MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	CTCAG	2	10	1746	1755	20 %	20 %	20 %	40 %	406025743
2	NC_018606	CAGGC	2	10	3086	3095	20 %	0 %	40 %	40 %	406025745
3	NC_018606	TTCCT	2	10	12046	12055	0 %	60 %	0 %	40 %	406025756
4	NC_018606	ATCTG	2	10	12070	12079	20 %	40 %	20 %	20 %	406025756
5	NC_018606	GATTT	2	10	13339	13348	20 %	60 %	20 %	0 %	406025757
6	NC_018606	CTTTT	2	10	13466	13475	0 %	80 %	0 %	20 %	406025757
7	NC_018606	GTTTG	2	10	13908	13917	0 %	60 %	40 %	0 %	406025758
8	NC_018606	TTCAT	2	10	15943	15952	20 %	60 %	0 %	20 %	406025760
9	NC_018606	TATTG	2	10	16151	16160	20 %	60 %	20 %	0 %	406025761
10	NC_018606	AAGAT	2	10	16816	16825	60 %	20 %	20 %	0 %	406025761
11	NC_018606	TCTCT	2	10	17108	17117	0 %	60 %	0 %	40 %	406025762
12	NC_018606	AAACT	2	10	17435	17444	60 %	20 %	0 %	20 %	406025762
13	NC_018606	TAGGG	2	10	17622	17631	20 %	20 %	60 %	0 %	406025762
14	NC_018606	CTTTG	2	10	17636	17645	0 %	60 %	20 %	20 %	406025762
15	NC_018606	CAATG	2	10	19426	19435	40 %	20 %	20 %	20 %	406025763
16	NC_018606	ATTCC	2	10	20729	20738	20 %	40 %	0 %	40 %	406025765
17	NC_018606	TTAAT	2	10	21301	21310	40 %	60 %	0 %	0 %	406025765
18	NC_018606	TTACT	2	10	21379	21388	20 %	60 %	0 %	20 %	406025765
19	NC_018606	GTTTT	2	10	21914	21923	0 %	80 %	20 %	0 %	406025765
20	NC_018606	ATTCC	2	10	22358	22367	20 %	40 %	0 %	40 %	406025765
21	NC_018606	TGATT	2	10	23124	23133	20 %	60 %	20 %	0 %	406025766
22	NC_018606	TAGAA	2	10	24654	24663	60 %	20 %	20 %	0 %	406025767
23	NC_018606	GTAGG	2	10	26188	26197	20 %	20 %	60 %	0 %	406025769
24	NC_018606	ACAAA	2	10	27132	27141	80 %	0 %	0 %	20 %	406025769
25	NC_018606	TTATT	2	10	27888	27897	20 %	80 %	0 %	0 %	406025772
26	NC_018606	ATTTT	2	10	28082	28091	20 %	80 %	0 %	0 %	406025772
27	NC_018606	AGAAA	2	10	30636	30645	80 %	0 %	20 %	0 %	406025774
28	NC_018606	ATTGA	2	10	32257	32266	40 %	40 %	20 %	0 %	406025776
29	NC_018606	GAAAA	2	10	35355	35364	80 %	0 %	20 %	0 %	406025779
30	NC_018606	TAGAT	2	10	46685	46694	40 %	40 %	20 %	0 %	406025793
31	NC_018606	TGATT	2	10	50292	50301	20 %	60 %	20 %	0 %	406025797
32	NC_018606	TATAA	2	10	50595	50604	60 %	40 %	0 %	0 %	406025798
33	NC_018606	AAAAT	2	10	51783	51792	80 %	20 %	0 %	0 %	406025800
34	NC_018606	AGTAA	2	10	52636	52645	60 %	20 %	20 %	0 %	406025801
35	NC_018606	AGAAA	2	10	52737	52746	80 %	0 %	20 %	0 %	406025801
36	NC_018606	TGATT	2	10	55939	55948	20 %	60 %	20 %	0 %	406025805
37	NC_018606	TATAA	2	10	56240	56249	60 %	40 %	0 %	0 %	406025805

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.