MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	TGG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018611	AAG	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018611	GAT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018611	AGT	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018611	TAA	2	6	1799	1804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018611	TGA	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018611	AGA	2	6	3310	3315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018611	ACA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018611	GTT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018611	AGG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018611	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018611	ATT	2	6	8872	8877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018611	TAT	2	6	8947	8952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018611	TAA	2	6	9024	9029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018611	TAC	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018611	AGC	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018611	AAC	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018611	CAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018611	TTC	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018611	GTA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018611	CCA	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018611	TTG	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018611	TTA	2	6	13586	13591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018611	TAA	2	6	13793	13798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018611	AAT	2	6	13806	13811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	ATT	2	6	13840	13845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018611	CAA	2	6	13870	13875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018611	AGT	2	6	14093	14098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018611	AGG	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018611	GAA	2	6	16024	16029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018611	AGG	2	6	16176	16181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018611	TTA	2	6	17434	17439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018611	GAA	2	6	17467	17472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018611	CAA	2	6	17481	17486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018611	TTA	2	6	18498	18503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018611	ATG	2	6	18512	18517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018611	CAA	2	6	18539	18544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018611	TAA	2	6	18557	18562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018611	TAT	2	6	18584	18589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018611	ATG	2	6	18848	18853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018611	ATC	2	6	18917	18922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018611	TAA	2	6	19012	19017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018611	AAT	2	6	19028	19033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018611	TAA	2	6	19047	19052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018611	TCA	2	6	19054	19059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018611	ATT	2	6	19069	19074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018611	TTC	2	6	19108	19113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018611	AGG	2	6	19339	19344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018611	AAT	2	6	20593	20598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018611	TAT	3	9	20618	20626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018611	ATT	2	6	20639	20644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018611	TAG	2	6	20687	20692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018611	AAT	2	6	20698	20703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018611	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018611	GGA	2	6	21794	21799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018611	GAG	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018611	CAT	2	6	26686	26691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018611	TAA	2	6	27061	27066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018611	ATA	2	6	27126	27131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018611	GTA	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018611	TAA	2	6	27365	27370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018611	AAG	2	6	28541	28546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018611	CCA	2	6	28566	28571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018611	ATA	2	6	28587	28592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018611	GCA	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018611	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018611	ATA	2	6	28706	28711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018611	CTT	2	6	28827	28832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018611	TGA	2	6	28871	28876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018611	AAT	2	6	29380	29385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018611	TGC	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018611	ACA	2	6	30851	30856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018611	ATT	2	6	30867	30872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018611	TTA	2	6	32100	32105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018611	TTA	2	6	32157	32162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018611	ATA	2	6	32308	32313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018611	CCT	2	6	34377	34382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018611	ATC	2	6	34731	34736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018611	CAC	2	6	35047	35052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018611	TTA	2	6	35935	35940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018611	ATT	2	6	38536	38541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018611	TAA	2	6	38556	38561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018611	GTG	2	6	38585	38590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018611	ATT	2	6	39362	39367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018611	TAA	2	6	39387	39392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018611	TCA	2	6	39533	39538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018611	CAT	3	9	39612	39620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018611	GAT	2	6	39708	39713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018611	TAA	2	6	39724	39729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018611	TCT	2	6	39762	39767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018611	AAT	2	6	39772	39777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018611	CAA	2	6	39834	39839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018611	GTT	2	6	40872	40877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018611	ATA	2	6	40943	40948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018611	GAA	2	6	40949	40954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018611	TAA	2	6	41666	41671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018611	ATT	2	6	41676	41681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018611	TTA	2	6	41741	41746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018611	CAC	2	6	41759	41764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018611	AGC	2	6	41775	41780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018611	CAA	2	6	41864	41869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018611	AAT	2	6	41908	41913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018611	AGA	2	6	41933	41938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018611	ACT	2	6	43152	43157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018611	CTT	2	6	43291	43296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018611	ATT	2	6	43321	43326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018611	CCT	2	6	44692	44697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018611	AAT	2	6	44698	44703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018611	GAT	2	6	44724	44729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018611	TAT	2	6	46998	47003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018611	TGG	2	6	47055	47060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018611	GGC	2	6	47073	47078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018611	TGT	2	6	47085	47090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018611	ACC	2	6	47984	47989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018611	AAT	2	6	48103	48108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018611	AGT	2	6	48239	48244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018611	TTA	2	6	48333	48338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018611	AAG	2	6	48376	48381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018611	TGA	2	6	48457	48462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018611	AAT	2	6	48583	48588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018611	AAC	2	6	49659	49664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018611	CAT	2	6	49694	49699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018611	CAA	2	6	49704	49709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018611	TTA	2	6	49746	49751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018611	TGG	2	6	49785	49790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018611	CAT	2	6	49820	49825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018611	ACT	2	6	50995	51000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018611	GAC	2	6	51086	51091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018611	ACA	2	6	51108	51113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018611	AGG	2	6	51860	51865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018611	CAT	2	6	54604	54609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018611	TAA	2	6	56253	56258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018611	ATG	2	6	56359	56364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.