MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018610	TAACAT	2	12	53810	53821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018610	ACAGCA	2	12	89302	89313	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018610	TAATCA	2	12	110190	110201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018610	AAAGAT	2	12	112030	112041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018610	GATTGA	2	12	164850	164861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018610	AATATT	2	12	181152	181163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018610	AATATC	2	12	192285	192296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018610	TTTTGA	2	12	223528	223539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018610	GTTTTT	2	12	250963	250974	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018610	TTGAAT	2	12	254761	254772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018610	ATTTCA	2	12	308729	308740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018610	AATTAT	2	12	329765	329776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018610	TCGAAC	2	12	336058	336069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018610	CGCTTC	2	12	345675	345686	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018610	TGACCC	2	12	360569	360580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018610	AACTTT	2	12	399764	399775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018610	GATTTT	2	12	405223	405234	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018610	CAATGT	2	12	419757	419768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018610	AGGGGC	2	12	448383	448394	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018610	AATGGG	2	12	467026	467037	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018610	CAATGC	2	12	478281	478292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018610	TATCAA	2	12	484484	484495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018610	TGACCC	2	12	515101	515112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018610	GTTAAA	2	12	516123	516134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018610	CTTTTT	2	12	517646	517657	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018610	GGGTGT	2	12	526733	526744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018610	ATTTTT	2	12	532357	532368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018610	AACCAA	2	12	610384	610395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018610	AAAAAG	2	12	616871	616882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018610	AAAATG	2	12	655718	655729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018610	TTAATT	2	12	670451	670462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018610	TCACCA	2	12	707450	707461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018610	AGAATC	2	12	725835	725846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018610	TGGTTT	2	12	732608	732619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018610	TGGAAG	2	12	737265	737276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018610	CAACAC	2	12	774281	774292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018610	ACAAAA	2	12	838289	838300	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018610	TGGTTT	2	12	854290	854301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018610	TGGAAG	2	12	858947	858958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018610	AAAAGA	2	12	860766	860777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018610	ATCTGA	2	12	871181	871192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018610	GGGGTC	2	12	874083	874094	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018610	GGGGTC	2	12	874228	874239	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018610	GGGAAT	2	12	875494	875505	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018610	TTTTAA	2	12	884319	884330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018610	CTTTTT	2	12	888000	888011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018610	TTGGGA	2	12	903044	903055	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018610	AAAAAG	2	12	909596	909607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018610	TTATTG	2	12	911769	911780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018610	TGGCAA	2	12	913216	913227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018610	TATTGA	2	12	947267	947278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018610	CAAAAA	2	12	948699	948710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018610	ACCGCT	2	12	1008300	1008311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018610	ATTAAA	2	12	1022501	1022512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018610	TTCATT	2	12	1067156	1067167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018610	AGTCAA	2	12	1068159	1068170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018610	AAAAGA	2	12	1112520	1112531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018610	TAAAGT	2	12	1172667	1172678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018610	ATTGTT	2	12	1283996	1284007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018610	TATACT	2	12	1334428	1334439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018610	TAAATA	2	12	1363759	1363770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018610	GGGTTT	3	18	1404124	1404141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018610	AAAAGA	2	12	1436543	1436554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018610	CAATTA	2	12	1437884	1437895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018610	AAATGT	2	12	1462757	1462768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018610	AAACCC	2	12	1533778	1533789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018610	AAACCC	2	12	1533901	1533912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018610	AAATAA	2	12	1569538	1569549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018610	TATATC	2	12	1572472	1572483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018610	CACTTC	2	12	1592717	1592728	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018610	AAACCA	2	12	1597156	1597167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018610	CACTTC	2	12	1673566	1673577	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018610	AAACCA	2	12	1678005	1678016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018610	AAATTT	2	12	1686273	1686284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018610	ATCATT	2	12	1707204	1707215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018610	TCTTTA	2	12	1758215	1758226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018610	AATATA	2	12	1787477	1787488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018610	ACGCAA	2	12	1826389	1826400	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018610	CTTTCA	2	12	1884148	1884159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018610	TTGTGA	2	12	1956132	1956143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018610	AAAGGA	2	12	1956228	1956239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018610	CTTTGT	2	12	1975187	1975198	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018610	AATTTA	2	12	1977949	1977960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018610	TTTGAT	2	12	1981506	1981517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018610	AAGTAA	2	12	1981543	1981554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018610	AATAGT	2	12	1985826	1985837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018610	GTCAAC	2	12	2114096	2114107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018610	CTAAAG	2	12	2159619	2159630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018610	ATTTTT	2	12	2207174	2207185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018610	ATATTG	2	12	2224616	2224627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018610	AATACG	2	12	2239224	2239235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018610	TTTTCA	2	12	2277587	2277598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018610	ATTCAA	2	12	2280262	2280273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018610	GTAACC	2	12	2292607	2292618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018610	CACTTC	2	12	2301695	2301706	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018610	AAACCA	2	12	2306134	2306145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018610	TTGGTT	2	12	2349652	2349663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018610	CTTGGG	2	12	2371483	2371494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018610	TTTAAA	2	12	2376106	2376117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018610	TGGGGC	2	12	2391615	2391626	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018610	ATTTTT	2	12	2396403	2396414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018610	TAATAT	2	12	2416226	2416237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018610	GGATTT	2	12	2421091	2421102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018610	AAAATG	2	12	2453846	2453857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018610	AAAAGT	2	12	2466342	2466353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018610	TCCCAC	2	12	2484032	2484043	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018610	TCATAT	2	12	2485666	2485677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.