MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli B2904 chromosome

Total Repeats: 5445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018607	TAA	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018607	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018607	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018607	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018607	TAA	3	9	267	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018607	TAA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018607	ATG	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018607	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018607	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018607	TTA	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018607	TAT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018607	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018607	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018607	GAT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018607	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018607	AAT	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018607	AAT	2	6	6420	6425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018607	TAA	2	6	6490	6495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018607	TGA	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018607	ATA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018607	ATT	2	6	8942	8947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018607	ATA	2	6	8979	8984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018607	ATT	2	6	10900	10905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018607	TAA	2	6	11013	11018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018607	ATA	2	6	11021	11026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018607	TGA	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018607	AGA	2	6	13348	13353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018607	TAT	2	6	13404	13409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018607	ATC	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018607	TAA	2	6	13556	13561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018607	TTC	2	6	13605	13610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018607	TAT	2	6	14332	14337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018607	TTA	2	6	14393	14398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018607	ATA	2	6	17726	17731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018607	TAT	2	6	19885	19890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018607	AAT	2	6	19918	19923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018607	TTC	2	6	19924	19929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018607	TTC	2	6	21438	21443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018607	CCA	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018607	TAG	2	6	22694	22699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018607	ATT	2	6	22710	22715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018607	ACC	2	6	22789	22794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018607	ATA	2	6	22805	22810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018607	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018607	TAA	2	6	22883	22888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018607	TTC	2	6	22897	22902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018607	CTT	2	6	22928	22933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018607	AAG	2	6	22970	22975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018607	AAT	2	6	24190	24195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018607	TAT	2	6	24774	24779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018607	AAT	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018607	ATT	2	6	25553	25558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018607	TTA	2	6	25579	25584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018607	ATT	2	6	25660	25665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018607	ATA	2	6	26404	26409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018607	TAT	2	6	26428	26433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018607	CTG	2	6	26483	26488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018607	ACA	2	6	26509	26514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018607	TAT	2	6	26942	26947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018607	TAA	3	9	26957	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018607	TAT	2	6	26980	26985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018607	ATA	2	6	27805	27810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018607	GTT	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018607	TAT	2	6	31156	31161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018607	TTG	2	6	31232	31237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018607	TAT	2	6	31284	31289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018607	ATA	2	6	31374	31379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018607	AAG	2	6	32048	32053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018607	TAT	2	6	34476	34481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018607	TTG	2	6	36574	36579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018607	TCT	2	6	36660	36665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018607	TAA	2	6	37001	37006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018607	TAA	2	6	37009	37014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018607	TAA	2	6	37076	37081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018607	TAT	2	6	37408	37413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018607	AGA	2	6	37419	37424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018607	AAT	2	6	37444	37449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018607	TTA	2	6	37488	37493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018607	ATA	2	6	37568	37573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018607	TAT	2	6	37591	37596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018607	ATA	2	6	37637	37642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018607	GAA	3	9	37678	37686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018607	ATA	2	6	38373	38378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018607	TAA	2	6	38421	38426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018607	ATT	2	6	38477	38482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018607	TTA	2	6	38523	38528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018607	TAT	2	6	38539	38544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018607	ATA	2	6	38580	38585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018607	ATT	2	6	38627	38632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018607	ATT	2	6	41450	41455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018607	AGA	2	6	41534	41539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018607	ATT	2	6	41562	41567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018607	TAA	2	6	41607	41612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018607	TAA	2	6	41620	41625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018607	ATA	2	6	41626	41631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018607	ATT	2	6	41633	41638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018607	ATT	2	6	41682	41687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018607	ATA	2	6	44865	44870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018607	CTC	2	6	46220	46225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018607	TAC	2	6	47587	47592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018607	TAA	2	6	47596	47601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018607	TAA	2	6	47619	47624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018607	TAA	2	6	47641	47646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018607	TTA	2	6	47727	47732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018607	ATT	2	6	47786	47791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018607	TTA	2	6	48882	48887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018607	AGA	2	6	48892	48897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018607	TCT	2	6	48920	48925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018607	ATT	2	6	48941	48946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018607	AAT	3	9	48962	48970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018607	TTA	2	6	48993	48998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018607	ATT	2	6	49002	49007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018607	ATT	2	6	49014	49019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018607	ATT	2	6	50340	50345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018607	GAA	2	6	50543	50548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018607	TAA	2	6	50697	50702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018607	TTA	2	6	51555	51560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018607	TTA	2	6	51597	51602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018607	TAT	2	6	53572	53577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018607	ATT	2	6	53612	53617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018607	AAT	2	6	53631	53636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018607	TAT	2	6	53665	53670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018607	AAT	2	6	53705	53710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018607	CTT	2	6	53735	53740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018607	AAG	2	6	53774	53779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018607	ATA	2	6	53807	53812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018607	TGA	2	6	53828	53833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018607	CTT	2	6	54008	54013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018607	AAG	2	6	54025	54030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018607	TAT	2	6	54290	54295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018607	AAT	2	6	54307	54312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018607	CTT	2	6	54337	54342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018607	AAG	2	6	54355	54360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018607	TAA	2	6	54413	54418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018607	ATT	2	6	54443	54448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018607	TAA	2	6	55316	55321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018607	TAA	2	6	55335	55340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018607	TAT	2	6	55896	55901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018607	GTT	2	6	55971	55976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018607	GCA	2	6	55986	55991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018607	CCA	2	6	56145	56150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018607	GCA	2	6	56248	56253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018607	TGC	2	6	56398	56403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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