MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	CGCCAG	2	12	5922	5933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406025815
2	NC_018611	GTACGA	2	12	6258	6269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025815
3	NC_018611	TTTTGA	2	12	7134	7145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025815
4	NC_018611	CAAGTT	2	12	10555	10566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025818
5	NC_018611	GATGTG	2	12	15917	15928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	406025823
6	NC_018611	AACTGA	2	12	17049	17060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025824
7	NC_018611	AACTGA	2	12	20212	20223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	406025826
8	NC_018611	CTATTT	2	12	21026	21037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025827
9	NC_018611	TATGGC	2	12	23391	23402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025829
10	NC_018611	CGTAGT	2	12	24315	24326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025831
11	NC_018611	TTCAGT	2	12	32631	32642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025839
12	NC_018611	CTGCCG	2	12	35780	35791	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	406025844
13	NC_018611	ATTGAT	2	12	36257	36268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406025845
14	NC_018611	AGATAT	2	12	36988	36999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025845
15	NC_018611	GATAAT	2	12	37325	37336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025846
16	NC_018611	TTTAAT	2	12	37697	37708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025846
17	NC_018611	TTCATT	2	12	41624	41635	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406025849
18	NC_018611	CAAGTT	2	12	43045	43056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025850
19	NC_018611	TTGACA	2	12	45894	45905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025853
20	NC_018611	CAAGTT	2	12	50888	50899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.