MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 30625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018609	TGG	2	6	270	275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018609	GAA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018609	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018609	CTC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018609	AGT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018609	CGG	2	6	751	756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018609	CGA	2	6	835	840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018609	GCC	2	6	859	864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018609	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450787
11	NC_018609	AAG	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450787
12	NC_018609	ATT	2	6	1391	1396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450787
13	NC_018609	ATT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450787
14	NC_018609	ACT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450787
15	NC_018609	TAA	2	6	1650	1655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450787
16	NC_018609	ATA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450788
17	NC_018609	CTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450788
18	NC_018609	TAT	2	6	2000	2005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450788
19	NC_018609	TCA	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450788
20	NC_018609	GTT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
21	NC_018609	CAA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450788
22	NC_018609	CAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450788
23	NC_018609	TTC	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450788
24	NC_018609	TGT	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
25	NC_018609	TTG	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450788
26	NC_018609	CTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450788
27	NC_018609	TAT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
28	NC_018609	ATT	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
29	NC_018609	TAT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
30	NC_018609	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
31	NC_018609	AAC	3	9	3224	3232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450789
32	NC_018609	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
33	NC_018609	CTT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
34	NC_018609	AGT	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450789
35	NC_018609	TCT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
36	NC_018609	GTT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450789
37	NC_018609	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450789
38	NC_018609	ATT	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
39	NC_018609	TCA	3	9	3648	3656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450789
40	NC_018609	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
41	NC_018609	TTA	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450789
42	NC_018609	AGT	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450789
43	NC_018609	TCT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450789
44	NC_018609	AGA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450789
45	NC_018609	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450789
46	NC_018609	TAA	2	6	4052	4057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450789
47	NC_018609	GTG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450790
48	NC_018609	GTC	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450790
49	NC_018609	TTA	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450790
50	NC_018609	TGT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450790
51	NC_018609	TTG	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450790
52	NC_018609	TAA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450790
53	NC_018609	GTT	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450791
54	NC_018609	ACA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450791
55	NC_018609	ATG	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450791
56	NC_018609	TGA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450791
57	NC_018609	TGC	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450791
58	NC_018609	AAC	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450791
59	NC_018609	TTA	2	6	5404	5409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018609	TGC	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450792
61	NC_018609	ATG	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450792
62	NC_018609	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450792
63	NC_018609	ATT	2	6	5798	5803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450792
64	NC_018609	CAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450792
65	NC_018609	TAT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450792
66	NC_018609	TAA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
67	NC_018609	TCA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450792
68	NC_018609	AAT	2	6	6033	6038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
69	NC_018609	CTT	2	6	6175	6180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450792
70	NC_018609	AAT	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450792
71	NC_018609	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018609	TTG	2	6	6491	6496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018609	AGT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018609	TTC	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450793
75	NC_018609	TTC	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450793
76	NC_018609	TTA	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450793
77	NC_018609	TTG	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450793
78	NC_018609	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
79	NC_018609	ATT	2	6	6969	6974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
80	NC_018609	ATA	2	6	7002	7007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450794
81	NC_018609	AAC	2	6	7060	7065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450794
82	NC_018609	ATT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450794
83	NC_018609	GTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450795
84	NC_018609	CAA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
85	NC_018609	TAT	2	6	7488	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450795
86	NC_018609	GCT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450795
87	NC_018609	GCA	2	6	7583	7588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
88	NC_018609	TTC	2	6	7632	7637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
89	NC_018609	CAA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
90	NC_018609	GCA	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
91	NC_018609	CAG	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450795
92	NC_018609	CTA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
93	NC_018609	CAA	2	6	7929	7934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450795
94	NC_018609	CAT	3	9	8049	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
95	NC_018609	TTC	2	6	8136	8141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
96	NC_018609	TCA	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450795
97	NC_018609	TTG	2	6	8221	8226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450795
98	NC_018609	TTC	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
99	NC_018609	CTT	2	6	8298	8303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
100	NC_018609	CTT	2	6	8463	8468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450795
101	NC_018609	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018609	TTC	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018609	GTC	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018609	TTA	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018609	GTG	2	6	9140	9145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018609	ACT	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018609	TTC	2	6	9299	9304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450797
108	NC_018609	AAT	2	6	9312	9317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450797
109	NC_018609	TCG	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450797
110	NC_018609	TTC	3	9	9422	9430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450797
111	NC_018609	AAT	2	6	9679	9684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450797
112	NC_018609	TGG	3	9	9758	9766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450797
113	NC_018609	AGG	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450797
114	NC_018609	GAA	2	6	10093	10098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450797
115	NC_018609	TCA	2	6	10113	10118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450797
116	NC_018609	TCT	2	6	10161	10166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
117	NC_018609	CTT	2	6	10231	10236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
118	NC_018609	TAA	2	6	10374	10379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
119	NC_018609	TAT	2	6	10474	10479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450798
120	NC_018609	TGT	2	6	10723	10728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450798
121	NC_018609	TTC	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
122	NC_018609	CTT	2	6	10822	10827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450798
123	NC_018609	AAT	2	6	10849	10854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
124	NC_018609	AAT	2	6	10918	10923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450798
125	NC_018609	TTC	2	6	10983	10988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
126	NC_018609	GTT	2	6	10989	10994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450799
127	NC_018609	CTT	3	9	11056	11064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
128	NC_018609	TTG	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450799
129	NC_018609	TGG	2	6	11277	11282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450799
130	NC_018609	GGC	2	6	11502	11507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407450799
131	NC_018609	TTC	2	6	11520	11525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
132	NC_018609	GTA	2	6	11556	11561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450799
133	NC_018609	TCT	2	6	11570	11575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450799
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264	NC_018609	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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