MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus 08BA02176 chromosome

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018608	TGAAC	2	10	6976	6985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018608	GTAGG	2	10	14402	14411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018608	TTTTA	2	10	22212	22221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018608	TCGAT	2	10	23814	23823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018608	ATATT	2	10	24352	24361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018608	GTATA	2	10	34305	34314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018608	TAAAA	2	10	34363	34372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018608	ATGAG	2	10	39682	39691	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018608	TATAG	2	10	47833	47842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018608	GTCAA	2	10	55139	55148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018608	TTGAT	2	10	65312	65321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018608	TTGAT	2	10	65676	65685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018608	GACAT	2	10	69224	69233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018608	AAAAG	2	10	72639	72648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018608	AAAGT	2	10	74524	74533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018608	ATTTA	2	10	78299	78308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018608	TTTTA	2	10	79253	79262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018608	ATTCA	2	10	85208	85217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018608	CTAAT	2	10	86057	86066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018608	CAATT	2	10	87164	87173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018608	GTAAT	2	10	101159	101168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018608	TAAAA	2	10	105494	105503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018608	TCATT	2	10	123908	123917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018608	AAAGC	2	10	168986	168995	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018608	CGTTT	2	10	170205	170214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018608	TATCA	2	10	178780	178789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018608	TAGAG	2	10	192183	192192	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018608	CAACT	2	10	201047	201056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018608	GCTTT	2	10	205559	205568	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018608	TAACA	2	10	210632	210641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018608	AATAT	2	10	230026	230035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018608	TATTT	2	10	236016	236025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018608	AACAT	2	10	244236	244245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018608	GATAA	2	10	248173	248182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018608	ATAAC	2	10	252820	252829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018608	TGAAT	2	10	252931	252940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018608	ATTAA	2	10	253887	253896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018608	AAAGT	2	10	257632	257641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018608	TAAAA	2	10	259344	259353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018608	AAATT	2	10	260661	260670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018608	GAAAA	2	10	282957	282966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018608	ATAAA	2	10	283075	283084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018608	AAATT	2	10	293337	293346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018608	TCATA	2	10	294377	294386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018608	TGATG	2	10	307369	307378	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018608	ATTTA	2	10	308302	308311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018608	GATTT	2	10	325263	325272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018608	TAAAT	2	10	338759	338768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018608	ATTTT	2	10	344316	344325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018608	ATAGA	2	10	395985	395994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018608	TGACA	2	10	396177	396186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018608	GATAA	2	10	408479	408488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018608	TGAAA	2	10	419573	419582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018608	TTGAA	2	10	442659	442668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018608	AGAAT	2	10	442985	442994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018608	TAAAA	2	10	449050	449059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018608	TAAAT	2	10	451880	451889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018608	AAAAT	2	10	452516	452525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018608	ACAGT	2	10	454452	454461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018608	TAAAA	2	10	454949	454958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018608	GATTG	2	10	461591	461600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018608	ATATC	2	10	462450	462459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018608	CAATT	2	10	476678	476687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018608	CATAA	2	10	478437	478446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018608	AATCT	2	10	479815	479824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018608	ACAGA	2	10	486539	486548	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018608	AAATT	2	10	493708	493717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018608	CATAT	2	10	501707	501716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018608	TAAAG	2	10	502269	502278	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018608	CTCAC	2	10	504187	504196	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_018608	CAAAG	2	10	504212	504221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018608	CTTAA	2	10	521812	521821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018608	TGGTG	2	10	539633	539642	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018608	TGTGG	2	10	539655	539664	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018608	CAACT	2	10	540199	540208	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018608	GGTAA	2	10	540672	540681	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018608	TCGTG	2	10	541491	541500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018608	GATTG	2	10	543911	543920	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018608	GATTT	2	10	549191	549200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018608	ATATA	2	10	551609	551618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018608	CAAAG	2	10	558157	558166	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018608	TTGAT	2	10	561319	561328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018608	ATGAA	2	10	561390	561399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018608	AGACA	2	10	575278	575287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018608	AAGTA	2	10	577714	577723	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018608	GATAA	2	10	579877	579886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018608	GGTAA	2	10	585407	585416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018608	TCGTG	2	10	586221	586230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018608	GATTG	2	10	588527	588536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018608	GGTAA	2	10	590614	590623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018608	TCGTG	2	10	591433	591442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018608	ATATA	2	10	598382	598391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018608	AAAAT	2	10	603156	603165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018608	TTTAT	2	10	603265	603274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018608	TTATG	2	10	606271	606280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018608	ATTTA	2	10	606416	606425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018608	TGAAT	2	10	612690	612699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018608	GTATA	2	10	612747	612756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018608	TATAA	2	10	616464	616473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018608	TAAAG	2	10	636826	636835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018608	GAAGC	2	10	638181	638190	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018608	TAAAA	2	10	642878	642887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018608	ATATT	2	10	642960	642969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018608	AATTT	2	10	645749	645758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018608	AACCA	2	10	650203	650212	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018608	ATAAA	2	10	654100	654109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018608	TTATA	2	10	668480	668489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018608	AATCA	2	10	668937	668946	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018608	ATGAT	2	10	677928	677937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018608	TAATT	2	10	681415	681424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018608	TATTG	2	10	686376	686385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018608	AATGA	2	10	687285	687294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018608	TTTAA	2	10	689520	689529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018608	TAAAT	2	10	695594	695603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018608	AAATT	2	10	697598	697607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018608	TAAAA	2	10	704788	704797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018608	ATTAA	2	10	706976	706985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018608	TTATT	2	10	707025	707034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018608	CAATA	2	10	707091	707100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018608	TTAAT	2	10	709717	709726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018608	ATAAA	2	10	718689	718698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018608	TTTTA	2	10	720955	720964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018608	AAAGG	2	10	721276	721285	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018608	ATATA	2	10	724578	724587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018608	AAACT	2	10	728102	728111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018608	TTCAC	2	10	733315	733324	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018608	GGTTG	2	10	744298	744307	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018608	AAGTT	2	10	754349	754358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018608	AATTG	2	10	754381	754390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018608	ATTTA	2	10	756642	756651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018608	AAAGT	2	10	758889	758898	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018608	AATTT	2	10	761500	761509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018608	CATGA	2	10	763659	763668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018608	ATCAT	2	10	768408	768417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018608	AATTT	2	10	773286	773295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018608	AATTA	2	10	780090	780099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018608	ATTTA	2	10	784272	784281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018608	AAAGT	2	10	784365	784374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018608	TTTAA	2	10	786977	786986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018608	ATTTT	2	10	796764	796773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018608	TAAGT	2	10	799785	799794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018608	TAAAA	2	10	802601	802610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018608	AAAGT	2	10	805540	805549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018608	TAATA	2	10	819041	819050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018608	CATCC	2	10	821773	821782	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_018608	ATTAA	2	10	828195	828204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018608	ATATT	2	10	831003	831012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018608	CTTTA	2	10	832090	832099	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_018608	TGATA	2	10	859723	859732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_018608	AAATT	2	10	1357881	1357890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_018608	CTAAT	2	10	1359763	1359772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_018608	ATGTC	2	10	1363469	1363478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_018608	ATTAT	2	10	1368823	1368832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018608	CTATA	2	10	1373463	1373472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_018608	TTTTA	2	10	1386610	1386619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018608	TAAAA	2	10	1389909	1389918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_018608	CACGA	2	10	2218705	2218714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_018608	TTACT	2	10	2318247	2318256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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