MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	A	7	7	33	39	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
2	NC_018611	T	7	7	54	60	0 %	100 %	0 %	0 %	406025808
3	NC_018611	A	7	7	264	270	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
4	NC_018611	A	8	8	391	398	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
5	NC_018611	G	7	7	1478	1484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018611	T	6	6	1850	1855	0 %	100 %	0 %	0 %	406025810
7	NC_018611	T	6	6	2899	2904	0 %	100 %	0 %	0 %	406025812
8	NC_018611	T	6	6	3112	3117	0 %	100 %	0 %	0 %	406025813
9	NC_018611	T	6	6	3127	3132	0 %	100 %	0 %	0 %	406025813
10	NC_018611	A	6	6	4014	4019	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
11	NC_018611	A	7	7	4071	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
12	NC_018611	A	6	6	4298	4303	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
13	NC_018611	A	7	7	4471	4477	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
14	NC_018611	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
15	NC_018611	T	6	6	5186	5191	0 %	100 %	0 %	0 %	406025814
16	NC_018611	A	6	6	5854	5859	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
17	NC_018611	A	6	6	6120	6125	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
18	NC_018611	A	6	6	7081	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
19	NC_018611	A	7	7	7385	7391	100 %	0 %	0 %	0 %	406025816
20	NC_018611	A	6	6	7749	7754	100 %	0 %	0 %	0 %	406025817
21	NC_018611	A	6	6	8381	8386	100 %	0 %	0 %	0 %	406025817
22	NC_018611	A	6	6	8474	8479	100 %	0 %	0 %	0 %	406025817
23	NC_018611	A	6	6	8703	8708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018611	T	6	6	8756	8761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018611	T	6	6	9134	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	T	6	6	9194	9199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018611	T	7	7	9504	9510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018611	T	7	7	10713	10719	0 %	100 %	0 %	0 %	406025819
29	NC_018611	A	6	6	11008	11013	100 %	0 %	0 %	0 %	406025819
30	NC_018611	T	6	6	11423	11428	0 %	100 %	0 %	0 %	406025819
31	NC_018611	T	6	6	12034	12039	0 %	100 %	0 %	0 %	406025820
32	NC_018611	A	6	6	12234	12239	100 %	0 %	0 %	0 %	406025821
33	NC_018611	A	7	7	12735	12741	100 %	0 %	0 %	0 %	406025821
34	NC_018611	A	7	7	12840	12846	100 %	0 %	0 %	0 %	406025821
35	NC_018611	A	7	7	12928	12934	100 %	0 %	0 %	0 %	406025821
36	NC_018611	T	6	6	13158	13163	0 %	100 %	0 %	0 %	406025821
37	NC_018611	T	8	8	13844	13851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018611	T	6	6	14247	14252	0 %	100 %	0 %	0 %	406025822
39	NC_018611	A	6	6	14257	14262	100 %	0 %	0 %	0 %	406025822
40	NC_018611	T	7	7	14626	14632	0 %	100 %	0 %	0 %	406025822
41	NC_018611	A	7	7	14726	14732	100 %	0 %	0 %	0 %	406025822
42	NC_018611	T	6	6	15069	15074	0 %	100 %	0 %	0 %	406025822
43	NC_018611	A	7	7	15194	15200	100 %	0 %	0 %	0 %	406025822
44	NC_018611	A	6	6	15288	15293	100 %	0 %	0 %	0 %	406025822
45	NC_018611	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018611	T	7	7	15344	15350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018611	A	6	6	15546	15551	100 %	0 %	0 %	0 %	406025823
48	NC_018611	A	6	6	16028	16033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018611	A	6	6	17530	17535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018611	T	7	7	17643	17649	0 %	100 %	0 %	0 %	406025825
51	NC_018611	A	6	6	18567	18572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018611	A	6	6	18983	18988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018611	A	6	6	19175	19180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018611	A	7	7	20866	20872	100 %	0 %	0 %	0 %	406025827
55	NC_018611	A	6	6	20968	20973	100 %	0 %	0 %	0 %	406025827
56	NC_018611	A	7	7	21312	21318	100 %	0 %	0 %	0 %	406025827
57	NC_018611	A	7	7	21513	21519	100 %	0 %	0 %	0 %	406025827
58	NC_018611	T	6	6	21553	21558	0 %	100 %	0 %	0 %	406025827
59	NC_018611	T	6	6	21788	21793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018611	A	8	8	21964	21971	100 %	0 %	0 %	0 %	406025828
61	NC_018611	A	6	6	22709	22714	100 %	0 %	0 %	0 %	406025829
62	NC_018611	A	6	6	23617	23622	100 %	0 %	0 %	0 %	406025830
63	NC_018611	T	7	7	24219	24225	0 %	100 %	0 %	0 %	406025830
64	NC_018611	T	6	6	24363	24368	0 %	100 %	0 %	0 %	406025831
65	NC_018611	T	6	6	24376	24381	0 %	100 %	0 %	0 %	406025831
66	NC_018611	T	7	7	24900	24906	0 %	100 %	0 %	0 %	406025831
67	NC_018611	T	7	7	24932	24938	0 %	100 %	0 %	0 %	406025831
68	NC_018611	A	6	6	25553	25558	100 %	0 %	0 %	0 %	406025833
69	NC_018611	T	6	6	26225	26230	0 %	100 %	0 %	0 %	406025834
70	NC_018611	T	7	7	26477	26483	0 %	100 %	0 %	0 %	406025834
71	NC_018611	A	6	6	27245	27250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018611	A	6	6	28488	28493	100 %	0 %	0 %	0 %	406025835
73	NC_018611	A	6	6	28598	28603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018611	A	7	7	28743	28749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018611	T	6	6	28965	28970	0 %	100 %	0 %	0 %	406025836
76	NC_018611	T	7	7	30600	30606	0 %	100 %	0 %	0 %	406025837
77	NC_018611	A	6	6	30638	30643	100 %	0 %	0 %	0 %	406025837
78	NC_018611	A	6	6	30760	30765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018611	T	6	6	30772	30777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018611	A	7	7	31151	31157	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
81	NC_018611	A	6	6	31616	31621	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
82	NC_018611	A	6	6	31844	31849	100 %	0 %	0 %	0 %	406025838
83	NC_018611	T	6	6	31948	31953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018611	A	6	6	32256	32261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018611	A	6	6	33062	33067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018611	A	7	7	33338	33344	100 %	0 %	0 %	0 %	406025840
87	NC_018611	A	7	7	34978	34984	100 %	0 %	0 %	0 %	406025843
88	NC_018611	A	6	6	35517	35522	100 %	0 %	0 %	0 %	406025844
89	NC_018611	A	8	8	36098	36105	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
90	NC_018611	A	8	8	36397	36404	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
91	NC_018611	A	6	6	36620	36625	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
92	NC_018611	A	7	7	36689	36695	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
93	NC_018611	A	6	6	36701	36706	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
94	NC_018611	A	6	6	36713	36718	100 %	0 %	0 %	0 %	406025845
95	NC_018611	T	6	6	37180	37185	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
96	NC_018611	T	6	6	37655	37660	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
97	NC_018611	T	8	8	37956	37963	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
98	NC_018611	T	6	6	38113	38118	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
99	NC_018611	A	8	8	38140	38147	100 %	0 %	0 %	0 %	406025846
100	NC_018611	T	6	6	38413	38418	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
101	NC_018611	T	7	7	38434	38440	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
102	NC_018611	T	6	6	38457	38462	0 %	100 %	0 %	0 %	406025846
103	NC_018611	A	6	6	38606	38611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018611	A	6	6	38618	38623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018611	T	6	6	38674	38679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018611	A	6	6	38828	38833	100 %	0 %	0 %	0 %	406025847
107	NC_018611	T	7	7	39573	39579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018611	T	6	6	40341	40346	0 %	100 %	0 %	0 %	406025848
109	NC_018611	T	7	7	40388	40394	0 %	100 %	0 %	0 %	406025848
110	NC_018611	T	6	6	40523	40528	0 %	100 %	0 %	0 %	406025848
111	NC_018611	T	6	6	40596	40601	0 %	100 %	0 %	0 %	406025848
112	NC_018611	A	6	6	40858	40863	100 %	0 %	0 %	0 %	406025848
113	NC_018611	T	7	7	41083	41089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018611	T	6	6	41375	41380	0 %	100 %	0 %	0 %	406025849
115	NC_018611	T	6	6	41420	41425	0 %	100 %	0 %	0 %	406025849
116	NC_018611	A	6	6	41752	41757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018611	A	7	7	43265	43271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018611	T	6	6	44686	44691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018611	T	7	7	45197	45203	0 %	100 %	0 %	0 %	406025852
120	NC_018611	A	6	6	45517	45522	100 %	0 %	0 %	0 %	406025853
121	NC_018611	A	6	6	45888	45893	100 %	0 %	0 %	0 %	406025853
122	NC_018611	T	6	6	47696	47701	0 %	100 %	0 %	0 %	406025855
123	NC_018611	T	7	7	48569	48575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018611	A	6	6	48902	48907	100 %	0 %	0 %	0 %	406025856
125	NC_018611	T	6	6	49373	49378	0 %	100 %	0 %	0 %	406025856
126	NC_018611	A	6	6	49649	49654	100 %	0 %	0 %	0 %	406025856
127	NC_018611	A	6	6	51061	51066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018611	T	6	6	51830	51835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018611	T	6	6	54921	54926	0 %	100 %	0 %	0 %	406025863
130	NC_018611	T	6	6	54942	54947	0 %	100 %	0 %	0 %	406025863
131	NC_018611	A	6	6	55088	55093	100 %	0 %	0 %	0 %	406025863
132	NC_018611	A	6	6	55273	55278	100 %	0 %	0 %	0 %	406025864
133	NC_018611	T	6	6	55795	55800	0 %	100 %	0 %	0 %	406025864
134	NC_018611	A	6	6	56037	56042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018611	A	7	7	56290	56296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.