MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	AAC	2	6	166	171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025808
2	NC_018611	TGA	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
3	NC_018611	GAA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
4	NC_018611	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
5	NC_018611	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
6	NC_018611	ATC	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
7	NC_018611	TCA	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
8	NC_018611	CTT	2	6	699	704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025808
9	NC_018611	TGA	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
10	NC_018611	CAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025808
11	NC_018611	ATC	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
12	NC_018611	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
13	NC_018611	TGA	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
14	NC_018611	AAG	2	6	933	938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
15	NC_018611	ACT	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
16	NC_018611	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025808
17	NC_018611	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
18	NC_018611	TGG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018611	AAG	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018611	GAT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018611	AGT	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018611	ATA	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025809
23	NC_018611	GCA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025809
24	NC_018611	AAG	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025809
25	NC_018611	TAA	2	6	1799	1804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	TGA	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025810
27	NC_018611	TTA	2	6	1980	1985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025810
28	NC_018611	TTG	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025811
29	NC_018611	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025811
30	NC_018611	AGA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025811
31	NC_018611	AAC	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025811
32	NC_018611	ACA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025811
33	NC_018611	TAT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025811
34	NC_018611	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025811
35	NC_018611	TTA	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025811
36	NC_018611	TTC	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025812
37	NC_018611	TTA	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025812
38	NC_018611	TAA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025812
39	NC_018611	TGC	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025812
40	NC_018611	TGA	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018611	GTT	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025813
42	NC_018611	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025813
43	NC_018611	AAT	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025813
44	NC_018611	AGA	2	6	3310	3315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018611	ACA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018611	GTG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025814
47	NC_018611	ATT	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
48	NC_018611	TGA	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
49	NC_018611	AAG	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025814
50	NC_018611	TGA	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
51	NC_018611	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
52	NC_018611	AGT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
53	NC_018611	GAT	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
54	NC_018611	GCG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025814
55	NC_018611	ATT	2	6	4438	4443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
56	NC_018611	CAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
57	NC_018611	ACG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
58	NC_018611	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
59	NC_018611	ATT	2	6	4669	4674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
60	NC_018611	CAA	2	6	4718	4723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
61	NC_018611	TGA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
62	NC_018611	ATG	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
63	NC_018611	CTA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
64	NC_018611	AGC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
65	NC_018611	AAG	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025814
66	NC_018611	CCA	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025814
67	NC_018611	CAA	2	6	5087	5092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
68	NC_018611	ATC	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
69	NC_018611	ATG	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
70	NC_018611	CGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
71	NC_018611	CAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
72	NC_018611	GAC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
73	NC_018611	CTA	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
74	NC_018611	TGA	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
75	NC_018611	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
76	NC_018611	TCG	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025815
77	NC_018611	TAA	2	6	5777	5782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025815
78	NC_018611	GGC	2	6	5943	5948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025815
79	NC_018611	TGA	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
80	NC_018611	ACC	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
81	NC_018611	GAA	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
82	NC_018611	CGA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025815
83	NC_018611	AAC	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
84	NC_018611	ACC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
85	NC_018611	ATT	2	6	6280	6285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025815
86	NC_018611	TGA	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
87	NC_018611	AAG	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
88	NC_018611	ACC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
89	NC_018611	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025815
90	NC_018611	TGA	3	9	6522	6530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
91	NC_018611	ACA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
92	NC_018611	GAA	2	6	6757	6762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
93	NC_018611	CAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
94	NC_018611	CGA	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025815
95	NC_018611	TCT	2	6	6902	6907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025815
96	NC_018611	GTT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018611	AGG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018611	GAG	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025816
99	NC_018611	AGA	2	6	7499	7504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025817
100	NC_018611	GAA	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025817
101	NC_018611	AAC	2	6	7534	7539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
102	NC_018611	TAA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025817
103	NC_018611	GCG	2	6	7849	7854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025817
104	NC_018611	ATT	2	6	7939	7944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025817
105	NC_018611	TGG	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025817
106	NC_018611	ACT	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025817
107	NC_018611	CAA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
108	NC_018611	AAG	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025817
109	NC_018611	TAA	2	6	8405	8410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025817
110	NC_018611	CAA	3	9	8427	8435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
111	NC_018611	CAA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
112	NC_018611	AAC	2	6	8524	8529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
113	NC_018611	GAA	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025817
114	NC_018611	AAC	2	6	8563	8568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025817
115	NC_018611	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018611	ATT	2	6	8872	8877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018611	TAT	2	6	8947	8952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018611	TAA	2	6	9024	9029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018611	TAC	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018611	AGC	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018611	AAC	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018611	CAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018611	TTC	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018611	GTA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018611	CCA	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018611	TTG	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018611	TAC	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025818
128	NC_018611	GTG	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025818
129	NC_018611	AGA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025818
130	NC_018611	ATC	2	6	9986	9991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025818
131	NC_018611	GCC	2	6	10085	10090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025818
132	NC_018611	CCA	2	6	10107	10112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025818
133	NC_018611	AAC	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025818
134	NC_018611	AAC	2	6	10544	10549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025818
135	NC_018611	ACC	2	6	10574	10579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025818
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260	NC_018611	TCT	2	6	19831	19836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025826
261	NC_018611	AAG	2	6	19879	19884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025826
262	NC_018611	AAG	2	6	19924	19929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025826
263	NC_018611	CTG	2	6	19980	19985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025826
264	NC_018611	TGT	2	6	20020	20025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025826
265	NC_018611	TGA	2	6	20122	20127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025826
266	NC_018611	GAC	2	6	20145	20150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025826
267	NC_018611	GCC	2	6	20190	20195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025826
268	NC_018611	AGC	2	6	20204	20209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025826
269	NC_018611	AAC	2	6	20235	20240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025826
270	NC_018611	TAA	2	6	20363	20368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025826
271	NC_018611	CAC	2	6	20381	20386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025826
272	NC_018611	CCA	2	6	20387	20392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025826
273	NC_018611	CAT	2	6	20518	20523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025826
274	NC_018611	AAT	2	6	20593	20598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_018611	TAT	3	9	20618	20626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018611	ATT	2	6	20639	20644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018611	TAG	2	6	20687	20692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018611	AAT	2	6	20698	20703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_018611	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018611	GTT	2	6	20880	20885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025827
281	NC_018611	TAT	2	6	20888	20893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025827
282	NC_018611	ATA	2	6	21014	21019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025827
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284	NC_018611	TAT	2	6	21102	21107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025827
285	NC_018611	ATG	2	6	21139	21144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025827
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291	NC_018611	TAG	2	6	21546	21551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025827
292	NC_018611	TGT	2	6	21645	21650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025827
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298	NC_018611	GGA	2	6	21794	21799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_018611	ATT	2	6	21811	21816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025828
300	NC_018611	ATT	2	6	21840	21845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025828
301	NC_018611	ATT	2	6	21891	21896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025828
302	NC_018611	TTA	2	6	21919	21924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025828
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367	NC_018611	TAA	2	6	27365	27370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_018611	CCA	2	6	28566	28571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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