MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TC	3	6	256	261	0 %	50 %	0 %	50 %	406025742
2	NC_018606	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	406025742
3	NC_018606	AC	3	6	731	736	50 %	0 %	0 %	50 %	406025742
4	NC_018606	CA	3	6	1227	1232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018606	TA	3	6	1845	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	406025743
6	NC_018606	TA	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018606	TC	3	6	3825	3830	0 %	50 %	0 %	50 %	406025746
8	NC_018606	TA	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	406025746
9	NC_018606	AG	3	6	4144	4149	50 %	0 %	50 %	0 %	406025746
10	NC_018606	TA	4	8	4717	4724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018606	TA	3	6	5201	5206	50 %	50 %	0 %	0 %	406025747
12	NC_018606	AT	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018606	AC	3	6	5666	5671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018606	AT	3	6	5812	5817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018606	AG	3	6	5926	5931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018606	TA	3	6	5968	5973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018606	AT	3	6	6628	6633	50 %	50 %	0 %	0 %	406025748
18	NC_018606	TA	3	6	7113	7118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018606	GT	3	6	7384	7389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018606	GT	3	6	7883	7888	0 %	50 %	50 %	0 %	406025752
21	NC_018606	TA	3	6	8218	8223	50 %	50 %	0 %	0 %	406025752
22	NC_018606	GA	3	6	8358	8363	50 %	0 %	50 %	0 %	406025752
23	NC_018606	TA	3	6	8766	8771	50 %	50 %	0 %	0 %	406025753
24	NC_018606	TC	3	6	8783	8788	0 %	50 %	0 %	50 %	406025753
25	NC_018606	AT	3	6	9609	9614	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
26	NC_018606	TA	3	6	10074	10079	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
27	NC_018606	TA	3	6	10245	10250	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
28	NC_018606	AT	3	6	11047	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	406025755
29	NC_018606	AT	3	6	11342	11347	50 %	50 %	0 %	0 %	406025755
30	NC_018606	AT	5	10	11708	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018606	TC	3	6	11748	11753	0 %	50 %	0 %	50 %	406025756
32	NC_018606	TA	3	6	11804	11809	50 %	50 %	0 %	0 %	406025756
33	NC_018606	TA	3	6	12258	12263	50 %	50 %	0 %	0 %	406025756
34	NC_018606	AG	3	6	13615	13620	50 %	0 %	50 %	0 %	406025758
35	NC_018606	TA	3	6	14131	14136	50 %	50 %	0 %	0 %	406025758
36	NC_018606	TA	3	6	14602	14607	50 %	50 %	0 %	0 %	406025759
37	NC_018606	AT	3	6	14995	15000	50 %	50 %	0 %	0 %	406025759
38	NC_018606	AT	4	8	15768	15775	50 %	50 %	0 %	0 %	406025760
39	NC_018606	TA	3	6	15888	15893	50 %	50 %	0 %	0 %	406025760
40	NC_018606	GT	4	8	16112	16119	0 %	50 %	50 %	0 %	406025761
41	NC_018606	TA	4	8	16163	16170	50 %	50 %	0 %	0 %	406025761
42	NC_018606	AT	3	6	16597	16602	50 %	50 %	0 %	0 %	406025761
43	NC_018606	AT	3	6	17567	17572	50 %	50 %	0 %	0 %	406025762
44	NC_018606	TC	3	6	18340	18345	0 %	50 %	0 %	50 %	406025762
45	NC_018606	TG	3	6	18978	18983	0 %	50 %	50 %	0 %	406025762
46	NC_018606	TA	3	6	19131	19136	50 %	50 %	0 %	0 %	406025762
47	NC_018606	TA	5	10	20245	20254	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
48	NC_018606	AT	3	6	20312	20317	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
49	NC_018606	TC	3	6	20334	20339	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
50	NC_018606	CT	3	6	20387	20392	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
51	NC_018606	AT	3	6	20632	20637	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
52	NC_018606	TC	3	6	21163	21168	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
53	NC_018606	AG	3	6	21173	21178	50 %	0 %	50 %	0 %	406025765
54	NC_018606	TA	3	6	21865	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
55	NC_018606	TA	4	8	22103	22110	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
56	NC_018606	TA	4	8	22924	22931	50 %	50 %	0 %	0 %	406025766
57	NC_018606	TA	3	6	23210	23215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018606	TA	3	6	24032	24037	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
59	NC_018606	AT	3	6	24077	24082	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
60	NC_018606	TA	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
61	NC_018606	TG	3	6	25125	25130	0 %	50 %	50 %	0 %	406025768
62	NC_018606	TA	4	8	25177	25184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018606	TA	4	8	25196	25203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018606	AT	3	6	25232	25237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018606	AT	3	6	25438	25443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018606	CT	3	6	25680	25685	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
67	NC_018606	TC	3	6	26326	26331	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
68	NC_018606	AT	3	6	26477	26482	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
69	NC_018606	TA	3	6	26699	26704	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
70	NC_018606	AT	5	10	26866	26875	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
71	NC_018606	CT	3	6	26878	26883	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
72	NC_018606	AT	3	6	27075	27080	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
73	NC_018606	TA	3	6	27768	27773	50 %	50 %	0 %	0 %	406025771
74	NC_018606	TA	3	6	27967	27972	50 %	50 %	0 %	0 %	406025772
75	NC_018606	AT	3	6	28040	28045	50 %	50 %	0 %	0 %	406025772
76	NC_018606	TA	3	6	28462	28467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018606	GA	3	6	29169	29174	50 %	0 %	50 %	0 %	406025774
78	NC_018606	AG	3	6	29558	29563	50 %	0 %	50 %	0 %	406025774
79	NC_018606	TA	3	6	29951	29956	50 %	50 %	0 %	0 %	406025774
80	NC_018606	AT	3	6	30243	30248	50 %	50 %	0 %	0 %	406025774
81	NC_018606	TA	5	10	31203	31212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018606	AT	4	8	31288	31295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018606	TA	5	10	31299	31308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018606	GT	3	6	31537	31542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018606	TA	3	6	31553	31558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018606	AT	3	6	31739	31744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018606	AT	4	8	31953	31960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018606	TA	3	6	32380	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018606	AT	3	6	32892	32897	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
90	NC_018606	AT	4	8	32927	32934	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
91	NC_018606	TA	3	6	33013	33018	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
92	NC_018606	TA	3	6	33104	33109	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
93	NC_018606	TA	3	6	33238	33243	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
94	NC_018606	AT	3	6	33479	33484	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
95	NC_018606	CT	3	6	34035	34040	0 %	50 %	0 %	50 %	406025777
96	NC_018606	AT	3	6	34239	34244	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
97	NC_018606	TA	3	6	34614	34619	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
98	NC_018606	AT	3	6	35773	35778	50 %	50 %	0 %	0 %	406025779
99	NC_018606	AT	3	6	35931	35936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018606	GA	3	6	36170	36175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018606	TA	3	6	36208	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018606	TC	3	6	36344	36349	0 %	50 %	0 %	50 %	406025780
103	NC_018606	TA	3	6	36533	36538	50 %	50 %	0 %	0 %	406025780
104	NC_018606	AG	3	6	36663	36668	50 %	0 %	50 %	0 %	406025780
105	NC_018606	CT	3	6	37502	37507	0 %	50 %	0 %	50 %	406025781
106	NC_018606	AC	3	6	38846	38851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018606	TA	3	6	38896	38901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018606	AT	3	6	39020	39025	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
109	NC_018606	TA	3	6	39399	39404	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
110	NC_018606	AT	4	8	39656	39663	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
111	NC_018606	TA	3	6	40150	40155	50 %	50 %	0 %	0 %	406025785
112	NC_018606	TA	3	6	40408	40413	50 %	50 %	0 %	0 %	406025785
113	NC_018606	AT	4	8	40662	40669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018606	AT	3	6	40737	40742	50 %	50 %	0 %	0 %	406025786
115	NC_018606	TA	3	6	41364	41369	50 %	50 %	0 %	0 %	406025787
116	NC_018606	GT	3	6	41828	41833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018606	GT	3	6	42325	42330	0 %	50 %	50 %	0 %	406025788
118	NC_018606	TA	3	6	42660	42665	50 %	50 %	0 %	0 %	406025788
119	NC_018606	GA	3	6	42800	42805	50 %	0 %	50 %	0 %	406025788
120	NC_018606	TA	4	8	43063	43070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018606	AT	3	6	43246	43251	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
122	NC_018606	AT	4	8	43269	43276	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
123	NC_018606	TA	3	6	43328	43333	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
124	NC_018606	AT	3	6	43388	43393	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
125	NC_018606	CT	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	406025790
126	NC_018606	AT	3	6	44333	44338	50 %	50 %	0 %	0 %	406025791
127	NC_018606	TA	3	6	44507	44512	50 %	50 %	0 %	0 %	406025791
128	NC_018606	TC	3	6	44932	44937	0 %	50 %	0 %	50 %	406025792
129	NC_018606	AT	3	6	45237	45242	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
130	NC_018606	TA	3	6	45374	45379	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
131	NC_018606	AT	3	6	46132	46137	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
132	NC_018606	AT	3	6	46372	46377	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
133	NC_018606	AT	3	6	46506	46511	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
134	NC_018606	AT	3	6	46528	46533	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
135	NC_018606	TA	3	6	46718	46723	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
136	NC_018606	AT	3	6	47464	47469	50 %	50 %	0 %	0 %	406025794
137	NC_018606	TA	3	6	47753	47758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_018606	AT	4	8	47905	47912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018606	TA	3	6	48077	48082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018606	TA	3	6	48108	48113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018606	TA	4	8	48162	48169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018606	AT	5	10	48171	48180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018606	TA	3	6	48186	48191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018606	TA	3	6	48204	48209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018606	TA	3	6	48211	48216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018606	AT	4	8	48343	48350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_018606	TA	3	6	48770	48775	50 %	50 %	0 %	0 %	406025795
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151	NC_018606	TA	3	6	49667	49672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018606	TA	5	10	50499	50508	50 %	50 %	0 %	0 %	406025798
153	NC_018606	AT	3	6	51576	51581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_018606	TA	3	6	53479	53484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018606	TA	3	6	53733	53738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018606	TA	3	6	54982	54987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.