MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TAA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018606	ATA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018606	TCG	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018606	TAA	2	6	1344	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018606	ACG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018606	TTA	2	6	1387	1392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018606	TGT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018606	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018606	TGA	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018606	TAA	2	6	5519	5524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018606	AAT	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018606	TAC	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018606	ACT	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018606	TAT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018606	GTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018606	ACT	2	6	7041	7046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018606	AAT	2	6	7135	7140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018606	TAA	2	6	7150	7155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018606	TCT	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018606	CGA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018606	TAT	2	6	8467	8472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018606	TTA	2	6	8549	8554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018606	ATT	2	6	8581	8586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018606	TTA	2	6	8625	8630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018606	AAT	2	6	9445	9450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018606	ATG	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018606	TAG	2	6	10632	10637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018606	ACT	2	6	10670	10675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018606	AAT	2	6	15067	15072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018606	TTA	2	6	22582	22587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018606	ATT	2	6	22603	22608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018606	TAT	2	6	22619	22624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018606	ATA	2	6	25192	25197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018606	ATT	2	6	25301	25306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018606	TAT	2	6	27816	27821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018606	TTA	2	6	28145	28150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018606	ATA	2	6	28154	28159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018606	ATT	2	6	28490	28495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018606	ATA	2	6	28496	28501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018606	TGG	2	6	28597	28602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018606	GCT	2	6	28668	28673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018606	GTT	2	6	30689	30694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018606	ATT	2	6	30722	30727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018606	AAC	2	6	30827	30832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018606	CAA	2	6	30858	30863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018606	GTA	2	6	31109	31114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018606	GTA	2	6	31117	31122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018606	TAC	2	6	31149	31154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018606	TAC	2	6	31162	31167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018606	GTA	2	6	31226	31231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018606	GTA	2	6	31234	31239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018606	ATA	2	6	31251	31256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018606	TAC	2	6	31328	31333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018606	TAC	2	6	31336	31341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018606	TAA	2	6	31345	31350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018606	ATT	3	9	31374	31382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018606	TAC	2	6	31391	31396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018606	TAC	2	6	31413	31418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018606	TAC	2	6	31421	31426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018606	GAA	2	6	31517	31522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018606	TCA	2	6	31575	31580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018606	TGT	2	6	31606	31611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018606	ATA	2	6	31655	31660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018606	AAT	2	6	31672	31677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018606	TAT	2	6	31682	31687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018606	GGA	2	6	31719	31724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018606	TAT	2	6	31884	31889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018606	ATA	2	6	31900	31905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018606	TAA	2	6	31998	32003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018606	TAG	2	6	32369	32374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018606	GAA	2	6	32399	32404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018606	ACA	2	6	32474	32479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018606	TAA	2	6	34794	34799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018606	TAT	2	6	35090	35095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018606	TTA	2	6	35103	35108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018606	TAT	2	6	35123	35128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018606	TAT	2	6	35790	35795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018606	TAA	2	6	35825	35830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018606	TAA	2	6	35847	35852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018606	TAA	2	6	35884	35889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018606	ATA	2	6	35942	35947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018606	ACA	2	6	36110	36115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018606	ATT	2	6	36136	36141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018606	TTA	2	6	37241	37246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018606	GTA	2	6	37272	37277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018606	CTA	2	6	38867	38872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018606	ATT	2	6	38874	38879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018606	TAG	2	6	38968	38973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018606	ATT	2	6	41673	41678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018606	CGT	2	6	41682	41687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018606	TTA	2	6	41712	41717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018606	CGA	2	6	41835	41840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018606	TAT	2	6	42908	42913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018606	TTA	2	6	42990	42995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018606	TAA	2	6	43033	43038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018606	ATT	2	6	47135	47140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018606	ATT	2	6	47656	47661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018606	ATC	2	6	47679	47684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018606	ATA	2	6	47771	47776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018606	ATA	2	6	47863	47868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018606	ATT	2	6	47914	47919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018606	TAT	2	6	48017	48022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018606	ATA	2	6	48062	48067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018606	ATA	4	12	48111	48122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018606	TAG	2	6	48139	48144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018606	TAA	2	6	48219	48224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018606	TAT	6	18	48239	48256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018606	ATA	2	6	48353	48358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018606	ATT	2	6	48445	48450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018606	TAT	2	6	48518	48523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018606	CAA	2	6	48568	48573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018606	AAG	2	6	48593	48598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018606	ATT	2	6	48880	48885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018606	ACT	2	6	49638	49643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018606	CTT	2	6	49654	49659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018606	ATA	2	6	49747	49752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018606	AAT	2	6	52451	52456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018606	TAC	2	6	53359	53364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018606	AGA	2	6	53691	53696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018606	TAC	2	6	53898	53903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018606	CCA	2	6	53922	53927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018606	ATT	2	6	53984	53989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018606	TAT	2	6	56731	56736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018606	ATC	2	6	56779	56784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018606	TTA	2	6	56801	56806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018606	GAT	2	6	56837	56842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018606	TAA	2	6	57780	57785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.