MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	TAAA	2	8	1790	1797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018611	ATGT	2	8	8779	8786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018611	AATT	2	8	9329	9336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018611	GAAC	2	8	13645	13652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018611	TGCT	2	8	14194	14201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018611	AAAT	2	8	18603	18610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018611	TTAT	2	8	18622	18629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018611	GATA	2	8	18641	18648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018611	TATT	2	8	20734	20741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018611	AAAT	2	8	20742	20749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018611	AGTA	2	8	26836	26843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018611	GGTG	2	8	27094	27101	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018611	TTCT	2	8	27171	27178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018611	ACTT	2	8	27190	27197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018611	ATTG	2	8	28721	28728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018611	GTTA	2	8	28895	28902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018611	TAAT	2	8	29451	29458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018611	ATTT	2	8	29522	29529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018611	GTAT	2	8	30685	30692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018611	AATG	2	8	32001	32008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018611	TTAA	2	8	32073	32080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018611	TCCT	2	8	32196	32203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018611	AGGA	2	8	34744	34751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018611	ATTT	2	8	35954	35961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018611	TAAG	2	8	38727	38734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	TAGT	2	8	39687	39694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018611	TAAT	2	8	39950	39957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018611	AATC	2	8	40926	40933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018611	TAAT	2	8	44752	44759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018611	GGTT	2	8	47018	47025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018611	TAAT	2	8	47998	48005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018611	TCTT	2	8	48493	48500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018611	CATT	2	8	51071	51078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018611	TTTC	2	8	53861	53868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018611	TTTA	2	8	54638	54645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018611	ATTT	2	8	54775	54782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018611	ATTG	2	8	54809	54816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018611	ACCT	2	8	55903	55910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018611	GCAA	2	8	56179	56186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018611	GCAA	2	8	56197	56204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018611	CAAA	2	8	56316	56323	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018611	TCAG	2	8	56374	56381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.