MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	ACAAA	2	10	2093	2102	80 %	0 %	0 %	20 %	406025811
2	NC_018611	CTCAA	2	10	2264	2273	40 %	20 %	0 %	40 %	406025811
3	NC_018611	TTTTA	2	10	3604	3613	20 %	80 %	0 %	0 %	406025814
4	NC_018611	CGGAT	2	10	4083	4092	20 %	20 %	40 %	20 %	406025814
5	NC_018611	AGCTT	2	10	5115	5124	20 %	40 %	20 %	20 %	406025814
6	NC_018611	ACGCC	2	10	10601	10610	20 %	0 %	20 %	60 %	406025818
7	NC_018611	AATGC	2	10	14937	14946	40 %	20 %	20 %	20 %	406025822
8	NC_018611	ATTAG	2	10	15172	15181	40 %	40 %	20 %	0 %	406025822
9	NC_018611	AACTT	2	10	16404	16413	40 %	40 %	0 %	20 %	406025824
10	NC_018611	CATTT	2	10	17396	17405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018611	AACTT	2	10	19567	19576	40 %	40 %	0 %	20 %	406025826
12	NC_018611	CATTT	2	10	20559	20568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018611	TCAAA	2	10	22636	22645	60 %	20 %	0 %	20 %	406025828
14	NC_018611	GATAT	2	10	23451	23460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018611	TAAAA	2	10	24195	24204	80 %	20 %	0 %	0 %	406025830
16	NC_018611	ATGAA	2	10	25367	25376	60 %	20 %	20 %	0 %	406025832
17	NC_018611	GCTAC	2	10	26662	26671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018611	TTAGA	2	10	26989	26998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018611	TGTTT	2	10	27926	27935	0 %	80 %	20 %	0 %	406025835
20	NC_018611	TTATT	2	10	30130	30139	20 %	80 %	0 %	0 %	406025837
21	NC_018611	TTCTT	2	10	30270	30279	0 %	80 %	0 %	20 %	406025837
22	NC_018611	CAATT	2	10	30471	30480	40 %	40 %	0 %	20 %	406025837
23	NC_018611	AAATG	2	10	32287	32296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018611	GTTAA	2	10	34142	34151	40 %	40 %	20 %	0 %	406025841
25	NC_018611	AGGCC	2	10	34885	34894	20 %	0 %	40 %	40 %	406025843
26	NC_018611	TGAAT	2	10	35220	35229	40 %	40 %	20 %	0 %	406025844
27	NC_018611	GAAAA	2	10	36683	36692	80 %	0 %	20 %	0 %	406025845
28	NC_018611	TATTT	2	10	37790	37799	20 %	80 %	0 %	0 %	406025846
29	NC_018611	ATATT	2	10	38125	38134	40 %	60 %	0 %	0 %	406025846
30	NC_018611	ATTTT	2	10	38202	38211	20 %	80 %	0 %	0 %	406025846
31	NC_018611	CAAAT	2	10	38792	38801	60 %	20 %	0 %	20 %	406025847
32	NC_018611	TTTGT	2	10	41561	41570	0 %	80 %	20 %	0 %	406025849
33	NC_018611	TTCAG	2	10	41918	41927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018611	ACGCC	2	10	43091	43100	20 %	0 %	20 %	60 %	406025850
35	NC_018611	TTTTA	2	10	43207	43216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018611	AACGA	2	10	45872	45881	60 %	0 %	20 %	20 %	406025853
37	NC_018611	CTTGG	2	10	45930	45939	0 %	40 %	40 %	20 %	406025853
38	NC_018611	AAATC	2	10	48013	48022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018611	AAAAT	2	10	48636	48645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018611	AATTA	2	10	48791	48800	60 %	40 %	0 %	0 %	406025856
41	NC_018611	ACGCC	2	10	50934	50943	20 %	0 %	20 %	60 %	406025857
42	NC_018611	TGGAA	2	10	54700	54709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018611	ATTGT	2	10	55366	55375	20 %	60 %	20 %	0 %	406025864

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.