MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	406025808
2	NC_018611	TA	3	6	1944	1949	50 %	50 %	0 %	0 %	406025810
3	NC_018611	AT	3	6	2022	2027	50 %	50 %	0 %	0 %	406025811
4	NC_018611	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	406025811
5	NC_018611	AG	3	6	3598	3603	50 %	0 %	50 %	0 %	406025814
6	NC_018611	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	406025814
7	NC_018611	AC	3	6	4128	4133	50 %	0 %	0 %	50 %	406025814
8	NC_018611	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	406025816
9	NC_018611	CA	3	6	7419	7424	50 %	0 %	0 %	50 %	406025816
10	NC_018611	TC	3	6	10742	10747	0 %	50 %	0 %	50 %	406025819
11	NC_018611	TA	3	6	10755	10760	50 %	50 %	0 %	0 %	406025819
12	NC_018611	TA	4	8	10787	10794	50 %	50 %	0 %	0 %	406025819
13	NC_018611	GT	3	6	11677	11682	0 %	50 %	50 %	0 %	406025820
14	NC_018611	TC	3	6	11933	11938	0 %	50 %	0 %	50 %	406025820
15	NC_018611	TA	3	6	12051	12056	50 %	50 %	0 %	0 %	406025820
16	NC_018611	AT	4	8	12472	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	406025821
17	NC_018611	AT	3	6	13387	13392	50 %	50 %	0 %	0 %	406025821
18	NC_018611	TA	3	6	15283	15288	50 %	50 %	0 %	0 %	406025822
19	NC_018611	GT	3	6	15984	15989	0 %	50 %	50 %	0 %	406025823
20	NC_018611	TA	3	6	17936	17941	50 %	50 %	0 %	0 %	406025825
21	NC_018611	AT	3	6	18364	18369	50 %	50 %	0 %	0 %	406025825
22	NC_018611	GA	3	6	24262	24267	50 %	0 %	50 %	0 %	406025831
23	NC_018611	AT	3	6	24383	24388	50 %	50 %	0 %	0 %	406025831
24	NC_018611	AG	3	6	24742	24747	50 %	0 %	50 %	0 %	406025831
25	NC_018611	TA	3	6	24871	24876	50 %	50 %	0 %	0 %	406025831
26	NC_018611	TA	3	6	25279	25284	50 %	50 %	0 %	0 %	406025832
27	NC_018611	TG	3	6	25620	25625	0 %	50 %	50 %	0 %	406025833
28	NC_018611	TA	3	6	25783	25788	50 %	50 %	0 %	0 %	406025833
29	NC_018611	TA	3	6	29630	29635	50 %	50 %	0 %	0 %	406025837
30	NC_018611	CT	3	6	29694	29699	0 %	50 %	0 %	50 %	406025837
31	NC_018611	CT	3	6	30242	30247	0 %	50 %	0 %	50 %	406025837
32	NC_018611	AT	3	6	31005	31010	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
33	NC_018611	AT	3	6	31209	31214	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
34	NC_018611	GA	3	6	31728	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	406025838
35	NC_018611	TA	3	6	34806	34811	50 %	50 %	0 %	0 %	406025843
36	NC_018611	TA	3	6	36708	36713	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
37	NC_018611	AT	3	6	36874	36879	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
38	NC_018611	TA	3	6	37197	37202	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
39	NC_018611	TA	3	6	37671	37676	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
40	NC_018611	CT	3	6	37862	37867	0 %	50 %	0 %	50 %	406025846
41	NC_018611	AT	3	6	38331	38336	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
42	NC_018611	TA	3	6	38402	38407	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
43	NC_018611	TA	3	6	38466	38471	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
44	NC_018611	GC	3	6	38892	38897	0 %	0 %	50 %	50 %	406025847
45	NC_018611	CG	3	6	38954	38959	0 %	0 %	50 %	50 %	406025847
46	NC_018611	CA	3	6	39111	39116	50 %	0 %	0 %	50 %	406025847
47	NC_018611	AT	3	6	40042	40047	50 %	50 %	0 %	0 %	406025848
48	NC_018611	TA	3	6	40434	40439	50 %	50 %	0 %	0 %	406025848
49	NC_018611	CT	3	6	41170	41175	0 %	50 %	0 %	50 %	406025849
50	NC_018611	TG	3	6	41261	41266	0 %	50 %	50 %	0 %	406025849
51	NC_018611	GT	3	6	44939	44944	0 %	50 %	50 %	0 %	406025852
52	NC_018611	TG	3	6	46677	46682	0 %	50 %	50 %	0 %	406025854
53	NC_018611	TC	3	6	52233	52238	0 %	50 %	0 %	50 %	406025860
54	NC_018611	AT	3	6	52341	52346	50 %	50 %	0 %	0 %	406025860
55	NC_018611	TC	3	6	54318	54323	0 %	50 %	0 %	50 %	406025862
56	NC_018611	AG	3	6	54354	54359	50 %	0 %	50 %	0 %	406025862

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.