MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 3891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	AG	3	6	119	124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018609	AT	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018609	AT	3	6	2224	2229	50 %	50 %	0 %	0 %	407450788
4	NC_018609	AT	3	6	5579	5584	50 %	50 %	0 %	0 %	407450792
5	NC_018609	AT	3	6	5837	5842	50 %	50 %	0 %	0 %	407450792
6	NC_018609	AT	3	6	6037	6042	50 %	50 %	0 %	0 %	407450792
7	NC_018609	TA	3	6	8215	8220	50 %	50 %	0 %	0 %	407450795
8	NC_018609	AT	3	6	10662	10667	50 %	50 %	0 %	0 %	407450798
9	NC_018609	AT	3	6	11159	11164	50 %	50 %	0 %	0 %	407450799
10	NC_018609	CA	3	6	11339	11344	50 %	0 %	0 %	50 %	407450799
11	NC_018609	AT	3	6	11773	11778	50 %	50 %	0 %	0 %	407450799
12	NC_018609	AT	3	6	12236	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	407450800
13	NC_018609	AT	3	6	12285	12290	50 %	50 %	0 %	0 %	407450800
14	NC_018609	TA	3	6	13722	13727	50 %	50 %	0 %	0 %	407450802
15	NC_018609	AT	4	8	14055	14062	50 %	50 %	0 %	0 %	407450802
16	NC_018609	TC	4	8	14113	14120	0 %	50 %	0 %	50 %	407450802
17	NC_018609	AG	3	6	14289	14294	50 %	0 %	50 %	0 %	407450802
18	NC_018609	AT	3	6	14888	14893	50 %	50 %	0 %	0 %	407450803
19	NC_018609	TC	3	6	15090	15095	0 %	50 %	0 %	50 %	407450803
20	NC_018609	TA	3	6	17406	17411	50 %	50 %	0 %	0 %	407450805
21	NC_018609	TA	3	6	17428	17433	50 %	50 %	0 %	0 %	407450805
22	NC_018609	GT	3	6	17998	18003	0 %	50 %	50 %	0 %	407450807
23	NC_018609	AT	3	6	21736	21741	50 %	50 %	0 %	0 %	407450812
24	NC_018609	GA	3	6	23491	23496	50 %	0 %	50 %	0 %	407450814
25	NC_018609	AT	3	6	25906	25911	50 %	50 %	0 %	0 %	407450816
26	NC_018609	TA	3	6	26459	26464	50 %	50 %	0 %	0 %	407450817
27	NC_018609	TC	3	6	28769	28774	0 %	50 %	0 %	50 %	407450819
28	NC_018609	TC	4	8	30492	30499	0 %	50 %	0 %	50 %	407450820
29	NC_018609	TA	3	6	30945	30950	50 %	50 %	0 %	0 %	407450821
30	NC_018609	CT	3	6	31037	31042	0 %	50 %	0 %	50 %	407450821
31	NC_018609	AT	3	6	31917	31922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018609	AT	3	6	32425	32430	50 %	50 %	0 %	0 %	407450822
33	NC_018609	CT	3	6	32917	32922	0 %	50 %	0 %	50 %	407450822
34	NC_018609	TC	3	6	33227	33232	0 %	50 %	0 %	50 %	407450822
35	NC_018609	AT	3	6	33269	33274	50 %	50 %	0 %	0 %	407450822
36	NC_018609	TA	3	6	33431	33436	50 %	50 %	0 %	0 %	407450822
37	NC_018609	CT	3	6	33692	33697	0 %	50 %	0 %	50 %	407450823
38	NC_018609	GA	3	6	34625	34630	50 %	0 %	50 %	0 %	407450824
39	NC_018609	AG	3	6	34711	34716	50 %	0 %	50 %	0 %	407450824
40	NC_018609	TC	3	6	35539	35544	0 %	50 %	0 %	50 %	407450824
41	NC_018609	AG	3	6	35914	35919	50 %	0 %	50 %	0 %	407450824
42	NC_018609	AT	3	6	36398	36403	50 %	50 %	0 %	0 %	407450824
43	NC_018609	AC	3	6	36710	36715	50 %	0 %	0 %	50 %	407450824
44	NC_018609	CT	3	6	38260	38265	0 %	50 %	0 %	50 %	407450825
45	NC_018609	AT	3	6	38325	38330	50 %	50 %	0 %	0 %	407450825
46	NC_018609	AC	3	6	39128	39133	50 %	0 %	0 %	50 %	407450826
47	NC_018609	TA	3	6	40038	40043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018609	AT	3	6	40164	40169	50 %	50 %	0 %	0 %	407450827
49	NC_018609	TA	3	6	41206	41211	50 %	50 %	0 %	0 %	407450827
50	NC_018609	TA	4	8	42097	42104	50 %	50 %	0 %	0 %	407450827
51	NC_018609	GA	3	6	42315	42320	50 %	0 %	50 %	0 %	407450827
52	NC_018609	AT	3	6	44126	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	407450829
53	NC_018609	TC	3	6	44249	44254	0 %	50 %	0 %	50 %	407450829
54	NC_018609	CA	3	6	45794	45799	50 %	0 %	0 %	50 %	407450830
55	NC_018609	TA	3	6	46214	46219	50 %	50 %	0 %	0 %	407450830
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60	NC_018609	AT	3	6	48462	48467	50 %	50 %	0 %	0 %	407450832
61	NC_018609	AG	3	6	49100	49105	50 %	0 %	50 %	0 %	407450832
62	NC_018609	TC	3	6	49147	49152	0 %	50 %	0 %	50 %	407450832
63	NC_018609	TC	3	6	49360	49365	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
64	NC_018609	TC	3	6	49368	49373	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
65	NC_018609	AG	3	6	50855	50860	50 %	0 %	50 %	0 %	407450833
66	NC_018609	TC	3	6	50965	50970	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
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68	NC_018609	TC	3	6	51345	51350	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
69	NC_018609	TC	3	6	51889	51894	0 %	50 %	0 %	50 %	407450833
70	NC_018609	TA	3	6	52803	52808	50 %	50 %	0 %	0 %	407450834
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72	NC_018609	TA	3	6	53603	53608	50 %	50 %	0 %	0 %	407450834
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80	NC_018609	TA	4	8	58819	58826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018609	AC	3	6	58837	58842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018609	TA	3	6	61272	61277	50 %	50 %	0 %	0 %	407450841
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98	NC_018609	AT	3	6	70149	70154	50 %	50 %	0 %	0 %	407450850
99	NC_018609	AT	3	6	70355	70360	50 %	50 %	0 %	0 %	407450850
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102	NC_018609	TG	4	8	72085	72092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_018609	CT	4	8	72861	72868	0 %	50 %	0 %	50 %	407450852
106	NC_018609	CT	3	6	73261	73266	0 %	50 %	0 %	50 %	407450852
107	NC_018609	AT	3	6	73922	73927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018609	TA	3	6	74205	74210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018609	AT	3	6	74531	74536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018609	AT	3	6	74774	74779	50 %	50 %	0 %	0 %	407450853
111	NC_018609	TA	3	6	74824	74829	50 %	50 %	0 %	0 %	407450853
112	NC_018609	TA	4	8	75581	75588	50 %	50 %	0 %	0 %	407450854
113	NC_018609	TA	3	6	75928	75933	50 %	50 %	0 %	0 %	407450854
114	NC_018609	CA	3	6	76151	76156	50 %	0 %	0 %	50 %	407450854
115	NC_018609	TA	3	6	76393	76398	50 %	50 %	0 %	0 %	407450854
116	NC_018609	TA	3	6	76502	76507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018609	AT	3	6	76634	76639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018609	TA	3	6	77482	77487	50 %	50 %	0 %	0 %	407450855
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123	NC_018609	TG	3	6	80590	80595	0 %	50 %	50 %	0 %	407450857
124	NC_018609	TA	3	6	81499	81504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018609	AT	3	6	82734	82739	50 %	50 %	0 %	0 %	407450860
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