MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
2	NC_018606	TAA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
3	NC_018606	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
4	NC_018606	TTA	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
5	NC_018606	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025742
6	NC_018606	CCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025742
7	NC_018606	TTG	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025742
8	NC_018606	TTC	2	6	669	674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
9	NC_018606	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
10	NC_018606	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
11	NC_018606	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
12	NC_018606	GTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025742
13	NC_018606	AGC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025742
14	NC_018606	ACT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025742
15	NC_018606	ACG	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025743
16	NC_018606	ATG	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
17	NC_018606	GTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
18	NC_018606	ATA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
19	NC_018606	TAT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
20	NC_018606	AGG	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025743
21	NC_018606	CTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
22	NC_018606	GTG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025743
23	NC_018606	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
24	NC_018606	CAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
25	NC_018606	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
26	NC_018606	AGA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
27	NC_018606	AGA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
28	NC_018606	AGA	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
29	NC_018606	AGA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
30	NC_018606	GAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
31	NC_018606	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
32	NC_018606	ATA	2	6	2372	2377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
33	NC_018606	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
34	NC_018606	TAT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025744
35	NC_018606	ACC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025744
36	NC_018606	ATA	2	6	2861	2866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
37	NC_018606	TCC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025744
38	NC_018606	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
39	NC_018606	TAA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
40	NC_018606	AAT	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
41	NC_018606	TTG	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
42	NC_018606	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
43	NC_018606	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
44	NC_018606	CTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
45	NC_018606	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
46	NC_018606	CAG	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025746
47	NC_018606	GTA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
48	NC_018606	TTA	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
49	NC_018606	TAT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
50	NC_018606	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
51	NC_018606	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
52	NC_018606	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
53	NC_018606	AAG	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
54	NC_018606	GAA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
55	NC_018606	AGA	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
56	NC_018606	AGA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
57	NC_018606	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
58	NC_018606	AAG	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
59	NC_018606	AAG	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
60	NC_018606	GAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
61	NC_018606	TAA	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
62	NC_018606	ATT	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
63	NC_018606	TAC	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
64	NC_018606	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
65	NC_018606	CTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
66	NC_018606	CTT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
67	NC_018606	CAT	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
68	NC_018606	TTC	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
69	NC_018606	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025747
70	NC_018606	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025747
71	NC_018606	TCT	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025748
72	NC_018606	AGA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
73	NC_018606	AGC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
74	NC_018606	CTG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
75	NC_018606	TAT	2	6	6266	6271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
76	NC_018606	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
77	NC_018606	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025748
78	NC_018606	ATC	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
79	NC_018606	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
80	NC_018606	TTG	3	9	6611	6619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025748
81	NC_018606	GTC	2	6	6651	6656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
82	NC_018606	GAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
83	NC_018606	ATT	3	9	6709	6717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
84	NC_018606	GCA	3	9	6775	6783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
85	NC_018606	GTC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
86	NC_018606	CTA	2	6	6814	6819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025749
87	NC_018606	AAG	2	6	6920	6925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025749
88	NC_018606	CTA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025749
89	NC_018606	AGG	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025749
90	NC_018606	ATT	2	6	7229	7234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025750
91	NC_018606	CGT	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025750
92	NC_018606	TTA	2	6	7268	7273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025750
93	NC_018606	AGT	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025751
94	NC_018606	GCT	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025751
95	NC_018606	TAC	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025751
96	NC_018606	GTT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025751
97	NC_018606	TTA	2	6	7659	7664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025751
98	NC_018606	CAA	2	6	7811	7816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025751
99	NC_018606	GAA	2	6	7837	7842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025751
100	NC_018606	GAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025752
101	NC_018606	CAA	2	6	7969	7974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025752
102	NC_018606	TGG	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025752
103	NC_018606	CTT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025752
104	NC_018606	TAA	2	6	8247	8252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025752
105	NC_018606	TAA	2	6	8325	8330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025752
106	NC_018606	TTA	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025752
107	NC_018606	TAT	2	6	8352	8357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025752
108	NC_018606	ATT	2	6	8663	8668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025753
109	NC_018606	CTT	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025753
110	NC_018606	AAT	2	6	8903	8908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025753
111	NC_018606	ATT	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025753
112	NC_018606	GTT	3	9	8962	8970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025753
113	NC_018606	TGT	2	6	9024	9029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025753
114	NC_018606	TAA	2	6	9128	9133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025753
115	NC_018606	CAG	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025753
116	NC_018606	TTG	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025753
117	NC_018606	TAA	2	6	9655	9660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025754
118	NC_018606	GAG	2	6	9774	9779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025754
119	NC_018606	TTG	2	6	9902	9907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025754
120	NC_018606	ACA	2	6	9910	9915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025754
121	NC_018606	ATT	2	6	10003	10008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025754
122	NC_018606	AGA	2	6	10087	10092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
123	NC_018606	GAT	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025754
124	NC_018606	ACA	2	6	10348	10353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025754
125	NC_018606	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
126	NC_018606	AAG	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
127	NC_018606	AAG	2	6	10398	10403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
128	NC_018606	AAG	2	6	10410	10415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
129	NC_018606	AAG	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
130	NC_018606	AAG	2	6	10434	10439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
131	NC_018606	GAA	2	6	10454	10459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025754
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252	NC_018606	CTA	2	6	20608	20613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025765
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