MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	GATAT	2	10	3715	3724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018606	ACATA	2	10	9467	9476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018606	TTTGT	2	10	15135	15144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018606	TTTAT	2	10	24952	24961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018606	AAGAG	2	10	25374	25383	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018606	GTATA	2	10	28122	28131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018606	TGTCT	2	10	38248	38257	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018606	TATAA	2	10	38919	38928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018606	TATAA	2	10	39977	39986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018606	TAGAA	2	10	40676	40685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018606	AAAAT	2	10	43511	43520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018606	AAAAT	2	10	47189	47198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018606	TAACT	2	10	47603	47612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018606	TATAT	2	10	47826	47835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018606	TATAA	2	10	47873	47882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018606	TACTA	2	10	48332	48341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018606	TTAAT	2	10	48378	48387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018606	TAGAT	2	10	53817	53826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.