MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	CA	3	6	1227	1232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018606	TA	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018606	TA	4	8	4717	4724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018606	AT	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018606	AC	3	6	5666	5671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018606	AT	3	6	5812	5817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018606	AG	3	6	5926	5931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018606	TA	3	6	5968	5973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018606	TA	3	6	7113	7118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018606	GT	3	6	7384	7389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018606	AT	5	10	11708	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018606	TA	3	6	23210	23215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018606	TA	4	8	25177	25184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018606	TA	4	8	25196	25203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018606	AT	3	6	25232	25237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018606	AT	3	6	25438	25443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018606	TA	3	6	28462	28467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018606	TA	5	10	31203	31212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018606	AT	4	8	31288	31295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018606	TA	5	10	31299	31308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018606	GT	3	6	31537	31542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018606	TA	3	6	31553	31558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018606	AT	3	6	31739	31744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018606	AT	4	8	31953	31960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018606	TA	3	6	32380	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018606	AT	3	6	35931	35936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018606	GA	3	6	36170	36175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018606	TA	3	6	36208	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018606	AC	3	6	38846	38851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018606	TA	3	6	38896	38901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018606	AT	4	8	40662	40669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018606	GT	3	6	41828	41833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018606	TA	4	8	43063	43070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018606	TA	3	6	47753	47758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018606	AT	4	8	47783	47790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018606	AT	4	8	47905	47912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018606	TA	3	6	48077	48082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018606	TA	3	6	48108	48113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018606	TA	4	8	48162	48169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018606	AT	5	10	48171	48180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018606	TA	3	6	48186	48191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018606	TA	3	6	48204	48209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018606	TA	3	6	48211	48216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018606	AT	4	8	48343	48350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018606	TA	3	6	48451	48456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018606	TA	3	6	49667	49672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018606	AT	3	6	51576	51581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018606	TA	3	6	53479	53484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018606	TA	3	6	53733	53738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018606	GA	3	6	53858	53863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018606	TA	3	6	54982	54987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.