MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	CTCAG	2	10	1746	1755	20 %	20 %	20 %	40 %	406025743
2	NC_018606	CAGGC	2	10	3086	3095	20 %	0 %	40 %	40 %	406025745
3	NC_018606	GATAT	2	10	3715	3724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018606	ACATA	2	10	9467	9476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018606	TTCCT	2	10	12046	12055	0 %	60 %	0 %	40 %	406025756
6	NC_018606	ATCTG	2	10	12070	12079	20 %	40 %	20 %	20 %	406025756
7	NC_018606	GATTT	2	10	13339	13348	20 %	60 %	20 %	0 %	406025757
8	NC_018606	CTTTT	2	10	13466	13475	0 %	80 %	0 %	20 %	406025757
9	NC_018606	GTTTG	2	10	13908	13917	0 %	60 %	40 %	0 %	406025758
10	NC_018606	TTTGT	2	10	15135	15144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018606	TTCAT	2	10	15943	15952	20 %	60 %	0 %	20 %	406025760
12	NC_018606	TATTG	2	10	16151	16160	20 %	60 %	20 %	0 %	406025761
13	NC_018606	AAGAT	2	10	16816	16825	60 %	20 %	20 %	0 %	406025761
14	NC_018606	TCTCT	2	10	17108	17117	0 %	60 %	0 %	40 %	406025762
15	NC_018606	AAACT	2	10	17435	17444	60 %	20 %	0 %	20 %	406025762
16	NC_018606	TAGGG	2	10	17622	17631	20 %	20 %	60 %	0 %	406025762
17	NC_018606	CTTTG	2	10	17636	17645	0 %	60 %	20 %	20 %	406025762
18	NC_018606	CAATG	2	10	19426	19435	40 %	20 %	20 %	20 %	406025763
19	NC_018606	ATTCC	2	10	20729	20738	20 %	40 %	0 %	40 %	406025765
20	NC_018606	TTAAT	2	10	21301	21310	40 %	60 %	0 %	0 %	406025765
21	NC_018606	TTACT	2	10	21379	21388	20 %	60 %	0 %	20 %	406025765
22	NC_018606	GTTTT	2	10	21914	21923	0 %	80 %	20 %	0 %	406025765
23	NC_018606	ATTCC	2	10	22358	22367	20 %	40 %	0 %	40 %	406025765
24	NC_018606	TGATT	2	10	23124	23133	20 %	60 %	20 %	0 %	406025766
25	NC_018606	TAGAA	2	10	24654	24663	60 %	20 %	20 %	0 %	406025767
26	NC_018606	TTTAT	2	10	24952	24961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018606	AAGAG	2	10	25374	25383	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018606	GTAGG	2	10	26188	26197	20 %	20 %	60 %	0 %	406025769
29	NC_018606	ACAAA	2	10	27132	27141	80 %	0 %	0 %	20 %	406025769
30	NC_018606	TTATT	2	10	27888	27897	20 %	80 %	0 %	0 %	406025772
31	NC_018606	ATTTT	2	10	28082	28091	20 %	80 %	0 %	0 %	406025772
32	NC_018606	GTATA	2	10	28122	28131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018606	AGAAA	2	10	30636	30645	80 %	0 %	20 %	0 %	406025774
34	NC_018606	ATTGA	2	10	32257	32266	40 %	40 %	20 %	0 %	406025776
35	NC_018606	GAAAA	2	10	35355	35364	80 %	0 %	20 %	0 %	406025779
36	NC_018606	TGTCT	2	10	38248	38257	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018606	TATAA	2	10	38919	38928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018606	TATAA	2	10	39977	39986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018606	TAGAA	2	10	40676	40685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018606	AAAAT	2	10	43511	43520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018606	TAGAT	2	10	46685	46694	40 %	40 %	20 %	0 %	406025793
42	NC_018606	AAAAT	2	10	47189	47198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018606	TAACT	2	10	47603	47612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018606	TATAT	2	10	47826	47835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018606	TATAA	2	10	47873	47882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018606	TACTA	2	10	48332	48341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018606	TTAAT	2	10	48378	48387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018606	TGATT	2	10	50292	50301	20 %	60 %	20 %	0 %	406025797
49	NC_018606	TATAA	2	10	50595	50604	60 %	40 %	0 %	0 %	406025798
50	NC_018606	AAAAT	2	10	51783	51792	80 %	20 %	0 %	0 %	406025800
51	NC_018606	AGTAA	2	10	52636	52645	60 %	20 %	20 %	0 %	406025801
52	NC_018606	AGAAA	2	10	52737	52746	80 %	0 %	20 %	0 %	406025801
53	NC_018606	TAGAT	2	10	53817	53826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018606	TGATT	2	10	55939	55948	20 %	60 %	20 %	0 %	406025805
55	NC_018606	TATAA	2	10	56240	56249	60 %	40 %	0 %	0 %	406025805

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.