MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus 08BA02176 chromosome

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018608	ATAAAT	2	12	3293	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018608	TTTAAA	2	12	3470	3481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018608	TAAATC	2	12	17165	17176	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018608	ATTATG	2	12	22188	22199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018608	AAAAAT	2	12	39808	39819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018608	ATGATT	2	12	71331	71342	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018608	TAATTC	2	12	78139	78150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018608	AACAAA	2	12	90772	90783	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018608	AATATA	2	12	96740	96751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018608	GTTTTT	2	12	143885	143896	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018608	TTTATA	2	12	192074	192085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018608	ATTAAT	2	12	192097	192108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018608	TTATAT	2	12	192371	192382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018608	ATATGA	2	12	239679	239690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018608	AGTGGA	2	12	255229	255240	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018608	ATTTTT	2	12	259119	259130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018608	ATATAG	2	12	276818	276829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018608	ATAATT	2	12	283086	283097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018608	AACGAT	2	12	293295	293306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018608	ATCATT	2	12	294177	294188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018608	TAACTT	2	12	301673	301684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018608	TTAGAA	2	12	325273	325284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018608	ATGATA	2	12	344206	344217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018608	TAAAAA	2	12	348056	348067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018608	TTTATA	2	12	350343	350354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018608	GTAAGT	2	12	390837	390848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018608	AAGGTA	2	12	393539	393550	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018608	TAATAT	2	12	414171	414182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018608	AATTTG	2	12	442307	442318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018608	TAAAGA	2	12	444287	444298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018608	TGTATA	2	12	493721	493732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018608	TTTTTA	2	12	505150	505161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018608	AAAATG	2	12	510584	510595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018608	ATAGTC	2	12	516157	516168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018608	ACGTTG	2	12	530921	530932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018608	AAAATA	2	12	531647	531658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018608	TTATAA	2	12	551419	551430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018608	AAATTT	2	12	558178	558189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018608	TTATAA	2	12	616546	616557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018608	GTTATA	2	12	617217	617228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018608	CTTAAA	2	12	625649	625660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018608	ACATGT	2	12	635621	635632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018608	TAAAAT	2	12	684091	684102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018608	TCCCAC	2	12	694244	694255	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018608	TTTTAA	2	12	694997	695008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018608	CATCAA	2	12	721949	721960	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018608	TAATTT	2	12	726189	726200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018608	TGAATA	2	12	742666	742677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018608	AGGCAT	2	12	754140	754151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018608	TTAAAA	2	12	768928	768939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018608	TAGTTA	2	12	773349	773360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018608	TTTTTA	2	12	791640	791651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018608	TGAAAA	2	12	799880	799891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018608	TATGTT	2	12	816406	816417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018608	TTGTGG	2	12	886982	886993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018608	TAAAAA	2	12	889318	889329	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018608	TATCAA	2	12	895839	895850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018608	TTTTGA	2	12	899526	899537	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018608	GTTGGG	2	12	914021	914032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018608	AAATTA	2	12	916043	916054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018608	TAAAAT	2	12	932591	932602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018608	TTTAAT	2	12	1021863	1021874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018608	ATGGCA	2	12	1045229	1045240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018608	AACGGA	2	12	1053784	1053795	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018608	AATAAA	2	12	1061813	1061824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018608	CATTTA	2	12	1081935	1081946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018608	ATCATA	2	12	1083831	1083842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018608	TCAAAA	2	12	1090136	1090147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018608	ATTGCA	2	12	1091219	1091230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018608	TTTTCT	2	12	1103948	1103959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018608	CTTAGG	2	12	1145444	1145455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018608	ATTTTT	2	12	1163878	1163889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018608	ATAATT	2	12	1164675	1164686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018608	TCATTA	2	12	1169819	1169830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018608	ATATTT	2	12	1185222	1185233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018608	ACACTT	2	12	1185482	1185493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018608	AAATAT	2	12	1187515	1187526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018608	TTCGAT	2	12	1192289	1192300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018608	ATTTAT	2	12	1196357	1196368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018608	ATTATA	2	12	1200283	1200294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018608	AAATTT	2	12	1201092	1201103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018608	TCGTTT	2	12	1225383	1225394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018608	TTAATT	2	12	1236100	1236111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018608	AATTAA	2	12	1238836	1238847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018608	TGATTT	2	12	1243799	1243810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018608	AAAGAT	2	12	1282339	1282350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018608	GAAATT	2	12	1283113	1283124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018608	AATGAT	2	12	1295886	1295897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018608	TTTCAT	2	12	1326169	1326180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018608	TATATT	2	12	1330825	1330836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018608	ATGTAT	2	12	1357626	1357637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018608	AAAGAA	2	12	1357860	1357871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018608	ATAATT	2	12	1358593	1358604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018608	TTAAAG	2	12	1364337	1364348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018608	ATTAAA	2	12	1389259	1389270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018608	ATATAA	2	12	1397297	1397308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018608	GTTTTA	2	12	1427115	1427126	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018608	TATCTT	2	12	1466377	1466388	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018608	TTGATT	2	12	1466440	1466451	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018608	AATAAA	2	12	1476641	1476652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018608	TATTCT	2	12	1524133	1524144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018608	TACTTG	2	12	1534381	1534392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018608	TTAATC	2	12	1547860	1547871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018608	AATTGA	2	12	1548390	1548401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018608	ATAAAA	2	12	1596707	1596718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018608	ACAAGA	2	12	1602283	1602294	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018608	TAAAAA	2	12	1615185	1615196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018608	AATTTA	2	12	1632351	1632362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018608	AGCCAA	2	12	1660238	1660249	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018608	TTGACT	2	12	1660257	1660268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018608	TTTAAC	2	12	1665140	1665151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018608	TTATAA	2	12	1667681	1667692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018608	ACCTTT	2	12	1677638	1677649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018608	AGTTTT	2	12	1705990	1706001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018608	AATTAA	2	12	1707235	1707246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018608	TAAAAC	2	12	1710375	1710386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018608	TTAAAT	2	12	1717694	1717705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018608	AATTTA	2	12	1720184	1720195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018608	ATTTTC	2	12	1726219	1726230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018608	CATTAT	2	12	1779770	1779781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018608	TTTCAT	2	12	1784814	1784825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018608	TAATTA	2	12	1818418	1818429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018608	TAAAAA	2	12	1824535	1824546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018608	TCAAAA	2	12	1843802	1843813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018608	ATTATA	2	12	1894023	1894034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018608	TAAAAA	2	12	1909086	1909097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018608	GATAAA	2	12	1910991	1911002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018608	AAAATA	2	12	1911956	1911967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018608	TTCTAC	2	12	1922018	1922029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018608	TTTAAC	2	12	1939157	1939168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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132	NC_018608	TTTTAA	2	12	1973756	1973767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018608	TAATTT	2	12	1983685	1983696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018608	TTTTAA	2	12	2223598	2223609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.