018612	TGC	2	6	39302	39307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018612	ACT	2	6	39337	39342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018612	CGG	2	6	40894	40899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018612	TGG	2	6	41803	41808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018612	CGA	2	6	43588	43593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018612	GTC	2	6	43984	43989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018612	CTG	2	6	44009	44014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018612	CGG	2	6	44052	44057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018612	CGG	2	6	44975	44980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018612	CGT	2	6	44993	44998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018612	CAA	2	6	46358	46363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018612	CGA	2	6	46405	46410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018612	GAT	2	6	46423	46428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018612	GCC	2	6	47424	47429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018612	GCC	2	6	47456	47461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018612	CAG	2	6	52462	52467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018612	CGG	3	9	55624	55632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018612	CGG	2	6	56502	56507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018612	ACG	2	6	58529	58534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018612	GTC	2	6	59585	59590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018612	CGT	2	6	59603	59608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018612	CGC	2	6	59627	59632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018612	TCG	2	6	59686	59691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018612	CGT	2	6	59698	59703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018612	CGG	2	6	59719	59724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018612	GTC	2	6	59759	59764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018612	CAG	2	6	59783	59788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018612	CAC	2	6	59843	59848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018612	GCA	2	6	59920	59925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018612	GAC	2	6	59940	59945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018612	CGA	2	6	59949	59954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018612	CGA	2	6	59989	59994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018612	TCG	2	6	60060	60065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018612	GCC	2	6	60082	60087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018612	CCG	2	6	65485	65490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018612	GTT	2	6	65522	65527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018612	GCC	2	6	65529	65534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018612	CGC	2	6	65547	65552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018612	AAC	2	6	65553	65558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018612	ACG	2	6	67318	67323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018612	GCC	2	6	68383	68388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018612	CGT	2	6	68422	68427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018612	TGG	2	6	68432	68437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018612	GTC	2	6	68903	68908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018612	CCT	2	6	73819	73824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018612	AGG	2	6	73857	73862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018612	CGG	2	6	74192	74197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018612	GCG	2	6	74250	74255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018612	GAG	2	6	74272	74277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018612	CAG	2	6	74809	74814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018612	CGG	2	6	75605	75610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018612	GCC	3	9	75623	75631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018612	GTT	2	6	75660	75665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018612	GGT	2	6	75673	75678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018612	TAG	2	6	75972	75977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018612	CGT	2	6	75992	75997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018612	CAG	2	6	79005	79010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018612	TGA	2	6	79201	79206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018612	CGT	2	6	79211	79216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018612	CGC	2	6	79229	79234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018612	GCG	2	6	81068	81073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018612	GGT	2	6	81172	81177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018612	CGA	2	6	81213	81218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018612	CGG	2	6	81219	81224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018612	ACG	2	6	81233	81238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018612	CGG	2	6	81339	81344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018612	GGC	3	9	81373	81381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018612	CAG	2	6	81941	81946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018612	GCG	2	6	81987	81992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018612	CCA	2	6	83221	83226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018612	CGC	2	6	83284	83289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018612	CGA	2	6	83329	83334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018612	CGC	2	6	83404	83409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018612	CCG	2	6	83485	83490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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