MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 chromosome

Total Repeats: 105137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018612	GCC	2	6	55	60	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
2	NC_018612	CAC	2	6	66	71	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028181
3	NC_018612	GCA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
4	NC_018612	TCG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028181
5	NC_018612	CTG	2	6	151	156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028181
6	NC_018612	AGC	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
7	NC_018612	GCC	2	6	227	232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
8	NC_018612	ACA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028181
9	NC_018612	CGA	2	6	279	284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
10	NC_018612	CGG	2	6	308	313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028181
11	NC_018612	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
12	NC_018612	CGC	2	6	354	359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
13	NC_018612	CGA	2	6	369	374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
14	NC_018612	ACT	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028181
15	NC_018612	CGC	2	6	465	470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
16	NC_018612	CCG	2	6	486	491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
17	NC_018612	TGC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028181
18	NC_018612	CGC	2	6	636	641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
19	NC_018612	TCA	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028181
20	NC_018612	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
21	NC_018612	GCT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028181
22	NC_018612	CGA	2	6	789	794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
23	NC_018612	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028181
24	NC_018612	CAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028181
25	NC_018612	GCC	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
26	NC_018612	AGC	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
27	NC_018612	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
28	NC_018612	CAG	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028181
29	NC_018612	CCA	2	6	1220	1225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028181
30	NC_018612	GCC	2	6	1231	1236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
31	NC_018612	CCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028181
32	NC_018612	ACC	2	6	1255	1260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028181
33	NC_018612	GAA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028181
34	NC_018612	GCG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028181
35	NC_018612	CAC	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028181
36	NC_018612	CGA	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
37	NC_018612	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028182
38	NC_018612	TGC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028182
39	NC_018612	CGA	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
40	NC_018612	CCG	2	6	2457	2462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028182
41	NC_018612	GGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028182
42	NC_018612	GCC	2	6	2573	2578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028182
43	NC_018612	CGG	2	6	2619	2624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028182
44	NC_018612	GCC	2	6	2678	2683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028182
45	NC_018612	GCA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
46	NC_018612	GCT	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028182
47	NC_018612	CCG	2	6	2847	2852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028182
48	NC_018612	CGA	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
49	NC_018612	CGA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
50	NC_018612	AAG	2	6	2994	2999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028182
51	NC_018612	TGC	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028182
52	NC_018612	GAC	3	9	3146	3154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028182
53	NC_018612	GCC	2	6	3431	3436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
54	NC_018612	ACG	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
55	NC_018612	CGC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
56	NC_018612	GCA	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
57	NC_018612	GTT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028183
58	NC_018612	GCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028183
59	NC_018612	CGC	2	6	3635	3640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
60	NC_018612	CGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
61	NC_018612	GGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028183
62	NC_018612	TGC	2	6	3708	3713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028183
63	NC_018612	CTG	2	6	3890	3895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028183
64	NC_018612	CGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
65	NC_018612	CGG	2	6	3967	3972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028183
66	NC_018612	GAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
67	NC_018612	CGC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
68	NC_018612	CGA	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
69	NC_018612	GTT	2	6	4201	4206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028183
70	NC_018612	CGA	2	6	4210	4215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028183
71	NC_018612	CCG	2	6	4293	4298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028183
72	NC_018612	GTC	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028183
73	NC_018612	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028183
74	NC_018612	GAG	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028184
75	NC_018612	GCG	3	9	4492	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028184
76	NC_018612	GTC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028184
77	NC_018612	GCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028184
78	NC_018612	GGT	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028184
79	NC_018612	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028184
80	NC_018612	GAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028184
81	NC_018612	GTT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028184
82	NC_018612	CGC	3	9	4836	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028184
83	NC_018612	GTG	2	6	4858	4863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028184
84	NC_018612	CGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028184
85	NC_018612	AGA	3	9	5224	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033432
86	NC_018612	CAC	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033432
87	NC_018612	GGT	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033432
88	NC_018612	CGA	2	6	5375	5380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
89	NC_018612	CAA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033432
90	NC_018612	CGA	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
91	NC_018612	CGT	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033432
92	NC_018612	CGG	2	6	5528	5533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
93	NC_018612	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
94	NC_018612	GGT	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033432
95	NC_018612	CCA	2	6	5707	5712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033432
96	NC_018612	CAC	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033432
97	NC_018612	ACC	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406033432
98	NC_018612	CAA	2	6	5819	5824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033432
99	NC_018612	CGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
100	NC_018612	GAG	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406033432
101	NC_018612	GTC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033432
102	NC_018612	GTC	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033432
103	NC_018612	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033432
104	NC_018612	GGC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
105	NC_018612	CGG	2	6	5981	5986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
106	NC_018612	CAG	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
107	NC_018612	CAT	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033432
108	NC_018612	CGG	2	6	6101	6106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
109	NC_018612	GGC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406033432
110	NC_018612	GGT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033432
111	NC_018612	AAG	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033432
112	NC_018612	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
113	NC_018612	GGT	3	9	6431	6439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033432
114	NC_018612	CAA	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033432
115	NC_018612	GTC	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406033432
116	NC_018612	CGC	2	6	6473	6478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033432
117	NC_018612	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406033432
118	NC_018612	ATC	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033432
119	NC_018612	GAA	2	6	6710	6715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033432
120	NC_018612	CAT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406033432
121	NC_018612	ACG	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
122	NC_018612	TTG	2	6	6849	6854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033432
123	NC_018612	CCG	2	6	6915	6920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033432
124	NC_018612	TTG	2	6	6987	6992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406033432
125	NC_018612	AAG	2	6	7014	7019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406033432
126	NC_018612	CAA	2	6	7022	7027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406033432
127	NC_018612	GAC	2	6	7029	7034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
128	NC_018612	GAC	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406033432
129	NC_018612	GCC	2	6	7146	7151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406033432
130	NC_018612	CTT	2	6	7232	7237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406033432
131	NC_018612	GCC	2	6	7316	7321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028185
132	NC_018612	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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134	NC_018612	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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138	NC_018612	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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142	NC_018612	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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144	NC_018612	ACG	2	6	8023	8028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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146	NC_018612	TCA	2	6	8110	8115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028185
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153	NC_018612	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028185
154	NC_018612	CGA	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
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163	NC_018612	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028185
164	NC_018612	GCG	2	6	8780	8785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028185
165	NC_018612	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028185
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251	NC_018612	GCC	2	6	13469	13474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028189
252	NC_018612	CGG	2	6	13482	13487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028189
253	NC_018612	CGA	2	6	13557	13562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028189
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255	NC_018612	GCG	2	6	14074	14079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028190
256	NC_018612	CGA	2	6	14123	14128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028190
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492	NC_018612	GCG	2	6	26008	26013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028201
493	NC_018612	CTG	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028201
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498	NC_018612	CTC	2	6	26206	26211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028201
499	NC_018612	CAC	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028201
500	NC_018612	CGA	2	6	26327	26332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028201

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