MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 6009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	AAAT	2	8	184	191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018609	GGGC	2	8	925	932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018609	TGTT	2	8	1532	1539	0 %	75 %	25 %	0 %	407450787
4	NC_018609	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	407450787
5	NC_018609	ATTT	2	8	1837	1844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018609	TTTG	2	8	1896	1903	0 %	75 %	25 %	0 %	407450788
7	NC_018609	CATT	2	8	2917	2924	25 %	50 %	0 %	25 %	407450789
8	NC_018609	AATT	2	8	3319	3326	50 %	50 %	0 %	0 %	407450789
9	NC_018609	GTTT	2	8	3459	3466	0 %	75 %	25 %	0 %	407450789
10	NC_018609	TAAA	2	8	3510	3517	75 %	25 %	0 %	0 %	407450789
11	NC_018609	TTAG	2	8	3957	3964	25 %	50 %	25 %	0 %	407450789
12	NC_018609	GGCA	2	8	4691	4698	25 %	0 %	50 %	25 %	407450790
13	NC_018609	GTTA	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	407450791
14	NC_018609	TTCA	2	8	6321	6328	25 %	50 %	0 %	25 %	407450792
15	NC_018609	TTTC	2	8	6687	6694	0 %	75 %	0 %	25 %	407450793
16	NC_018609	TTTA	2	8	7241	7248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018609	ATTT	2	8	7426	7433	25 %	75 %	0 %	0 %	407450795
18	NC_018609	AGCA	2	8	7732	7739	50 %	0 %	25 %	25 %	407450795
19	NC_018609	TTAA	2	8	8378	8385	50 %	50 %	0 %	0 %	407450795
20	NC_018609	ATTA	2	8	8512	8519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018609	AACC	2	8	10257	10264	50 %	0 %	0 %	50 %	407450798
22	NC_018609	CAAA	2	8	10281	10288	75 %	0 %	0 %	25 %	407450798
23	NC_018609	AACC	2	8	10579	10586	50 %	0 %	0 %	50 %	407450798
24	NC_018609	TAAT	2	8	11006	11013	50 %	50 %	0 %	0 %	407450799
25	NC_018609	TTCC	2	8	11585	11592	0 %	50 %	0 %	50 %	407450799
26	NC_018609	TTAA	2	8	11671	11678	50 %	50 %	0 %	0 %	407450799
27	NC_018609	TGTT	2	8	11798	11805	0 %	75 %	25 %	0 %	407450799
28	NC_018609	GTTC	2	8	11812	11819	0 %	50 %	25 %	25 %	407450799
29	NC_018609	TTTG	2	8	12205	12212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018609	CTTT	2	8	13267	13274	0 %	75 %	0 %	25 %	407450802
31	NC_018609	TTTG	2	8	13314	13321	0 %	75 %	25 %	0 %	407450802
32	NC_018609	TTGA	2	8	13649	13656	25 %	50 %	25 %	0 %	407450802
33	NC_018609	ATTT	2	8	14078	14085	25 %	75 %	0 %	0 %	407450802
34	NC_018609	TGAA	2	8	14772	14779	50 %	25 %	25 %	0 %	407450803
35	NC_018609	TGTC	2	8	14988	14995	0 %	50 %	25 %	25 %	407450803
36	NC_018609	CAAT	2	8	15150	15157	50 %	25 %	0 %	25 %	407450803
37	NC_018609	AAGA	2	8	15369	15376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018609	AATA	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018609	TGTT	2	8	16404	16411	0 %	75 %	25 %	0 %	407450804
40	NC_018609	TTTC	2	8	16564	16571	0 %	75 %	0 %	25 %	407450804
41	NC_018609	CCTT	2	8	16628	16635	0 %	50 %	0 %	50 %	407450804
42	NC_018609	AAAT	2	8	16843	16850	75 %	25 %	0 %	0 %	407450804
43	NC_018609	TTAT	2	8	17718	17725	25 %	75 %	0 %	0 %	407450806
44	NC_018609	TTAA	2	8	17783	17790	50 %	50 %	0 %	0 %	407450807
45	NC_018609	CATT	2	8	17930	17937	25 %	50 %	0 %	25 %	407450807
46	NC_018609	AAAC	2	8	18621	18628	75 %	0 %	0 %	25 %	407450807
47	NC_018609	AGGG	2	8	19049	19056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018609	ATAA	2	8	19685	19692	75 %	25 %	0 %	0 %	407450808
49	NC_018609	CAAA	2	8	21330	21337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018609	TTTG	2	8	21632	21639	0 %	75 %	25 %	0 %	407450812
51	NC_018609	CAAT	2	8	21644	21651	50 %	25 %	0 %	25 %	407450812
52	NC_018609	AAAT	2	8	21677	21684	75 %	25 %	0 %	0 %	407450812
53	NC_018609	TCAT	2	8	22138	22145	25 %	50 %	0 %	25 %	407450812
54	NC_018609	CAAA	2	8	22305	22312	75 %	0 %	0 %	25 %	407450813
55	NC_018609	CGGG	2	8	22760	22767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018609	CTTG	2	8	23062	23069	0 %	50 %	25 %	25 %	407450814
57	NC_018609	AATA	2	8	23101	23108	75 %	25 %	0 %	0 %	407450814
58	NC_018609	CAGC	2	8	23324	23331	25 %	0 %	25 %	50 %	407450814
59	NC_018609	TTTC	2	8	23437	23444	0 %	75 %	0 %	25 %	407450814
60	NC_018609	TTTG	2	8	23849	23856	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018609	CATC	2	8	24055	24062	25 %	25 %	0 %	50 %	407450815
62	NC_018609	AGTC	2	8	24956	24963	25 %	25 %	25 %	25 %	407450815
63	NC_018609	TTTG	2	8	25015	25022	0 %	75 %	25 %	0 %	407450815
64	NC_018609	AACC	2	8	25341	25348	50 %	0 %	0 %	50 %	407450816
65	NC_018609	GTTT	2	8	27029	27036	0 %	75 %	25 %	0 %	407450817
66	NC_018609	TTTG	2	8	27067	27074	0 %	75 %	25 %	0 %	407450817
67	NC_018609	GCAG	2	8	27192	27199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018609	CTAC	2	8	27217	27224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018609	CGTT	2	8	27449	27456	0 %	50 %	25 %	25 %	407450818
70	NC_018609	GGCA	2	8	27551	27558	25 %	0 %	50 %	25 %	407450818
71	NC_018609	AGGT	2	8	27916	27923	25 %	25 %	50 %	0 %	407450818
72	NC_018609	ATTT	2	8	28025	28032	25 %	75 %	0 %	0 %	407450818
73	NC_018609	CTGT	2	8	28034	28041	0 %	50 %	25 %	25 %	407450818
74	NC_018609	TGTT	2	8	28594	28601	0 %	75 %	25 %	0 %	407450819
75	NC_018609	TTCT	2	8	28951	28958	0 %	75 %	0 %	25 %	407450819
76	NC_018609	TTTG	2	8	29293	29300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018609	TTTG	2	8	29438	29445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018609	CATC	2	8	29644	29651	25 %	25 %	0 %	50 %	407450820
79	NC_018609	AGTC	2	8	30545	30552	25 %	25 %	25 %	25 %	407450820
80	NC_018609	TTTG	2	8	30604	30611	0 %	75 %	25 %	0 %	407450820
81	NC_018609	TGAA	2	8	31178	31185	50 %	25 %	25 %	0 %	407450821
82	NC_018609	ATTT	2	8	31547	31554	25 %	75 %	0 %	0 %	407450821
83	NC_018609	GTTT	2	8	31736	31743	0 %	75 %	25 %	0 %	407450821
84	NC_018609	ATAA	2	8	31845	31852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018609	TTAT	2	8	31855	31862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018609	AATG	2	8	32023	32030	50 %	25 %	25 %	0 %	407450822
87	NC_018609	TTTA	2	8	33383	33390	25 %	75 %	0 %	0 %	407450822
88	NC_018609	TAAT	2	8	33570	33577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018609	TTTA	2	8	33608	33615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018609	AATC	2	8	33779	33786	50 %	25 %	0 %	25 %	407450823
91	NC_018609	GAAA	2	8	33954	33961	75 %	0 %	25 %	0 %	407450823
92	NC_018609	TTAT	2	8	34457	34464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018609	AATC	2	8	34465	34472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018609	AAAT	2	8	34541	34548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018609	TAAC	2	8	36022	36029	50 %	25 %	0 %	25 %	407450824
96	NC_018609	TTAA	2	8	36234	36241	50 %	50 %	0 %	0 %	407450824
97	NC_018609	GGTT	2	8	36771	36778	0 %	50 %	50 %	0 %	407450824
98	NC_018609	TTCT	2	8	37155	37162	0 %	75 %	0 %	25 %	407450825
99	NC_018609	CTTT	2	8	38034	38041	0 %	75 %	0 %	25 %	407450825
100	NC_018609	AAAC	2	8	38389	38396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018609	AGAA	2	8	39633	39640	75 %	0 %	25 %	0 %	407450826
102	NC_018609	AAAG	2	8	39642	39649	75 %	0 %	25 %	0 %	407450826
103	NC_018609	ATAG	2	8	40225	40232	50 %	25 %	25 %	0 %	407450827
104	NC_018609	CATC	2	8	40284	40291	25 %	25 %	0 %	50 %	407450827
105	NC_018609	AGGT	2	8	40322	40329	25 %	25 %	50 %	0 %	407450827
106	NC_018609	TTCT	2	8	40498	40505	0 %	75 %	0 %	25 %	407450827
107	NC_018609	ATAA	2	8	40677	40684	75 %	25 %	0 %	0 %	407450827
108	NC_018609	TAGG	2	8	40897	40904	25 %	25 %	50 %	0 %	407450827
109	NC_018609	GGAA	2	8	41128	41135	50 %	0 %	50 %	0 %	407450827
110	NC_018609	AAAT	2	8	41179	41186	75 %	25 %	0 %	0 %	407450827
111	NC_018609	ACCA	2	8	41411	41418	50 %	0 %	0 %	50 %	407450827
112	NC_018609	CTTA	2	8	41527	41534	25 %	50 %	0 %	25 %	407450827
113	NC_018609	TAGT	2	8	41765	41772	25 %	50 %	25 %	0 %	407450827
114	NC_018609	AACG	2	8	42497	42504	50 %	0 %	25 %	25 %	407450827
115	NC_018609	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	407450828
116	NC_018609	TAAA	2	8	42882	42889	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
117	NC_018609	TAGC	2	8	42941	42948	25 %	25 %	25 %	25 %	407450828
118	NC_018609	TAAA	2	8	43101	43108	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
119	NC_018609	TAAA	2	8	43359	43366	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
120	NC_018609	TTCA	2	8	43797	43804	25 %	50 %	0 %	25 %	407450828
121	NC_018609	TAAT	2	8	44120	44127	50 %	50 %	0 %	0 %	407450829
122	NC_018609	CTTT	2	8	44566	44573	0 %	75 %	0 %	25 %	407450829
123	NC_018609	TTCT	2	8	44597	44604	0 %	75 %	0 %	25 %	407450829
124	NC_018609	TTGA	2	8	44993	45000	25 %	50 %	25 %	0 %	407450829
125	NC_018609	AAAC	2	8	45396	45403	75 %	0 %	0 %	25 %	407450830
126	NC_018609	AAAG	2	8	45460	45467	75 %	0 %	25 %	0 %	407450830
127	NC_018609	TAAA	2	8	45500	45507	75 %	25 %	0 %	0 %	407450830
128	NC_018609	CCAA	2	8	45617	45624	50 %	0 %	0 %	50 %	407450830
129	NC_018609	CAAG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	407450830
130	NC_018609	ATAA	2	8	46177	46184	75 %	25 %	0 %	0 %	407450830
131	NC_018609	CAAA	2	8	46256	46263	75 %	0 %	0 %	25 %	407450830
132	NC_018609	TTGT	2	8	46525	46532	0 %	75 %	25 %	0 %	407450830
133	NC_018609	ATCT	2	8	46593	46600	25 %	50 %	0 %	25 %	407450831
134	NC_018609	GATA	2	8	47449	47456	50 %	25 %	25 %	0 %	407450831
135	NC_018609	TTTG	2	8	47865	47872	0 %	75 %	25 %	0 %	407450831
136	NC_018609	TTGT	2	8	47975	47982	0 %	75 %	25 %	0 %	407450831
137	NC_018609	GATA	2	8	48477	48484	50 %	25 %	25 %	0 %	407450832
138	NC_018609	TTTC	2	8	48909	48916	0 %	75 %	0 %	25 %	407450832
139	NC_018609	TTTA	2	8	49013	49020	25 %	75 %	0 %	0 %	407450832
140	NC_018609	AATA	2	8	49337	49344	75 %	25 %	0 %	0 %	407450833
141	NC_018609	ATAG	2	8	49916	49923	50 %	25 %	25 %	0 %	407450833
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